Post Doctorant
il y a 2 jours
**Projet et missions principales**:
Analyse de données single-cell RNA-seq sur PBMC humains prélevés avant et après traitement bloquant les points de contrôle immunitaire (ICB):
- Détection de signatures transcriptomiques circulantes associées à la survenue d’effets indésirables immuno-induits (irAE) ;
- Analyse longitudinale de la dynamique des populations immunitaires sous traitement ;
- Identification et caractérisation des sous-types cellulaires (lymphocytes T CD4/CD8, cellules NK, B, myéloïdes) impliqués dans la réponse ou la toxicité.
Cartographie ciblée d’eQTL à partir des données single-cell RNA-seq:
- Intégration des génotypes germinaux avec l’expression génique à l’échelle monocellulaire pour détecter des loci de régulation dans des sous-populations immunitaires spécifiques ;
- Analyse des associations entre eQTL et phénotypes cliniques, en particulier la réponse au traitement et la survenue d’irAE ;
Évaluation de la susceptibilité génétique aux toxicités inflammatoires induites par des immunothérapies innovantes (ex. T cell engagers, TCE):
- Exploitation de données génomiques issues de biopsies liquides (cfDNA), après imputation ;
- Calcul de scores polygéniques (PGS) liés à la régulation des cytokines, à la signalisation inflammatoire et à la fonction immunitaire ;
- Modélisation statistique (analyses multivariées) des associations entre ces scores et les toxicités cliniques (ex. syndrome de relargage des cytokines [CRS], neurotoxicité).
**Connaissances et compétences professionnelles**:
- Expérience démontrée dans l’analyse de données single-cell RNA-seq, en particulier appliquées à des échantillons humains ;
- Maîtrise des langages de programmation usuels en bioinformatique (R, Python, Bash) et de l’utilisation d’environnements HPC (gestion de jobs avec SLURM, environnements conda, conteneurs Singularity) ;
- Connaissance des principaux outils et pipelines d’analyse single-cell : CellRanger, STAR, Seurat, Scanpy ;
- Expérience dans l’analyse de données génétiques humaines (eQTL, génotypage, association génotype/phénotype) ou intérêt fort pour acquérir ces compétences ;
**Compétences interpersonnelles**:
- Capacité à évoluer dans un environnement de recherche translationnelle, en interaction avec des cliniciens et biologistes ;
- Autonomie, rigueur, et esprit critique dans la conduite de projets scientifiques complexes ;
- Aisance dans la présentation et la mise en forme des résultats (rapports, figures, présentations)
- Goût pour le travail en équipe et la communication scientifique (orale et écrite, en anglais et en français).
- Expériences en publications et présentations internationales.
**Profil**:
- Doctorat (PhD) en bioinformatique, biostatistique, génomique ou domaine connexe, avec une spécialisation ou une expérience significative en analyse de données transcriptomiques en single-cell RNA-seq ;
- Expérience postdoctorale préalable non requise.
**Notre offre**:
CDD Post-doctorat pour une durée de 12 mois, à pourvoir si possible dès OCTOBRE 2025.
**Localisation du poste**:
**Lieu**:
Villejuif
**Niveau d'études min. requis**:
5- Doctorat
**Niveau d'expérience min. requis**:
2-5 ans
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Post-doctorant (H/F)
il y a 1 semaine
Villejuif, France Gustave Roussy Temps pleinNous recherchons un Post-Doctorant très motivé pour rejoindre l'équipe de Madame Sophie Postel-Vinay à Gustave Roussy, pour travailler sur un projet passionnant étudiant les défauts de remodelage de la chromatine dans le cancer, sélectionné pour un financement par le Conseil européen de la recherche (ERC). Le but du projet est d'étudier les...
