Chargé-e de Recherche en Sélection Animale Pour La Résilience

78350 JOUY-EN-JOSAS _

**RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE**

**Présentation d'INRAE**:
INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche rassemblant une communauté de 12 000 personnes, réparties dans 272 unités de recherche, de service et d'expérimentation implantées sur 18 centres sur toute la France.

Institut de recherche finalisée, il est le premier organisme de recherche mondial spécialisé sur l’ensemble « agriculture-alimentation-environnement ». INRAE a pour ambition d’être un acteur clé des transitions nécessaires pour répondre aux grands enjeux mondiaux.

Face à l’augmentation de la population et au défi de la sécurité alimentaire, au dérèglement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, l’institut a un rôle majeur pour construire des solutions et accompagner la nécessaire accélération des transitions agricoles, alimentaires et environnementales.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Vous intégrerez l'unité mixte de recherche INRAE/AgroParisTech Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI, 115 agents permanents), également membre de l'Université Paris-Saclay. Ses recherches visent à connaître et valoriser la diversité génétique des animaux d'élevage pour renforcer la résilience des systèmes d'élevage face aux défis environnementaux et sociétaux dans le cadre de la transition agro-écologique.

Vous développerez vos travaux au sein de l'équipe GUPPIE (Génétiques Utiles Pour des Poissons et Insectes en agro-Ecologie), qui mène des travaux sur l'amélioration génétique des populations d'animaux élevés en grands groupes et la sélection d'animaux génétiquement robustes et efficients dans des environnements variés.

Face au double défi que représentent le changement climatique et la nécessité d'une transition agroécologique rapide des élevages, l'équipe oriente ses recherches sur deux axes majeurs:
(1) la génétique de caractères complexes nouveaux en vue de leur intégration dans les programmes de sélection,
(2) le développement de modèles mathématiques pour concevoir des plans de sélection qui favorisent la transition agroécologique et la résilience des systèmes d'élevage.

Vous renforcerez les compétences en modélisation de l'unité et de l'équipe en lien avec la thématique « gestion des populations en sélection » de ce deuxième volet, pour répondre à l'enjeu majeur d'amélioration de la résilience des cheptels.

Le verrou scientifique que vous contribuerez à lever porte sur la conception de stratégies d'amélioration génétique innovantes visant à réduire la compétition et favoriser des comportements coopératifs entre animaux élevés en grands groupes, comme c'est le cas chez les espèces piscicoles et entomocoles. Vous développerez des approches mathématiques originales permettant la prise en compte d'interactions multiples dans l'évaluation de la résilience des cheptels. La pertinence de la modélisation de ces interactions sera évaluée par l'étude expérimentale et quantitative des comportements sociaux afin de mieux comprendre leurs effets favorables sur la résilience des élevages. Vous vous appuierez sur les réseaux de collaborations déjà établis par l'équipe avec des partenaires académiques en mathématiques, méthodologie de la sélection et en éthologie, et avec les partenaires professionnels des filières et vous développerez ces réseaux aux niveaux national et international.
Selon vos intérêts personnels et connaissances initiales, vous vous investirez sur un premier modèle (par exemple poisson) et mènerez à moyen terme des travaux sur l'autre modèle (par exemple insecte). La diversité des modèles animaux vous permettra de tester la généricité des stratégies proposées, et le cas échéant d'étudier les pistes de leurs évolutions. A plus long terme, des travaux plus génériques de modélisation pourront être conduits en considérant d'autres modèles animaux (volailles, petits ruminants) en collaboration avec les équipes travaillant sur ces espèces dans le département Génétique Animale.

L'objectif principal sera donc de proposer des stratégies de sélection qui favorisent la coopération entre les individus élevés en grands groupes. Des programmes de simulation de populations en sélection, faisant intervenir dans des modèles individu-centrés ou multi-agents les interactions entre individus, devront être développés. Pour évaluer l'intérêt opérationnel des stratégies proposées, vous pourrez travailler sur des populations commerciales pour quantifier les réponses à la sélection et les comparer aux réponses obtenues par les stratégies de sélection classiques. Dans un second temps, vous évaluerez la pertinence des stratégies développées à travers par exemple l'observation des comportements sociaux. Vous concevrez alors des plans d'expériences pertinents pour comprendre et évaluer les phénomènes biologiques sous-jacents et préciser ceux qui sont favorables à la performance et