Chercheur Postdoctoral en écologie Basée Sur L'adne Des Communautés Benthiques Des Grands Fonds Marins

Implantée sur deux sites (Montpellier et Sète), l'équipe du LEGPM dispose d’un accès à de nombreuses plateformes de biologie moléculaire dont un laboratoire d'ADNe, et le serveur de calcul Ifremer DATARMOR.

Rattaché(e) au Responsable de Laboratoire (LEGPM),vous travaillerez sous la responsabilité scientifique de Sophie Arnaud-Haond et sous la co-tutelle à distance de la responsable du projet Lifeedeeper (Marie-Anne Cambon, Brest), en collaboration avec un spécialiste en écologie des grands fonds (Lenaick Menot, Brest), sur la caractérisation des communautés des grands fonds à partir de données de métabarcoding (analyse bioinformatique et biostatistique).

Tâches principales

Les communautés benthiques des grands fonds marins et les facteurs environnementaux dans et autour des cheminées hydrothermales de la dorsale médio-atlantique ont été explorés par métabarcodage de l'ADN environnemental.

**Contexte**

La biodiversité des grands fonds marins habite plus de la moitié de la surface de la Terre et reste largement inconnue. De nouvelles approches moléculaires basées sur l'ADN environnemental peuvent améliorer notre exploration de ce vaste biome afin de mieux comprendre l'étendue de la biodiversité des grands fonds marins et la façon dont sa distribution est façonnée par les paramètres environnementaux et biogéographiques. Cette lacune est particulièrement importante à combler dans le contexte des pressions anthropiques croissantes sur les grands fonds, y compris les perspectives croissantes de leur exploitation minière.

Alors que la biodiversité liée aux sources hydrothermales actives a fait l'objet de nombreuses expéditions et études depuis environ un demi-siècle, la faune vivant surles sites inactifs et la faune benthique des zones abyssales environnantes sont encore largement méconnues et peuvent présenter des caractéristiques différentes nécessitant des mesures de conservation spécifiques et une évaluation d'impact dans le cadre de l'exploitation minière en eaux profondes.

**Objectifs du poste**

Vous travaillerez, dans ce contexte, sur les données produites par le projet Lifedeeper et collectées lors de la croisière BICOSE3 sur la dorsale médio-atlantique, en particulier à l'intérieur et à proximité des zones associées aux permis d'exploration minière, y compris les champs hydrothermaux actifs et inactifs et les environs abyssaux. Vous aurez pour mission de caractériser les communautés benthiques des grands fonds associées ou non à l'activité hydrothermale, sur la base de l'analyse bioinformatique et biostatistique des données de métabarcodage de l'ADNe à partir de 5 jeux d'amorces conçus pour couvrir à la fois la diversité microbienne (procaryote et protiste) et animale (i.e. animalia/métazoaire) avec des protocoles et des données de référence développés au cours du projet eDNAbyss. Les objectifs de l'étude sont i) de tester l'hypothèse d'une distribution différentielle des communautés de ces différentes lignées à l'intérieur et à la périphérie des champs hydrothermaux, ainsi qu'à l'intérieur et à l'extérieur de la dorsale, ii) d'identifier, le cas échéant, les lignées qui peuvent représenter une signature de l'activité hydrothermale ou de processus biogéochimiques spécifiqueset iii) d’interpréter les modèles d'association d'espèces au sein des assemblages caractérisés par des conditions biogéochimiques.

Principales activités
- Analyse bioinformatique du métabarcoding
- Analyses biostatistiques en écologie des communautés
- Rédaction d'articles scientifiques
- Doctorat en écologie des grands fonds marins et/ou en écologie des communautés, et avec une expérience préalable dans l'analyse de données de métabarcodes.
- Doctorat obtenu au cours des 3 dernières années.

Compétences techniques/ Parcours scientifique

Compétences techniques/métier

**Connaissances et compétences**
- Solide connaissance de l'écologie des communautés et de la biostatistique
- Expérience en analyse bio-informatique
- Une expérience antérieure en écologie benthique des grands fonds marins sera appréciée
- Sens de l'organisation.
- Anglais écrit et parlé

**Qualités personnelles**
- Compétences relationnelles
- Autonomie
- Sens du travail d'équipe

Comment postuler ?

Merci de joindre votre CV et votre lettre de motivation, en un seul document pdf.

Quels sont nos avantages ?
- Nous avons un accord de télétravail (demande possible après 6 mois d'ancienneté) et nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT et congés supra légaux.
- Nous consacrons un budget conséquent au développement des compétences, par des actions individuelles ou collectives.
- Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée des raisons d'être de l'institut (forfait mobilité durable...)

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