Post-doctoral Position in Metagenomics of Symbiotic Communities of Hydrothermal Shrimp

il y a 6 jours


Plouzané, France Ifremer Temps plein

This project is also part of the LIFEDEEPER project ANR-22-POCE-0007.

**Main purposes**
- Study the functioning of symbiotic communities of juvenile hydrothermal shrimp from the Mid-Atlantic Ridge using metagenomic approaches

**Main Activities**
- Analysis of sequencing data: characterization of the functional repertoire of symbiotic communities, gene annotation, comparative analyzes (inter-life stages, inter-species) via Ifremer’s Datarmor supercomputer
- Ensure traceability and reproducibility of bioinformatics analyses.
- Presentation of results, writing of publications

**Relational fields**
- Internally: staff of the UMR Biology and Ecology of Deep Marine Ecosystems (BEEP)
- Externally: staff from the SEBIMER department of Ifremer
- Strong skills in bioinformatics analysis of (meta)genomic data (assembly, annotation of genes, design and implementation of scripts, pipelines, use of a computing cluster).
- Initial training: PhD in microbiology/molecular biology with advanced experience in microbial bioinformatics preferred, thesis obtained for a maximum of 3 years

**Competences**
- Knowledge of Python, Shell and R languages
- Best practices in bioinformatics
- Mastery of basic NGS analysis tools
- Fluency in written and spoken English.
- Knowledge of microbial symbioses appreciated
- Knowledge of microbial genomics appreciated
- Rank A publications

**Personale qualities**
- Aptitude for teamwork and interdisciplinary research
- Relational and communications qualities
- Autonomy (work organization)
- Scientific rigor and spirit of synthesis
- Writing skills

**Working conditions**
- 18 month contract
- Partial teleworking possible
- Anticipated start date**:May 5th, 2025**

Qui sommes nous ?

**The Institute**

A pioneer in ocean science, IFREMER's cutting-edge research is grounded in sustainable development and open science. Our vision is to advance science, expertise and innovation to:

- Protect and restore the ocean
- Sustainably use marine resources to benefit society
- Create and share ocean data, information & knowledge.

With more than 1,500 personnel spread along the French coastline in more than 20 sites, the Institute explores the 3 great oceans : the Indian, Atlantic and Pacific oceans. A leader in ocean science, IFREMER is managing the French Oceanographic Fleet and its dedicated scientists create ground-breaking technology to push the boundaries of ocean exploration and knowledge, from the abyss to the atmosphere-ocean interface.

Well-established in the international scientific community, our scientists, engineers and technicians are committed to advance knowledge about our planet's last unexplored frontiers. They provide the science we need for informed decision-making and public policy and they transfer this knowledge and technology to businesses to fulfill public and private needs. Core to our mission is also to strengthen public awareness about the importance of understanding the ocean and its resources, and empowering future generations of leaders through education and outreach national campaigns.


  • Post-doctoral Position

    il y a 1 semaine


    Plouzané, France Ifremer Temps plein

    Involved in several French and international projects, the CCEM unit has recognized expertise in the study of hydrophobic organic contaminants and related chemicals and has state-of-the-art instrumental and laboratory equipment for trace analyses. **Context** **Key activities and responsibilities** You will work in task 1.2 of the BIOcean5D project...


  • 29280 Plouzané, France Ifremer Temps plein

    The Physical Resources and Deep-Sea Ecosystem Department of Ifremer deals with questions related to deep ocean/lithosphere and ocean/climate interactions. It carries technological developments necessary for ocean observation and contributes to research into renewable marine energies. Its strengths in geosciences are grouped within UMR 6538 Geo-Ocean, a new...


  • Plouzané, France Ifremer Temps plein

    Ce projet fait également partie du projet LIFEDEEPER ANR-22-POCE-0007. **Missions principales** - Etudier le fonctionnement des communautés symbiotiques de juvéniles de crevettes hydrothermales de la Ride Médio-Atlantique par approches de métagénomique. **Activités principales** - Analyse des données de séquençage : caractérisation du...


  • Plouzané, France École nationale d'ingénieurs de Brest Temps plein

    The _Brest National Engineering School_ (ENIB), created more than 60 years ago, is affiliated to the French ministry in charge of higher education and research. It is located on the Brest-Iroise technology park. The teaching team is made up of around sixty professors and around forty people active in research. The total number of students is approximately...


  • Plouzané, France PowerToFly Temps plein

    Nous sommes ravis de vous présenter une nouvelle opportunité de rejoindre Stryker en tant qu’Ingénieur Web Back-End basé à Plouzané ! En tant qu’Ingénieur Web Back-End, vous aurez pour mission de concevoir, développer, tester, valider et déboguer des composants et applications web, de la preuve de concept au produit final. Vous participerez à...


  • Plouzané, France Institut Universitaire Européen de la Mer Temps plein

    Post-doctorat en océanographie physique F/HEmploi TypeCe travail sera réalisé dans le cadre du projet EvolPlage, (programme partenarial de recherche et innovation, associant les laboratoires Geo-Ocean (UBO), M2C (URN) et LHSV (ENPC), et le Cerema) portant sur le développement de nouveaux outils pour améliorer l’estimation de la réponse du trait de...


  • Plouzané, France Bretagne INP Temps plein

    **Contexte** Bretagne INP est un établissement-composante de l’EPE Université de Brest créé au 1er mars 2025. Il opère sous la forme juridique d’un EPSCP et développe des activités dans le domaine de l’’ingénierie et du management. Il regroupe en son sein l’École Supérieure d'Ingénieurs en Agroalimentaire de Bretagne atlantique (ESIAB),...


  • 29280 Plouzané, France Ifremer Temps plein

    Au sein de la Cellule médiation de la Direction de la communication, vous serez placé(e) sous la responsabilité de la Responsable de la Cellule médiation. Le/la chargé(e) de médiation scientifique et d’ingénierie pédagogique a pour mission la production et la mise en œuvre des actions éducatives du Programme Prioritaire de Recherche Lifedeeper...


  • Plouzané, France Labocéa Temps plein

    **Contexte**: Dans le cadre d’un arrêt maladie, un poste de Gestionnaire des approvisionnements et stocks est à pourvoir, en CDD à temps partiel (24h/sem), dès que possible pour une durée de 1 mois au minimum. Ce poste est ouvert en mobilité interne (FPT, CDI et CDD) et externe. **Description des principales missions du poste**: - _**1....

  • Aide soignant H/F

    il y a 2 semaines


    Plouzané, France VYV 3 bretagne Temps plein

    Le poste de Aide soignant H/F - Poste à pourvoir dès que possible au sein de la résidence Ty Braz à Plouarzel (29) - CDD 1 MOIS Minimum temps partiel 85% soit 128.92h/mois - CCN51 Titulaire du DEAS /AMP / AES, avec une expérience si possible auprès des personnes âgées, vous travaillerez dans une petite structure de 24 résidents. Vous rejoindrez une...