Offre Stage Niveau M2 en Microbiologie

Le département Microbiologie Laitière d’ACTALIA, basé à La Roche Sur Foron (74), recherche un(e) stagiaire en microbiologie. Le département Microbiologie Laitière propose aux acteurs de la filière laitière son expertise et des méthodes analytiques de pointe pour identifier, caractériser, conserver, comprendre et maîtriser la biodiversité des écosystèmes microbiens laitiers jouant des rôles majeurs dans l’industrie laitière en général. Cela inclut les flores d’intérêt et également les flores indésirables dont les pathogènes. Les méthodes développées et utilisées par le département passent par l’emploi d’outils de microbiologie classique et de biologie moléculaire (dont méthodes en lien avec du séquençage NGS). Elles sont mises en œuvre sous certification qualité ISO9001 :2015. Le département est composé de 3 chef(fe)s de projets, 4 ingénieur(e)s, 4 technicien(ne)s et ponctuellement de stagiaires ou alternants.

Dans le cadre d’un projet de Recherche d’envergure, ACTALIA et son partenaire l’Enilv sont à la recherche d’un(e) stagiaire pour une durée d’environ 6 mois. L’ENILV est un établissement public agricole constitué de 3 centres d’activité dont les ateliers technologiques. Le laboratoire d’autocontrôles dépend de ce dernier centre. Ce laboratoire propose des analyses d’hygiène alimentaire et produit des ferments concentrés congelés pour l’industrie fromagère.

Le stage sera décomposé en 2 parties:

- Un déroulé dans les locaux d’ACTALIA - La Roche Sur Foron pour la partie analytique (environ 4 mois)
- Un déroulé dans les locaux de l’Enilv - La Roche Sur Foron pour la partie production de ferments et contrôles (environ 2 mois)

**Contrat **:stage

**Durée**: 6 mois

**Date de début de contrat**: dans l’idéal, début mars

**Localisation**: La Roche Sur Foron (Haute Savoie). ACTALIA et ENILV sont voisins. Des possibilités d’hébergement existent à l’Enilv.

**Missions**:
Le stage s’inscrit dans un projet plus global de recherche d’intérêt général dont les objectifs sont (i) la mise en place et le déploiement d’outils d’analyses transcriptomiques pour le criblage large et rapide de collections de microorganismes en lien avec diverses activités métaboliques (production d’arôme, protéolyse,), (ii) la production des souches sélectionnées et (iii) la réalisation des essais de ces souches sur le terrain en atelier de transformation fromagère et (iv) la distribution commerciale des souches.

En plus de participer à la vie courante du laboratoire, le/la stagiaire aura comme objectifs spécifiques:

- La mise au point des comparaisons des souches microbiennes dans des fromages expérimentaux : Les fromages seront reconstitués à partir de caillés lyophilisés produits par les partenaires du projet (Enilv et ACTALIA) et selon un protocole déjà établi. L’objectif ici est de valider les conditions d’inoculation de différentes souches microbiennes d’intérêt dans des fromages modèles expérimentaux (flore d’affinage inclure _Brevibacterium spp._, _Corynebacterium spp_., _Staphylococcus spp_., _Glutamicibacter spp._, _Lactobacillus spp_., _Kluyveromyces spp_., _Candida spp_.,) et de valider l’implantation de ces souches.
- La finalisation de la mise au point et la réalisation de RT-qPCR sur les fromages expérimentaux : L’objectif est d’évaluer et comparer entre souches le niveau d’expression de gènes impliqués dans des voies métaboliques d’intérêt par les outils de RT-qPCR mis au point. Cette étape permettra de sélectionner des souches d’intérêt pour la filière laitière concernée.
- La production des souches sélectionnées en fermenteurs (locaux de l’Enilv avec l’appui des équipes) et les contrôles de production associés.

**Profil recherché**:
Bac + 5 (Master ou école d’ingénieur) en microbiologie ou biologie moléculaire

Expérience indispensable en microbiologie et biologie moléculaire.

Qualités indispensables recherchées:

- Sens de la communication
- Travail en collaboration
- Sens de l’organisation
- Rigueur

**Candidature**

Envoyer CV et lettre de motivation avant le 22/11/2024.

Type d'emploi : Stage
Durée du contrat : 6 mois

Horaires:

- Du lundi au vendredi
- Travail en journée

Lieu du poste : En présentiel

Date de début prévue : 03/03/2025