INGENIEUR ETUDES en analyse de données de type « omics » H/F

Informations générales

Organisme de rattachement

CNRS  

Référence

UMR5239-CHRCHA-005  

Date de début de diffusion

/01/2026

Date de parution

/01/2026

Date de fin de diffusion

/02/2026

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels

Domaine / Métier

Recherche - Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

Statut du poste

Vacant

Intitulé du poste

INGENIEUR ETUDES en analyse de données de type « omics » H/F

Descriptif de l'employeur

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l'Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d'éthique, de déontologie et d'intégrité scientifique.

Description du poste

Missions :
La mission consiste en l'analyse de données de type « omics » (Hi-C, ChIP-Seq, MNase-Seq, etc) et en l'assistance des membres de l'équipe pour la réalisation de leurs propres analyses.
Activités :
. Analyse et visualisation de données « omics »
. Refactorisation et développement de pipelines pour les analyses de ChIP-seq et de MNase-seq
. Rédiger des fiches guides pour la réalisation autonome d'analyses de données omics
. Rédaction de fiches de travail à destination des membres de l'équipe pour la réalisation autonome de leurs analyses de données omics

Contexte de travail :
Localisé à l'ENS de Lyon, dans un environnement multidisciplinaire riche, le LBMC est un laboratoire de biologie expérimentale dont l'objet d'étude est la cellule, l'unité fondamentale du vivant.

Les 15 équipes du LBMC intègrent dans leurs recherches différents aspects de la vie cellulaire comme la prolifération, la différentiation et l'interaction avec l'environnement cellulaire dans un contexte normal ou pathologique. La recherche fondamentale menée au laboratoire s'appuie sur une expertise en biologie cellulaire et moléculaire et est résolument tournée vers l'interdisciplinarité intégrant des approches en (bio)informatique, (bio)physique et (bio)mathématique.

L'équipe « Chromatin Dynamics in Mitotic Chromosome Assembly » s'intéresse au processus d'assemblage des chromosomes mitotiques par le complexe Condensine, et son intersection avec la dynamique structurale de la chromatine. L'équipe mobilise des approches de génomique à haut-débit dans l'organisme modèle S.pombe.

Les avantages attachés à cette collaboration :

• Un environnement de travail interdisciplinaire stimulant aux contacts des personnels de la recherche

• Un accompagnement professionnel avec des formations.

• Un restaurant d'entreprise qui permet de bien déjeuner à un prix intéressant.

• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) ou forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an

• Un site accessible en transport en commun (Métro + Trams + bus) et vélo

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l'une des plus importantes institutions publiques au monde : femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l'Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l'international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l'innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Descriptif du profil recherché

Competences :
Savoir-faire
. Expertise en programmation, notamment à usage des biologistes (Python et/ou R)
. Expertise dans l'analyse de données biologiques de type « omics »
. Expertise dans le développement bioinformatique (packages)

Savoir-être
. Capacité à travailler en équipe et répondre aux besoins de ses collègues
. Capacité gérer plusieurs projets distincts en parallèle

Transverses
. Capacité à se former sur de nouvelles technologies/langages
. Veille technologique dans son domaine d'expertise
. Transfert de compétences aux membres non-bioinfo de l'équipe
Contraintes et risques :
R.A.S.

Temps plein

Oui

Rémunération contractuels (en € brut/an)

à partir de 2521€ brut mensuel selon expérience

Localisation du poste

Europe, France, Auvergne-Rhône-Alpes, Rhône (69)

Géolocalisation du poste

LYON 07

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

69364 LYON 07 (France)

Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme

Niveau 6 Licence/diplômes équivalents

Spécialisation

Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

Français (Seuil)

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