Data Manager

**PRESENTATION DE L’EQUIPE**

L’équipe Exposome, Hérédité, Cancer et Santé du Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Population (CESP) de l’INSERM étudie comment les facteurs individuels qui constituent l’exposome (comportements de santé, mode de vie, expositions professionnelles et environnementales, caractéristiques biologiques) et le terrain génétique interagissent pour influencer la survenue et l’évolution de pathologies fréquentes (cancers, maladies cardio-métaboliques et neurodégénératives). Ce programme de recherche repose sur différentes bases de données (cohorte E3N-Générations, études cas témoins ) et plus récemment, sur la UK-Biobank.

La UK-Biobank est une cohorte biomédicale à grande échelle, régulièrement mise à jour, qui contient des informations génétiques et phénotypiques (exposome, maladies etc.) de 500 000 participants britanniques recrutés entre 2006 et 2010.

E3N est une cohorte de 98 995 femmes, nées entre 1925 et 1950, affiliées à la MGEN et activement suivies depuis 1990. En 2011, le projet a été lauréat du PIA avec pour objectif de créer une vaste cohorte familiale en élargissant aux membres de la famille des participantes d’origine : les enfants (génération G2) et petits-enfants (G3) des femmes E3N, ainsi que les pères de leurs enfants (G1), et en l’ouvrant à des thématiques hors cancer. A ce jour, la cohorte familiale E3N-Générations comprend déjà 139 000 participants sur trois générations. L’objectif à terme serait d’en inclure 200 000. A noter que le système d’information E3N-Générations comprend un système de gestion électronique de documents (GED), un système de lecture automatique de documents (LAD) pour l’acquisition et la gestion des données « papier », ainsi qu’une plateforme informatique web agrégeant des données de sources multiples, dont des questionnaires en ligne et des technologies numériques (smartphones, capteurs, objets et dispositifs médicaux connectés, etc.) et appariement avec de grandes bases de données médico-administratives. C’est au sein du Service technique de l’équipe (32 personnes), que le groupe Data Management (13 à 15 data-managers) gère cette grande base de données E3N-Générations et met des jeux de données à disposition des chercheurs.

**MISSION PRINCIPALE**

Notre équipe recherche un.e data manager qui participera à la préparation et à l’analyse des données de la cohorte UK-Biobank et à la gestion d’ensemble des bases de données relatives à l’étude de cohorte E3N-Générations, en travaillant en collaboration avec les chercheurs de l’équipe afin de mettre en place des projets de recherche.

**ACTIVITES PRINCIPALES**
- Participer aux expertises réalisées sur les données de la UK-Biobank et valider les différents phénotypes d’intérêt (différents cancers, diabète, maladie de Parkinson)
- Garantir la qualité des données selon les bonnes pratiques cliniques (BPC) de data management
- Assurer la traçabilité de toutes les interventions sur la base de données
- Assurer l’archivage des documents concernant les activités de data-management
- Tenir le dictionnaire de la base de données en documentant la construction des variables
- Rédiger et réviser les procédures de data-management (mises à jour, nettoyage )
- Effectuer les extractions des données pour les mettre à la disposition des chercheurs du CESP
- Participer à la préparation de la revue des données
- Assurer la maintenance et la mise à jour des bases de données créées
- Réaliser les statistiques descriptives des variables phénotypiques
- Elaborer des macros permettant d’automatiser les programmes d’analyses statistiques et les programmes de correction des données

**COMPETENCES**

Requises:

- Très bonne maitrise du logiciel R
- Savoir travailler sur environnement Unix, maitrise du langage de programmation Bash
- Maitrise des outils de statistiques descriptives et inférentielles
- Maitrise de l’anglais scientifique

Appréciées:

- Avoir déjà travaillé sur de grandes bases de données (sur la UK-Biobank serait un plus)
- Maitrise du logiciel Python
- Maitrise des logiciels statistiques (SAS base et SAS macro)

**QUALITES REQUISES**:

- Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire (biologique, génomique, informatique)
- Autonomie, organisation et rigueur méthodologique
- Esprit analytique et de synthèse, communication orale et écrite claire

**FORMATION/EXPERIENCE**

Bac +3 et plus
- Licence en traitement informatique de données scientifiques (ex : licence STID, santé publique)

Expérience en data management sur données de santé souhaitable.

**REMUNERATION ET CONTRAT**

CDD de 12 mois renouvelable.

Rémunération selon les grilles de salaire de l’INSERM.

Type d'emploi : Temps plein, CDD
Durée du contrat : 12 mois

Salaire : 2 457,44€ à 2 952,00€ par mois

Avantages:

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