These : Empreinte de La Pression Chimique Toxique Sur L’évolution Actuelle Des Communautés D’invertébrés Des Cours D’eau Nationaux

69100 VILLEURBANNE _

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**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Problématique et objectif du projet de thèse à mener
Mots-clefs : macroinvertébrés aquatiques, patrons de diversité, macroécologie, écotoxicologie in situ, contamination chimique, biosurveillance.
La pression chimique toxique est pointée comme une des causes majeures, mais mal décrite, de l’érosion de la biodiversité aquatique en cours et comme un frein aux effets positifs de la restauration des habitats sur celle-ci [1,2]. Ciblant les invertébrés, groupe emblématique de cette crise, cette thèse vise à objectiver les liens entre exposition à la contamination chimique et structuration des communautés d’espèces dans les cours d’eau. Ces communautés étant suivies depuis 20 ans dans les réseaux de surveillance nationaux, la thèse exploitera une opportunité nouvelle : l’accès à des données d’indicateurs d’écotoxicologie in situ (gammares encagés) collectés de façon répétée sur plusieurs centaines de stations depuis 5 ans. Ces indicateurs quantifient l’exposition à différentes substances ou la toxicité globale du cocktail environnemental [3,4]. L’ambition de la thèse est de tester comment la mise en regard des suivis taxonomiques des réseaux de surveillance avec les indicateurs d’écotoxicologie in situ (disponibles aujourd’hui à ces mêmes échelles spatiales) peut permettre de caractériser des effets spécifiques de la contamination chimique sur les patrons de la diversité des macroinvertébrés des cours d’eau nationaux.
Prolongeant de premières études « preuve de concept » [5,6,7,8], cette thèse mobilisera des jeux de données conséquents comme supports de modélisations statistiques qui interrogeront à différentes échelles spatiales (nationale, hydroécorégions, bassins versants), pour différents types de pressions chimiques (agricoles, industrielles, urbaines, géochimiques), dans différents contextes (réchauffement, trophique, diversité d’habitats ), l’effet du niveau d’exposition sur des métriques d’état et d’évolution de la diversité des stations (richesse, abondances, % d'espèces sensibles, exotiques ). La thèse qualifiera les patrons (beta-diversité) et processus (remplacement d’espèces, homogénéisation/différenciation ) jouant à large échelle (ex : bassins hydrographiques) en lien avec ces gradients d’exposition. Ce regard porté à différentes échelles spatio-temporelles au niveau national permettra de réinterpréter les changements temporels majeurs observés localement et encore inexpliqués sur différentes stations observatoires dans l’hydrosystème rhodanien (programme RhonEco [9]). En complément de cette étude sur les changements taxonomiques, la thèse analysera les changements de diversité fonctionnelle (approche de traits) afin d’appréhender la vulnérabilité fonctionnelle des communautés exposées à la contamination chimique dans le contexte des changements environnementaux en cours.
REFERENCES : [1] doi.org/10.1111/gcb.16689; [2] doi.org/10.1038/s41586-023-06400-1; [3] doi.org/10.14758/SET-REVUE.2021.4.15;
[4] doi.org/10.14758/SET-REVUE.2021.4.16; [5] doi.org/10.1021/acs.est.9b01271; [6] doi.org/10.1016/j.envpol.2022.119565; [7] doi.org/10.1016/j.watres.2021.117546; [8] doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.178328; [9] hal.science/hal-04680015v1;

Encadrement : Arnaud Chaumot (Ecotox) & David Eme (EcoFlows)
Cette thèse financée à 50% par le département INRAE AQUA est au cœur d’un axe structurant pour l’unité RiverLy qui vise à interfacer les travaux menés au sein des équipes en écotoxicologie (écotox) et en écologie (ecoflows). Dans ce contexte, elle intègrera aussi la dynamique plus large engagée entre équipes lyonnaises (notamment UMR LEHNA) dans le cadre du projet RhonEco (2024-2028) qui co-finance la thèse à 50%, projet qui porte le suivi scientifique du programme de restauration écologique du fleuve Rhône depuis 30 ans [9].

**Formations et compétences recherchées**:
**Master/Ingénieur (Bac+5)**

Formation recommandée : Master 2 (ou équivalent) en écologie ou biostatistiques
Connaissances souhaitées : Méthodes d’analyse de données, modélisation en écologie, biologie et écologie des communautés
Expérience appréciée (mais non-pré-requise): stage/expertise en hydrobiologie, analyse de patrons de diversité, approches statistiques pour modélisation des relations écologie/e