Emplois actuels liés à Doctorant en microbiologie évolutive, paléomicrobiologie et biogéochimie H/F - Besançon, Bourgogne-Franche-Comté - Choisir le Service Public

  • Technicien de laboratoire

    il y a 2 semaines


    Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France IFBM et Qualtech Groupe Temps plein

    Le Groupe QUALTECH - 5 sociétés, 7 sites et 350 salariés - est un regroupement de Laboratoires spécialisés dans les analyses de laboratoire (microbiologie, biologie moléculaire, chimie, extraction d'ADN, etc), le conseil, la recherche et la formation. Notre but est de garantir une expertise qualitative à nos clients en termes de contrôle, de qualité...

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    il y a 2 semaines


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  • Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Forvis Mazars en France Temps plein

    Votre posteForvis Mazars est une organisation internationale, intégrée et indépendante, spécialisée dans l'audit, l'expertise comptable et le conseil. Forvis Mazars est présent dans plus de 95 pays.En France,c'est une équipe de5000 collaborateursdans plus de 45 bureaux.En régionBourgogne Franche-Comté, 260 collaborateursaccompagnent leurs clients...


  • Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Forvis Mazars en France Temps plein

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  • Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Forvis Mazars en France Temps plein

    Votre posteForvis Mazars est un groupe international d'audit, de fiscalité et de conseil. Avec + de collaborateurs présents dans une centaine de pays, nous faisons partie du Top 10 des cabinets mondiaux.Nous faisons des métiers sérieux... sans se prendre au sérieux. Faire partie de nos équipes, c'est avant tout assumer sa singularité et oser partager...


  • Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Forvis Mazars en France Temps plein

    Votre posteForvis Mazars est une organisation internationale, intégrée et indépendante, spécialisée dans l'audit, l'expertise comptable et le conseil. Forvis Mazars est présent dans plus de 100 pays, nous faisons partie du Top 5 des cabinets mondiaux.En France,c'est une équipe de5 000 collaborateursdans plus de 40 bureaux.En régionBourgogne...

  • Infirmière H/F

    il y a 1 semaine


    Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Jober Group | Recrutement Dentaire 🦷 et Medical 🩺 Temps plein

    Emploi Infirmière H/F - Besançon 25Nous recrutons une infirmière diplômée d'État H/F pour intégrer une structure médico-chirurgicale située à Besançon, en Bourgogne-Franche-Comté, dans le cadre d'un CDI.Description Et MissionsEn tant qu'infirmière en SSPI, vous interviendrez au sein d'un service de soins post-interventionnels, sur des plages...

  • Développeur C/C++

    il y a 2 semaines


    Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Atol Conseils Et Developpements Temps plein

    Le poste Dans le cadre de notre croissance, le pôle Assistance Technique et Régie d'ATOL CD recherche un·e Développeur·euse C/C++ (H/F) pour intervenir chez l'un de nos clients basé à Besançon.En collaboration avec le manager, le responsable technique de l'équipe et des développeurs, vous serez amené.e à participer aux missions suivantes...

Doctorant en microbiologie évolutive, paléomicrobiologie et biogéochimie H/F

il y a 2 semaines


Besançon, Bourgogne-Franche-Comté, France Choisir le Service Public Temps plein


Informations générales

Organisme de rattachement

CNRS  

Référence

UMR6249-SEBLAN-018  

Date de début de diffusion

/12/2025

Date de parution

/12/2025

Date de fin de diffusion

/12/2025

Versant

Fonction Publique de l'Etat


Catégorie

Catégorie A (cadre)


Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels


Domaine / Métier

Recherche - Chercheuse / Chercheur


Statut du poste

Vacant


Intitulé du poste

Doctorant en microbiologie évolutive, paléomicrobiologie et biogéochimie H/F


Descriptif de l'employeur

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l'Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d'éthique, de déontologie et d'intégrité scientifique.


Description du poste

Sujet de thèse :
"Microbiologie évolutive, paléomicrobiologie et biogéochimie".

Nous recherchons un·e doctorant·e hautement motivé·e pour :
1. Élucider les liens entre l'usage des métaux lourds et la résistance aux antibiotiques grâce à l'analyse métagénomique d'ADN environnemental ancien et moderne (carottes sédimentaires), en se concentrant sur :

• La détection et l'annotation des ARGs, HMRGs et éléments génétiques mobiles (MGEs).

• Le profilage taxonomique et l'étude des associations fonctionnelles entre gènes.

• L'analyse des séries temporelles de la dynamique des gènes de résistance.
2. Explorer l'histoire évolutive des gènes de résistance

• Analyses de séquences et phylogénies en lien avec l'exposition et le temps.
3. Identifier les facteurs qui déterminent la propagation de la résistance aux antibiotiques

• Appliquer des modèles de séries temporelles pour relier les épisodes historiques de pollution à l'émergence des ARGs.

• Identifier les configurations génétiques « à haut risque » encore présentes aujourd'hui.

Nous recherchons un·e candidat·e hautement motivé·e titulaire d'un Master en biologie moléculaire, bioinformatique, écologie microbienne, génomique environnementale ou dans un domaine connexe. Une formation combinant biologie moléculaire en laboratoire et compétences computationnelles serait idéale, mais les candidat·es disposant d'un solide profil dans l'un des deux domaines et désireux·ses de développer l'autre sont également encouragé·es à postuler. Le·la candidat·e devra être capable de s'intégrer dans des équipes multiculturelles, avoir un goût prononcé pour l'analyse de données, être autonome et savoir prendre des initiatives.

Compétences attendues :

• Expertise en biologie moléculaire : extraction d'ADN, protocoles métagénomiques et analyses de données associées (annotations taxonomiques et fonctionnelles).

• Maîtrise en bioinformatique : capacité à utiliser et développer du code en R, Python ou outils similaires.

• Bonne compréhension de l'écologie microbienne et de ses applications dans les cycles biogéochimiques.

• Compétences en communication : excellente maîtrise de l'anglais oral et écrit.

Contexte :
Les cycles biogéochimiques globaux, régulés par l'activité microbienne, sont essentiels à la santé de la planète. Les activités humaines — exploitation minière, processus industriels et usage d'antibiotiques — ont profondément modifié ces cycles, entraînant une pollution généralisée ainsi que l'émergence de gènes de résistance aux métaux lourds (HMRGs) et de gènes de résistance aux antibiotiques (ARGs). Ces mécanismes de résistance, souvent associés sur des éléments génétiques mobiles, menacent les écosystèmes et la santé humaine. Sans action, la résistance antimicrobienne pourrait causer jusqu'à 10 millions de décès par an d'ici 2050.

Ce projet, financé par l'ERC Paleo-MARE, s'appuie sur des archives paléoécologiques (ADN sédimentaire) pour étudier sur le long t
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Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l'une des plus importantes institutions publiques au monde : femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l'Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l'international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l'innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.


Descriptif du profil recherché

Contraintes et risques :


Temps plein

Oui


Rémunération contractuels (en € brut/an)

La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel


Localisation du poste

Europe, France, Bourgogne-Franche-Comté, Doubs (25)


Géolocalisation du poste


BESANCON


Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

25030 BESANCON (France)

Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme

Niveau 7 Master/diplômes équivalents


Spécialisation

Formations générales


Langues

Français (Seuil)