Représentation Gros Grain Des Phénomènes D’association Moléculaire. Application à Des Phases Homogènes Et Des Problématiques D’adsorption

il y a 2 semaines

ClermontFerrand, France Université Clermont Auvergne - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand Temps plein

**Représentation gros grain des phénomènes d’association moléculaire. Application à des phases homogènes et des problématiques d’adsorption.**:

- Réf **ABG-133487**
- Sujet de Thèse
- 19/09/2025
- Contrat doctoral
- Université Clermont Auvergne - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand
- Lieu de travail- Clermont-Ferrand - Auvergne-Rhône-Alpes - France
- Intitulé du sujet- Représentation gros grain des phénomènes d’association moléculaire. Application à des phases homogènes et des problématiques d’adsorption.
- Champs scientifiques- Chimie
- Numérique
- Physique

**Description du sujet**:
Étant très exigeantes en ressources de calcul, les simulations moléculaires sont limitées à des systèmes de petite taille (quelques centaines d’Angström) et sur des durées courtes (quelques centaines de nanosecondes). Pour contourner ces limitations, il est possible d’utiliser des modèles à gros grains, où un grain représente plusieurs atomes voire plusieurs molécules. Cela implique cependant de disposer d’un modèle réaliste et efficace d’interaction entre grains. Une méthode de paramétrisation des modèles gros grains a été développée au laboratoire [1] et permet de considérer les interactions et les spécificités chimiques de l’échelle moléculaire.

[1] Dequidt, A., & Solano Canchaya, J. G. (2015). Bayesian parametrization of coarse-grain dissipative dynamics models. The Journal of Chemical Physics, 143(8).
[3] Jin, J., Han, Y., Pak, A. J., & Voth, G. A. (2021). A new one-site coarse-grained model for water: Bottom-up many-body projected water (BUMPer). I. General theory and model. The Journal of Chemical Physics, 154(4).
[4] Wei, S., & Knotts, T. A. (2013). A coarse grain model for protein-surface interactions. The Journal of Chemical Physics, 139(9).
[5] Marrink, J. S., de Vries, A. H., Mark, A. E. (2004). Coarse Grained Model for semiquantitative lipid simulations. l. The Journal of Physical Chemistry B, 108(750).
[6] Seo, S., & Shinoda, W. (2019). SPICA Force Field for Lipid Membranes : Domain formation induced by cholesterol. The Journal of Chemical Theory and Computation, 15(762).

**Prise de fonction**:

- 19/09/2025

**Nature du financement**:

- Contrat doctoral

**Précisions sur le financement**:
**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- Université Clermont Auvergne - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand

La thèse se déroulera à l’Institut de Chimie de Clermont-Ferrand, dans le cadre du laboratoire commun SimatLab, dont les tutelles sont l’Uuniversité Clermont Auvergne, le CHU, le CNRS et Michelin.

Candidat(e) avec une connaissance des interactions moléculaires et une expérience en simulation moléculaire.

Des compétences en programmation sont nécessaires et un minimum d'aisance avec les maths (calculs).

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