Bio) Informaticien

**Contexte**:
Le CHU de Rouen, ancré au cœur du Campus Santé Rouen Normandie, forme un pilier central dans le domaine de la santé régionale. Cet établissement assure une mission de soins, de recherche, d'enseignement et de prévention. La génétique est l’une des disciplines phares du CHU. Le laboratoire de génétique moléculaire réalise environ 3500 analyses par an en s’appuyant principalement sur des techniques de séquençage à haut-débit (NGS). Il a pour objectif de mettre à la disposition des services cliniques les examens les plus innovants et participe activement à la recherche au sein de l’unité Inserm UMR1245.

Au niveau national, le laboratoire est impliqué dans le développement du projet FrOG (French OncoGenetics database) ayant permis la création d’une base de données du même nom. Ce projet créé sous l’égide du Groupe Génétique et Cancer, est porté par un trio de biologistes : Laurent Castera du Centre Baclesse, Sandrine Caputo de l’Institut Curie et Stéphanie Baert-Desurmont, biologiste en oncogénétique dans notre laboratoire. Le projet consiste à centraliser dans une base de données, les variants génétiques identifiés chez les patients vus en consultation d’oncogénétique en France.

Dans la base FrOG, les variants sont collectés, expertisés par les biologistes puis classés selon leur niveau de pathogénicité. Le partage de données sécurisé permet d’harmoniser et d’optimiser la prise en charge des patients et de leur famille, dans le respect de la protection des données personnelles.

**Missions**:
Le/la (Bio)-informaticien(ne) sera pleinement intégré(e) à l’équipe des bio-informaticiens du laboratoire de génétique du CHU de Rouen, en collaboration avec les bio-informaticiens de l’institut Curie, du centre François Baclesse ainsi qu’avec les biologistes du consortium FrOG.

Le/la (Bio)-informaticien(ne):
sera en charge du développement back-end des nouvelles fonctionnalités de la database, notamment un module de curation/suivi de variants et un système dynamique d’expertise
participera à l’évolution du Système de Gestion de Bases de Données (SGBD) selon la volumétrie des données
assurera le développement d’une API publique sécurisée
gèrera la gestion système de l’infrastructure de la database FrOG, en lien avec Unicancer
assurera la documentation du code

**Compétences requises**:
Le/la (Bio)-informaticien(ne) sera pleinement intégré(e) à l’équipe des bio-informaticiens du labo
- ratoire de génétique du CHU de Rouen, en collaboration avec les bio-informaticiens de l’institut
Curie, du centre François Baclesse ainsi qu’avec les biologistes du consortium FrOG.
A plein temps pour le projet FrOG avec des possibilités de télétravail partiel, il/elle:

- sera en charge du développement back-end des nouvelles fonctionnalités de la database,

notamment un module de curation/suivi de variants et un système dynamique d’expertise
- participera à l’évolution du Système de Gestion de Bases de Données (SGBD) selon la volu
- métrie des données
- assurera le développement d’une API publique sécurisée
- gèrera la gestion système de l’infrastructure de la database FrOG, en lien avec Unicancer
- assurera la documentation du code

**Inscription à l'ordre obligatoire**:
Non

**Date de début**:
03/02/2025

**Date de fin**:
02/02/2026

**Rythme souhaité**:
Jour

**Localisation du poste**:
**Service + bâtiment**:
Génétique Moléculaire

**Pôle / Direction**:
MT001 - Pôle Biologie

**Niveau d'études min. requis**:
Niveau I (BAC +5 et +)

**Niveau d'expérience min. requis**:
Non renseigné

**Pièces jointes**: