Chargé de Recherche

il y a 3 jours


Paris, France Museum national d’Histoire naturelle Temps plein

20-07-2025

**Chargé de recherche - Initiative IA PLANETOID (F/H)**:

- Date limite
- 20-07-2025
- Date de publication
- 18-06-2025
- Contrat
- Contrat de projet
- Catégorie
- Direction / Service
- UMR 7196 STRUCTURE ET INSTABILITÉ DES GÉNOMES (STRING)
- Localisation
- 75 - Paris - Tous sites

**Contexte du recrutement et définition de poste**:
Dans le cadre du projet interdisciplinaire PLANETOID, porté par Sorbonne Université et le MNHN, financé dans l’initiative nationale des pôles IA (SCAI+), le Muséum national d’Histoire naturelle recrute un.e chargé.e de recherche pour organiser, structurer et harmoniser les données génomiques et métagénomiques nécessaires au développement des modèles d’annotation automatique de génomes.

**Description du projet**:
Ce travail est au cœur de l’ambition de PLANETOID : produire une annotation à large échelle et de haute qualité de la diversité génomique du vivant.

**Description des missions et objectifs à atteindre**:
En interaction avec les équipes scientifiques et techniques des laboratoires partenaires, le ou la titulaire du poste assurera:

- la collecte, l’organisation et le formatage de jeux de données génomiques et métagénomiques (assemblages, annotations, métadonnées) ;
- la structuration des bases de données internes au projet pour les jeux d'entraînement, validation et test des modèles d’IA ;
- la mise en place de benchmarks rigoureux pour évaluer la performance des modèles développés dans PLANETOID ;
- la documentation des jeux de données (traçabilité, standards FAIR) ;
- la coordination avec les plateformes de production de données, notamment la station biologique de Roscoff ;
- en lien avec les spécialistes IA du projet, la préparation des données d’entrée adaptées aux modèles d’apprentissage.

**Profil recherché**:
**Qualifications requises**
- Diplôme de niveau master ou doctorat en bioinformatique ou biologie computationnelle
- Compétences théoriques et pratiques solides en deep learning
- Excellente maîtrise des environnements de calcul nécessaire à la mise en œuvre des modèles de deep learning
- Très bonne maîtrise des outils de gestion de données, de versioning
- Bonne connaissance des formats standards (GFF, FASTA/Q, etc.) et des systèmes de gestion de données
- Connaissance des grands référentiels d’annotations (Ensembl, NCBI, UniProt, Interpro, etc.)
- Bonnes capacités organisationnelles, rédactionnelles et relationnelles
- Mobilité (déplacements réguliers à Roscoff et dans les laboratoires partenaires)

**Information(s) complémentaire(s)**:
Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.

**Le contrat**

Localisation : Jardin des plantes

Contrat : Contrat de projet de deux ans

Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels.

**Les avantages**

Remboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)

Télétravail possible jusqu’à deux jours par semaine après 4 mois d'ancienneté

Restaurant d'entreprise

Prise en charge partielle de votre mutuelle

Un comité social et une association sportive et culturelle

Accès illimité aux sites de l’établissement avec invités


  • Chargé de Recherche

    il y a 3 jours


    Paris, France Bibliotheque nationale de France Temps plein

    **Référence du poste **:3681 - **Sites **:François-Mitterrand Quai François-Mauriac Cedex 13 75706 Paris - **Catégorie **:A - **Groupe RIFSEEP **:2 - **Corps **:Contractuel; Chargé d'études documentaires - **Famille **:Médiation culturelle communication - **Emploi de référence**: Chargé d'évènement et de logistique culturels - **Spécialité...

  • Chargé de Recherche

    il y a 7 jours


    Paris, France Bibliotheque nationale de France Temps plein

    **Référence du poste **:3681 - **Sites **:François-Mitterrand Quai François-Mauriac Cedex 13 75706 Paris - **Catégorie **:A - **Groupe emploi **:3 - **Famille **:Médiation culturelle communication - **Emploi de référence**: Chargé d'évènement et de logistique culturels - **Spécialité professionnelle **:Exposition - **Durée du contrat **:3 ans -...

  • Chargé de recherche

    il y a 2 semaines


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    il y a 2 semaines


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    il y a 2 semaines


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