Ingénieur-e détude en Bioinformatique

il y a 1 semaine


IllkirchGraffenstaden, Grand Est, France INSERM Temps plein

L'Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l'ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l'innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l'Inserm, c'est intégrer un institut engagé pour la parité et l'égalité professionnelle, la diversité et l'accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l'Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.

Le Poste
L'Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire est un des principaux centres de recherche biomédicale en Europe et la plus grosse unité de recherche qui associe l'Inserm, le CNRS et l'Université de Strasbourg. L'IGBMC est composé de 4 départements scientifiques dont les domaines d'investigation sont : la biologie du développement et les cellules souches, la biologie structurale intégrative, la génomique fonctionnelle, le cancer, la médecine translationnelle, la neurogénétique. L'IGBMC a également développé des services scientifiques et plateformes technologiques de pointe. Le campus de l'IGBMC est situé sur le Parc d'innovation d'Illkirch dans la banlieue strasbourgeoise, un environnement scientifique académique et industriel exceptionnel qui favorise largement les collaborations et le transfert technologique. L'ingénieur-e sera accueilli-e dans l'équipe 'Mécanismes physiologiques et pathologiques du développement cortical' dirigée par Juliette Godin.

Mission Principale
Nous recherchons un(e) ingénieur(e) en bioinformatique très motivé(e) et créatif(ve) pour rejoindre l'équipe "'Mécanismes physiologiques et pathologiques du développement cortical" à l'Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) à Strasbourg, France. Le candidat retenu fera partie d'une équipe de recherche interdisciplinaire qui se concentre sur l'élucidation des mécanismes fondamentaux qui dictent l'acquisition du destin cellulaire et la maturation neuronale au cours de la corticogenèse chez les mammifères. Il/elle sera impliqué(e) dans un projet financé par l'ANR qui vise à étudier dans quelle mesure la modulation de l'abondance et/ou de la modification des ARN de trasnfert, contrôlent la traduction locale. Il/elle développera des méthodes bioinformatiques et statistiques pour analyser, interpréter et intégrer les données omiques à haut débit publiées et nouvellement générées. Il/elle travaillera de manière productive grâce à des interactions collaboratives avec divers membres de l'équipe.

Activités Principales
Les principales tâches du candidat seront d'analyser, d'interpréter et d'intégrer des données publiées de RNAseq, protéomique et trap-seq, afin de caractériser l'utilisation/l'optimalité des codons dans des contextes cellulaires ou pathologiques spécifiques.

Profil Recherché
Spécificté du poste: Poste à pourvoir dans l'équipe du Dr Juliette Godin

Connaissances
Solides compétences en codage à l'aide de python, R, git, outils de ligne de commande basés sur Unix/Linux.

Familiarité avec les principaux algorithmes ou pipelines d'analyse NGS (outils d'alignement, analyse de l'expression différentielle, etc.)

Connaissances / compétences en analyse biostatistique

Expérience préalable en termes d'extraction d'informations biologiques à partir de données NGS et des principales bases de données bioinformatiques

Intérêt pour les neurosciences/le développement neurologique

Aptitudes
Apprentissage rapide, esprit critique, attitude positive, fortes compétences en matière de résolution de problèmes et adaptabilité à de nouvelles données et questions.

Excellentes aptitudes aux relations interpersonnelles et au travail en équipe

Solides compétences en communication pour présenter des concepts informatiques et expliquer votre travail à un large éventail de publics.

Excellentes compétences organisationnelles, motivation personnelle et créativité

Expériences Souhaités
Nous étudierons tous les profils (avec ou sans expériences antérieures), la motivation et l'intérêt pour les thématiques étant des critères de selection majeurs.

Niveau de diplôme; Bac +5: diplôme spécialisé en biologie computationelle, bioinformatique, biostatistique ou domaine connexe

Durée: 12 mois renouvelable



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