Stage M2

**Description de l'offre**:
1. Contexte

(i) Caractériser la dynamique spatio-temporelle de la biodiversité en analysant les séries temporelles d'images satellitaires multi-capteurs.
(ii) Cartographier les changements et produire des indicateurs pour rendre compte de l'impact des changements globaux sur la dynamique spatio-temporelle de l'état de la biodiversité côtière.
Pour un suivi régulier, il est prévu de se baser principalement sur des moyens de télédétection optique satellite par imagerie multispectrale, notamment avec les constellations Sentinel ainsi que les missions hyperspectrales plus récemment opérationnelles (EnMAP et PRISMA). Le traitement de ces images sera enrichi par l'intégration d'observations in situ accessibles via des réseaux de surveillance, des bases de données nationales et mondiales et des projets locaux.
Parmi les écosystèmes considérés par la projet BioEOS, les récifs coralliens occupent une place importante. Les sites d’étude sont localisés dans le sud-ouest de l’Océan Indien (Iles de La Réunion, Mayotte, Bassas et Glorieuses).

2. Description du stage

L'objectif du stage est de contribuer au développement d'une chaîne de traitement dédiée à la production d'indicateurs de diversité des récifs coralliens, en tenant compte des spécificités associées aux milieux aquatiques (correction atmosphérique, colonne d'eau). Certaines méthodes développées pour le suivi de la végétation terrestre et l'estimation d'indicateurs de biodiversité pourraient être transposées et éventuellement adaptées pour une utilisation en milieux côtiers, afin de fournir des indicateurs de la diversité corallienne. La complexité de la structure 3D des récifs, la dimension des individus et la prise en compte des effets d’atténuation dans la colonne d'eau sont autant de facteurs d'incertitude sur les indicateurs dérivés des données d'imagerie. Le prototype de chaîne de traitement sera appliqué sur différents sites d’étude.

Le/la stagiaire contribuera tout particulièrement aux actions suivantes:

- La mise en oeuvre de la chaine de traitement en lien avec le pôle de calcul basé à Ifremer (DATARMOR)
- La validation statistique de la pertinence des méthodes mises en place par comparaison avec les données d’observation acquises sur le terrain.

Il/elle bénéficiera d’un co-encadrement technique et thématique des spécialistes basés à l’Ifremer et à l’INRAE. Il/elle pourrait être amené(e) à interagir, en fonction du besoin, avec certains partenaires du projet, à savoir le GipsaLab, l'IFRECOR, l'IMT Atlantique, l'IRD, le SHOM, Sorbonne Université, l'Université de Toulon, l'Université de La Réunion, l'Université de Mayotte.

3. Contacts:
**Profil recherché**

Formation:
Ecole d’ingénieurs ou Universitaire de niveau Master 2

Connaissances spécifiques:

- Connaissance de base en télédétection et traitement d’image
- Compétence en programmation (R et/ou python)
- Connaissances en SIG souhaitées

Qualités personnelles:

- Méthode et rigueur
- Curiosité pour l’environnement marin
- Adaptabilité à un travail en équipe

**Conditions de travail**

Durée du stage : 6 mois
Lieu du stage : Ifremer centre de Brest (avec possibilité de missions ponctuelles à Grenoble)

**L’Ifremer**

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.

Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Ense