These de Doctorat en Sciences Animales

63122 ST GENES CHAMPANELLE _

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**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

VetAgro Sup est un établissement d'enseignement supérieur et de recherche (ESR) placé sous la tutelle du ministère français de l'Agriculture et de la Souveraineté alimentaire. C’est la seule structure française à former à la fois des vétérinaires, des ingénieurs agronomes et des inspecteurs de santé publique vétérinaire dans une approche globale des questions de santé. Au cœur des enjeux du vivant, l’établissement développe ses activités de formation, de recherche et d’expertise sur ses deux campus dans une approche One Health, à l’interface des santés humaine, animale et environnementale.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Vous exercerez votre activité au sein de l'Unité Mixte (INRAE/VetAgro Sup) de Recherche sur les Herbivores qui conduit des recherches sur l’efficience des animaux et des systèmes d’élevage, les qualités sensorielles et nutritionnelles des produits animaux, la capacité adaptative et la robustesse des animaux et des troupeaux, le bien-être animal, les impacts environnementaux et les services dus à l’élevage. L'UMR Herbivores regroupe 121 agents permanents, dont 74 chercheurs et ingénieurs, et accueille chaque année une soixantaine de non-permanents (dont une vingtaine de doctorants et post-doctorants). Elle est organisée en 5 équipes de recherche, une équipe d'appui et une équipe de direction. Vous travaillerez au sein de l'équipe PERAQ (Pratiques d’Elevage, Robustesse et Qualité des Produits Animaux).

La transition agroécologique des systèmes d’élevage suppose de les considérer comme des systèmes ouverts sur leur environnement et devant s’adapter aux fluctuations de celui-ci. Dans ce contexte, la résilience, ou capacité à faire face aux perturbations, est une propriété à mobiliser pour accompagner cette transition. Le projet de thèse questionne cette aptitude au niveau du troupeau et cherche à:
1/ tester l’intérêt de la diversité intra-troupeau sur la robustesse du troupeau, i.e, sa capacité à absorber les chocs,

L’étude sera menée sur des troupeaux bovins laitiers. La stratégie scientifique portera d’une part, sur l’analyse de données issues du contrôle laitier (caractérisation de la diversité intra-troupeau et quantification de la robustesse de leurs performances) et d’autre part, sur une démarche d’enquêtes en élevage visant à identifier les pratiques d’intérêt pour le pilotage de la résilience à l’échelle du troupeau. Une approche de modélisation sera également réalisée en collaboration avec L. Barreto-Mendes et l'unité Mosar afin de quantifier la résilience des troupeaux de vaches laitières à différents régimes de perturbations, en fonction de leur composition, de leur conduite et des pratiques mises en œuvre par les éleveurs en réponse à des perturbations.

Vous serez plus particulièrement en charge de:

- Construire, à partir des données issues du contrôle laitier, la base de données qui permettra d’étudier la relation entre diversité intra-troupeau et robustesse des performances ;
- Caractériser, à partir d’une revue de la littérature et de dires d’experts, la diversité intra-troupeau et les critères de robustesse à l’échelle du troupeau ;
- Identifier des groupes de troupeaux ayant des profils de diversité-robustesse contrastés et caractériser ceux pour lesquels la relation est présente ou absente ;
- Analyser, au travers d’enquêtes en exploitation, les pratiques d'élevage qui renforcent la capacité des troupeaux à faire face aux perturbations et étudier leur spécificité selon les groupes de diversité-robustesse précédemment identifiés.

**2 sites de travail**:
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- INRAE - Site de Theix - 63122 ST GENES CHAMPANELLE**

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- VETAGRO SUP - 89 Av. de l'Europe - 63370 LEMPDES**

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**Formations et compétences recherchées**:
**Master/Ingénieur (Bac+5)**
- Formation recommandée : Master/Ingénieur (Bac+5) ou équivalent, avec une base en Sciences Animales
- Connaissances et compétence souhaitées : Elevage bovin laitier, modélisation statistique, démarche d'enquêtes ;
- Aptitudes recherchées : Intérêt pour la recherche, autonomie, curiosité, organisation, rigueur,