Ingénieur de plateforme en génomique de la biodiversité amazonienne F/H

Vos missions en quelques mots

Une mission attractive

Sous la supervision de la responsable scientifique de la plateforme, votre mission sera d'assurer la coordination technique et la mise en œuvre expérimentale des activités de la plateforme, vous interviendrez directement dans la réalisation des expérimentations, en particulier pour les projets structurants et stratégiques de la plateforme.

Vous jouerez un rôle clé dans le déploiement opérationnel de la plateforme, depuis la conception des stratégies expérimentales jusqu'à la production de données génomiques. Dans ce cadre vos activités seront les suivantes :

• Piloter et coordonner le fonctionnement opérationnel de la plateforme Guyomique, en lien étroit avec la responsable scientifique, les porteurs de projets et les partenaires.
• Développer, optimiser et appliquer des protocoles expérimentaux de référence pour des applications variées (références génomiques, ADNe, capture par hybridation, capture digitale) : extraction et purification d'acides nucléiques, préparation de librairies de séquençage Illumina et Oxford Nanopore, contrôles qualité (dosage, sizing), séquençage.
• Réaliser des expérimentations en génomique dans le cadre des projets stratégiques de la plateforme, et effectuer les contrôles qualités au cours des expérimentations et sur les données de séquençage produites.
• Automatiser les flux de travail de laboratoire sur automate de pipetage : programmation, réalisation de tests pour validation.
• Apporter une expertise technique et méthodologique aux projets de recherche accueillis, accompagner leur mise en œuvre et en assurer le suivi en tant que référent technique.
• Mettre en œuvre une démarche qualité, incluant un plan de gestion des échantillons, des procédures de contrôles qualité tout au long des expérimentations, la gestion documentaire (portfolio électronique des protocoles, registre des FDS, archivage des manuels utilisateurs, cahiers de laboratoire électroniques).
• Assurer la gestion, la maintenance et le bon fonctionnement des équipements, en lien avec les fournisseurs.
• Gérer les stocks et les approvisionnements : inventaires, demande de devis, commande et suivi des achats
• Veiller au respect des règles d'hygiène et de sécurité et contribuer à la prévention des risques en laboratoire.

Votre future équipe

Vous rejoindrez une équipe dynamique et pluridisciplinaire composée de trois chercheurs, d'une technicienne de recherche, de doctorants et de personnels temporaires.
L'équipe de la plateforme Guyomique est impliquée dans des projets de recherche nationaux et internationaux, couvrant un large spectre de compétences en écologie, évolution, génomique et bioinformatique pour l'étude de la biodiversité amazonienne.  Vous travaillerez dans un environnement collaboratif et interinstitutionnel, favorisant les échanges méthodologiques, la formation des étudiants et la mise en œuvre de projets innovants à l'interface entre recherche fondamentale et et applications pour la conservation de la biodiversité

Profil recherché

Vous avez développé les compétences suivantes :

• Solide expérience en biologie moléculaire et en génomique, incluant la manipulation d'ADN à partir de matrices biologiques variées, y compris échantillons complexes, anciens ou dégradés (collections naturelles, ADNe, tissus faiblement conservés).
• Maîtrise des techniques d'extraction et de purification d'acides nucléiques, d'évaluation de la qualité et de la quantité des échantillons (dosage, sizing).
  Expérience confirmée en séquençage à haut débit (NGS), notamment dans la préparation de librairies de séquençage Illumina et Oxford Nanopore, ainsi que dans la mise en œuvre de stratégies de séquençage adaptées aux objectifs scientifiques (références génomiques, métagénomique, capture ciblée).
• Expérience préalable sur une plateforme d'analyse ou une infrastructure mutualisée, impliquant la gestion des approvisionnent, des flux de travail, la traçabilité des échantillons et l'accompagnement des utilisateurs.
• Maîtrise des règles d'hygiène et de sécurité (H&S) applicables aux laboratoires de biologie moléculaire et de génomique.
• Maîtrise des outils informatiques nécessaires à l'utilisation et à la programmation des équipements (séquenceurs, automates de pipetage, instruments de contrôle qualité), et au contrôle qualité des données (compétences basiques en traitement de données de séquençage appréciées).

Vous faites preuves des qualités humaines suivantes :

• Sens de l'organisation et capacité à gérer plusieurs tâches de manière autonome.
• Adaptabilité et capacité à évoluer dans un environnement pluridisciplinaire et inter-institutionnel.
• Rigueur, sens de l'initiative.
• Motivation pour s'installer en Guyane française.

Vous êtes titulaires d'un diplôme de niveau 7 Master ou diplôme d'ingénieur dans les domaines suivants : biologie moléculaire, génétique, génomique

L'IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences.

L'institut met à votre disposition un panel d'outils tel que le parcours digital d'intégration, l'accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.

L'IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires.

En rejoignant l'IRD, vous bénéficierez :

• De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire).
• Tickets restaurants OU d'une restauration collective (en fonction du site).
• Souscription annuelle (facultative) à l'Association des
  Œuvres Sociales : prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles.
• Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale.      

Niveau d'études minimum requis

• Niveau
  Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

---