Stage M2/ingénieur

31320 Castanet Tolosan _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. **Environnement de travail, missions et activités**: Vous serez accueilli(e) au sein du laboratoire de recherche GenPhySE (Génétique, Physiologie et Systèmes d’Elevage) dans l’équipe REGLISS (REgulatory Genomic in LIvestock SpecieS), sur le campus INRAE de Toulouse à Auzeville. **Description du sujet**: Au cours de l’évolution, l’acquisition de nouveaux éléments génétiques par les génomes permet de créer de la diversité fonctionnelle et phénotypique. Les « rétrocopies » appelées aussi rétrogènes proviennent d’ARNm rétro-transcrits puis insérés dans le génome sans les introns et les régions promotrices du gène parental d’origine. Issues de l’activité des rétrotransposons, ces séquences ont la potentialité d’évoluer et de générer rapidement de nouvelles fonctions voire de nouveaux gènes. Elles participent ainsi à l’innovation génomique et peuvent contribuer à la diversité phénotypique. Alors que les rétrocopies ont été longtemps considérées comme des impasses évolutives, leur impact phénotypique sur les espèces d’intérêt agronomique a été démontré chez le mouton par deux études identifiant l’implication de rétrogènes dans l’expression des phénotypes de cornage (Wiedemar and Drögemüller 2015) et de toison (travaux menés à GenPhySE (Demars et al. 2017)). Vous serez plus particulièrement impliqué(e) dans: - L’exploration et l’étude des corrélations des profils d’expression des rétrogènes porcins et de leurs gènes parentaux à partir de données bulk RNA-seq, couvrant sept tissus distincts et trois stades clés du développement. - La caractérisation fonctionnelle et épigénomique de ces rétrogènes, par l’intégration de données multi-omiques complémentaires : représentation réduite ou méthylome complet (RRBS, WGBS), occupations chromatiniennes (ChIP-seq, marqueurs de promoteurs actifs et d’enhancers) et accessibilité de la chromatine (ATAC-seq). L’ensemble des données multi-omiques est disponible et les primo-analyses ont été réalisées. **Formations et compétences recherchées**: **Master/Ingénieur (Bac+5)** Formation recommandée : Bio-informatique, génomique. Connaissances souhaitées : Bonne maîtrise de Python ou R et des lignes de commande (bash) Aptitudes recherchées : Rigueur, travail en équipe, autonomie **Votre qualité de vie à INRAE**: En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée): - jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) - d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ; - de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ; - d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ; - de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ; - d'activités sportives et culturelles ; - d'une restauration collective. **Modalités pour postuler**: **J'ENVOIE MON CV ET MA LETTRE DE MOTIVATION** - Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. >_