Post-doctorat en Génomique Des Populations Pour La

33612 CESTAS PIERROTON _

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**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Vous disposerez d’ADN extrait à partir d’échantillons collectés dans différents lacs et de nombreuses données environnementales issues des suivis à long terme de ces écosystèmes par l’unité de recherche EABX. Vous travaillerez en collaboration avec une doctorante s’intéressant à la diversité génétique à l’échelle plus large de la communauté. Des réunions régulières avec les coordinateurs du projet Vincent Bertrin et Aurélien Jamoneau (UR EABX, Cestas Gazinet) seront organisées pour suivre l’évolution du projet et favoriser les échanges multidisciplinaires afin d’améliorer l’interprétation des résultats. Des séminaires réunissant l’ensemble des acteurs de la gestion sont également prévus afin de présenter les résultats et de discuter de leur implication pour la gestion et la conservation des espèces.

Face aux changements globaux la prise en compte de la capacité d’adaptation des populations dans la définition des stratégies de gestion est essentielle pour maximiser les chances de survie des espèces et le maintien de la fonctionnalité des écosystèmes. La diversité génétique intraspécifique est fondamentale pour l’adaptation des espèces aux changements environnementaux. L’objectif du travail de recherche postdoctoral consistera à mettre en œuvre une approche de génomique de populations pour étudier la répartition de la diversité génétique au sein des populations des lacs littoraux aquitains de Lobelia dortmanna et Littorella uniflora, deux espèces protégées faisant l’objet d’un Plan National d’Action visant à leur conservation in-situ. La recherche portera à la fois sur la diversité génétique neutre afin de reconstituer l’histoire démographique des populations, et sur la diversité génétique potentiellement sous sélection afin de comprendre à quelle échelle spatiale agit la sélection, conduisant éventuellement à des adaptations locales.
- Vous serez plus particulièrement en charge de:

- Mettre en œuvre une méthode de séquençage ciblée permettant d’étudier le polymorphisme au sein des génomes de deux espèces, en interaction avec la Plateforme Génomes Transcriptome de Bordeaux.
- Inférer les histoires évolutives et les trajectoires démographiques des populations et évaluer leurs capacités adaptatives.
- Identifier d’éventuelles traces de sélection au sein des génomes en lien avec l’adaptation locale.
- Intégrer ces résultats afin d’établir des recommandations pratiques pour la gestion conservatoire des populations.

**Formations et compétences recherchées**:
**Doctorat**
- Formation recommandée : doctorat en écologie, biologie évolutive (ou autres domaines approchants) avec de solides bases en génomique des populations
- Connaissances souhaitées : compétences en bioinformatique et en biologie computationnelle, ainsi qu’un intérêt pour les problématiques de la conservation et de la gestion des populationsce poste est fait pour vous
- Aptitudes recherchées : faire preuve d’autonomie, de créativité et avoir une bonne capacité de communication en français et/ou en anglais.

**Votre qualité de vie à INRAE**:
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée):

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

**Modalités pour postuler**:
**J'ENVOIE MON CV ET MA LETTRE DE MOTIVATION**
- Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises à son règlement intérieur notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent p