Stage Bac+5

il y a 1 semaine

Marcyl'Étoile, France bioMérieux SA Temps plein

**Stage BAC+5 - Recherche de variants pour l'identification métagénomique - F/H/D**:
Localisation: Marcy l'Etoile, France
Type de Contrat: Stage
Fonction: Bioscience R&D

Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour améliorer la santé des patients et assurer la sécurité des consommateurs.

Rejoindre bioMérieux, c’est choisir une société familiale et humaniste, portée par une vision long terme, au service de la santé publique dans le monde.

Chaque stagiaire ou alternant est accompagné par un tuteur expérimenté et formé. Il ou elle bénéficie d’un suivi et d’une évaluation l’aidant à progresser et à se préparer à la vie professionnelle.

**Quelle est votre mission chez bioMérieux ?**

**Au sein du département Data Science, vous contribuerez à l’amélioration d’un pipeline d’analyse en métagénomique ciblée. Le projet de recherche portera sur l’identification de variations génomiques spécifiques des espèces bactériennes et fongiques au sein des gènes/marqueurs ciblés. Le but est d’améliorer l’identification des espèces dans les échantillons et d’y associer un score de confiance.**
- ** 1ère partie du stage**:elle sera consacrée à l’identification et l’extraction des variations (SNV, MNV, indels, etc.) dans les séquences de marqueur.
- **2ème partie du stage**: elle sera orientée vers le développement d’une méthode prenant en compte ces variations pour améliorer le pipeline d’analyse initial en terme d’identification des espèces et de score de confiance.

Dans le cadre de ce stage, vous serez amené à:

- Ecrire du code (Bash, Python)
- Utiliser une grille de calcul, un gestionnaire de version de code et de nombreux autres outils dédiés au développement selon les bonnes pratiques mises en place dans l’équipe
- Participer à la définition d’une stratégie d’amélioration des performances d’un produit

Vous évoluerez dans une équipe polyvalente et pluridisciplinaire entre bioinformatique, informatique et microbiologie au cours de votre stage.

**Mots - clés: variants (SNV, indels), métagénomique ciblée, NGS, pipeline, performances**

**Qui êtes-vous?**
- Vous êtes actuellement en dernière année d'une formation BAC+5 type Master 2 en bioinformatique (Ecole d’ingénieur ou Université),
- Vous faites preuve de rigueur, d'autonomie et d'un sens de l'organisation,
- La maîtrise de l’environnement Unix est indispensable.

**_ Ce stage est prévu pour une durée de 6 mois. Ce stage est basé à Marcy L’Etoile, site accessible en transports en commun via la ligne de bus 98 ou 98E de Gorge de Loup._**

La gratification mensuelle pour un stagiaire est attribuée dès un mois de présence.

Le montant de la gratification dépend du niveau de formation de l’étudiant et est supérieure au minimum légal.

Les +:

- Restaurant d’entreprise avec participation de l’employeur.
- Remboursement de 100 % de l’abonnement de transports en commun ou indemnité de transport.
- Conciergerie sur les sites de Craponne, Marcy et La Balme.
- **_F/H/D : Femme/Homme/Diversité : _**bioMérieux s'engage à promouvoir l'égalité des chances en matière d’emploi.

  • Stage Bac+5/6

    il y a 2 semaines

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5/6 - Chargé de développement Marketing/Vente - Scientifique - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Marketing Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une...

  • Stage Bac+4/5

    il y a 1 semaine

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+4/5 - Commercial Training Project Specialist - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Marketing Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour améliorer...

  • Stage Bac+5

    il y a 1 semaine

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5 - Assistant Qualité Global Customer Service - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Service Client Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour...

  • Stage Bac+4/5

    il y a 9 heures

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+4/5 - Data Analyst junior - Global Customer Service - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Service Client Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour...

  • Stage Bac+5

    il y a 1 semaine

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5 - R&D Séquençage - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Bioscience R&D Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour améliorer la santé des...

  • Stage Bac+4/5

    il y a 2 jours

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+4/5 - Business data Analyst - Service Client - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Service Client Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour...

  • Stage Bac+5

    il y a 2 jours

    Marcy-l'Étoile, France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5 - Droit et Protection des données / RGPD - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Juridique et Propriété Intellectuelle Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une...

  • Stage Bac+3/4

    il y a 1 semaine

    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+3/4 - Amélioration d'une base de données métagénomique - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Bioscience R&D Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une...

  • Stage Bac+5

    il y a 1 semaine

    Marcy-l'Étoile, France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5 - Data Science - Computer Vision - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Bioscience R&D Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour améliorer la...

  • Stage Bac+5

    il y a 2 semaines

    Marcy-l’Étoile, Auvergne-Rhône-Alpes, France bioMerieux Temps plein

    Stage Bac+5 - R&D - Optimisation d'un dispositif innovant de croissance bactérienne - F/H/DLocalisation: Marcy l'Etoile, FranceType de Contrat: StageFonction: Bioscience R&DActeur mondial dans le domaine du diagnostic in vitro depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l'origine d'une maladie ou d'une contamination...