Bio-informaticien.ne (F/H)

**À propos de nous**:
Et si vous contribuiez au rayonnement d’une université classée dans le top10 des universités françaises ?

L’Université de Lorraine forme plus de 62 000 étudiants implantés sur des campus répartis sur 2 métropoles ainsi que 10 villes et agglomérations de son territoire. 7 000 personnels œuvrent à la réussite de ses missions dont 4000 personnels d’enseignement et de recherche, au sein de 60 unités de recherche structurées et reconnues, fonctionnant au travers d’un partenariat fort avec les grands organismes de recherche (CNRS, Inserm, INRAE, Inria).

L’Université de Lorraine place ainsi toute son énergie au service de la production et du partage des connaissances en s’appuyant sur une dynamique de recherche intensive, aussi bien fondamentale qu’appliquée.

En phase, avec les enjeux et défis sociétaux, l’université accompagne chacun dans la réalisation de ses projets. Riche de la diversité de ses métiers et de ses parcours professionnels, l’Université de Lorraine vous offrira des possibilités de développement professionnel tout en veillant à votre qualité de vie au travail.

Au sein de l’Université de Lorraine nous partageons ensemble des valeurs communes que sont la Responsabilité, l’Universalité, la Créativité, la Réflexivité et la Solidarité, que nous plaçons sous une bannière commune : « faire dialoguer les savoirs, c’est innover ».

**Mission**:
Nous recherchons **un.e**bio-informaticien.ne** d'une plateforme scienfitique** pour le service mutualisé de plateformes **IBSLor**(Ingénierie, Biologie, Santé en Lorraine). Elle regroupe six plateformes de haut niveau technologique : Biophysique & biologie structurale, imagerie, cytométrie, protéomique, épitranscriptomique & séquençage, et génomique fonctionnelle. Ce regroupement favorise la mutualisation en mettant en commun et à disposition des structures opérationnelles de recherche, des équipements lourds structurants, et le développement de projets transversaux en apportant un soutien technologique et/ou technique.

**La plateforme Epitranscriptomique & Séquençage** (EpiRNA-Seq), fait partie des 6 plateformes technologiques de la SMP IBSLor. Elle a pour mission d’assurer le soutien technologique aux projets qui nécessitent ces technologies de pointe. La plateforme est équipée d’un ensemble de matériels pour l’analyse et le séquençage à haut-débit des ADN/ ARN.

Vous serez rattaché.e à la plateforme Epitranscriptomique & Séquençage (EpiRNA-Seq), spécialisée dans l’identification et la quantification des nucléotides modifiés au sein des ARN (épitranscriptomique).

Vos missions:
**DÉVELOPPER DES LOGICIELS D'ANALYSE BIO-INFORMATIQUE**:

- Développer des pipelines dédiés à l'analyse des données générées au sein de la plateforme, données issues du séquençage à haut-débit sur Illumina et Nanopore (Epitranscriptomique)
- Concevoir et optimiser de nouvelles méthodes d’analyse des nucléotides modifiés.
- Adapter et optimiser le fonctionnement des méthodes de travail dans l'analyse épitranscriptomique ou transcriptomique.
- Paramétrer des outils, logiciels, systèmes
- Contribuer au développement et à la maintenance des pipelines d'analyse.

**TRAITER ET ANALYSER DES DONNÉES BIOLOGIQUES**:

- Fournir des conseils et un soutien lors des réunions hebdomadaires de la plateforme
- Effectuer en routine une analyse primaire et secondaire (et éventuellement tertiaire) de données haut débit (NGS) (de la conception expérimentale au rapport final de l'analyse bio-informatique).
- Diffuser et valoriser les résultats et les développements sous forme de rapports, de publications, de présentations orales, et de formations.
- Assurer et organiser une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

CDD du 24 février 2025 au 28 février 2026.

Possibilité de télétravail.

**Profil**:
Vous êtes titulaire d'un diplôme de niveau Bac +2 en biologie/informatique.

Vous maitrisez les programmations dans les différents environnements informatiques (bash et R, éventuellement python).

Vous êtes en capacité d'effectuer une analyse des données biologiques en relation avec les propriétés moléculaires et cellulaires.

Vous êtes à l'aise avec l'utilisation de logiciels spécifiques à l'activité (trimmomatic, bowtie2, R-Studio).

Vous maitrisez l'anglais (niveau B1 à B2).

Vous êtes apprécié.e pour vos qualités relationnelles.

Vous savez faire preuve d'organisation, de rigueur, gérer les priorités.