Stagiaire Bioinformatique
il y a 1 semaine
STAGE 6 MOIS
Bioinformatique (F/M/D)
Aptitudes attendues (cochez):
Ecoute Capacité à travailler en équipe Autonomie Créativité
Expression orale Capacité d’analyse
Il existe différentes approches ayant pour but de prédire, à partir d’un génome, les déterminants de la résistance aux antibiotiques : Les approches d’alignement de séquences qui exploitent des bases de données de références couplés à un ensemble de règles [1,2] ; et les approches de novo qui utilisent des prédictions de machine learning [3] ou de GWAS [4] à l’échelle d’un pangénome. Les objectifs de ce projet sont multiples:
1. Comparer et évaluer les différentes sources de données expérimentales.
2. Comparer et évaluer les différentes méthodes de prédictions.
3. Inclure dans ces comparaisons l’effet des familles d’antibiotiques, de leurs mécanismes d’actions, ainsi que celui des espèces bactériennes étudiées.
Le contenu et la durée du stage sont adaptables en fonction du profil de l’étudiant-e