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Post-Doctorant(e) H/F
il y a 7 jours
Villejuif, Île-de-France Gustave Roussy Temps pleinInformations générales Entité de rattachement L'espoir de guérir le cancer a un nom, Gustave Roussy.Premier centre européen de lutte contre le cancer et classé au troisième rang mondial des hôpitaux en cancérologie, Gustave Roussy est un institut de soins, de recherche et d'enseignement, qui prend en charge des patients atteints de tout type de...
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Post-doctorant(E) (H/F)
il y a 2 jours
Villejuif, France Gustave Roussy Temps pleinEn collaboration avec CentraleSupélec, l'INSERM et Unicancer, Gustave Roussy a cofondé l'IHU PRISM, le Centre national français pour la médecine de précision en oncologie, dédié à la personnalisation des traitements contre le cancer basée sur les données. Dans le cadre de cette initiative, le projet ARCANE est un programme phare visant à créer...
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Villejuif, France EFREI - Grande école du numérique Temps plein2 days ago Be among the first 25 applicants This range is provided by EFREI - Grande école du numérique. Your actual pay will be based on your skills and experience — talk with your recruiter to learn more. Base pay range À propos de nous Grande École du Numérique créée en 1936, l’Efrei est un acteur indépendant majeur de l’enseignement...
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Post Doctorant-1 C1
il y a 5 jours
Villejuif, France Gustave Roussy Temps pleinL’unité U981 « Biomarqueurs moléculaires prédictifs en thérapeutique anticancéreuse » est dirigée par le Dr Fabrice André. Le postdoctorant travaillera dans l’équipe du Dr Françoise Farace sur la thématique « Cellules Tumorales Circulantes » qui dirige aussi la plateforme Cellules Circulantes Rares de l’Institut Gustave...
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stage – chargé de communication et stratégie de marque
il y a 1 semaine
Villejuif, Île-de-France EFREI Temps pleinDESCRIPTION DU POSTEGrande École du Numérique créée en 1936, l'Efrei est un acteur indépendant majeur de l'enseignement supérieur et de la transformation numérique. Installée à Paris ainsi qu'à Bordeaux, l'Efrei forme 5 700 étudiants dans son programme Grande École d'ingénieurs et dans ses Programmes Experts du numérique (bachelors,...
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Biostatisticien(ne) H/F
il y a 5 jours
Villejuif, Île-de-France Gustave Roussy Temps pleinInformations générales Entité de rattachement L'espoir de guérir le cancer a un nom, Gustave Roussy.Premier centre européen de lutte contre le cancer et classé au troisième rang mondial des hôpitaux en cancérologie, Gustave Roussy est un institut de soins, de recherche et d'enseignement, qui prend en charge des patients atteints de tout type de...
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Cadre Responsable de La Plateforme Cellules
il y a 5 jours
Villejuif, France Gustave Roussy Temps pleinSous la responsabilité de la directrice d’unité AMMICa, vos principales missions consisteront à: - Développer les axes de recherche définis par la Direction de la Recherche Gustave Roussy - Faire des demandes de financement (préparer des demandes de subvention pour obtenir des fonds publics ou privés) - Développer des outils de caractérisation...
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Responsable de La Plateforme Cellules Circulantes Rares
il y a 2 semaines
Villejuif, France Gustave Roussy Temps plein**Pourquoi nous rejoindre ?** Impact direct sur la médecine de demain : Vos travaux permettront de transformer la recherche clinique et d’accélérer l’accès à des thérapies innovantes pour les patients. Leadership scientifique : Dirigez une équipe multidisciplinaire dans un environnement stimulant et collaboratif, en étroite relation avec des...
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Responsable de La Plateforme Cellules Circulantes Rares
il y a 5 jours
Villejuif, France Gustave Roussy Temps pleinGustave Roussy, premier centre européen en cancérologique recherche: **Responsable de la Plateforme Cellules Circulantes Rares** Pourquoi nous rejoindre ? - Impact direct sur la médecine de demain : Vos travaux permettront de transformer la recherche clinique et d’accélérer l’accès à des thérapies innovantes pour les patients. - Leadership...
