chercheur - h/f -

Structure Délégation Régionale Inserm Nouvelle-Aquitaine - UMR 1219 dirgigée par M. Thiebaut

L'équipe SISTM, dirigée par Mélanie Prague fait partie de l'Inserm U1219 Bordeaux Population Health Center (BPH).

https://www.bordeaux-population-

Mission principale

La personne recrutée aura pour mission de participer à la construction de modèles mathématiques (basés sur des équations différentielles) de la réponse immunitaire induite par vaccination et à la dynamique virale après infection en aidant à intégrer les derniers résultats biologiques connus en virologie et en immunologie dans ce domaine.

Ce projet se déroulera dans le cadre du PEPR MIE Previx. Ce projet est structuré en six groupes de travail employant des approches quantitatives adaptées à la diversité des données générées dans le cadre d'une pandémie. L'objectif est de définir les contours microbiologiques, infectiologiques et épidémiologiques des futures menaces. Le projet développera des méthodes pour détecter, caractériser et modéliser en temps réel un nouveau pathogène dès les premières informations disponibles. Il traitera notamment l'analyse de données hétérogènes et l'usage de l'apprentissage automatique. Le consortium réunit neuf unités de recherche aux compétences interdisciplinaires. Il produira des connaissances utiles à la santé publique et contribuera à la formation d'une nouvelle génération de spécialistes capables d'anticiper la virose respiratoire X.

Dans le cadre de ce projet, le chercheur contractuel s'intégrera dans le workpackage intra-hote. Une première contribution sera d'investiguer des design d'essai préclinique innovants et optimaux en collaboration avec Jeremie Guedj et France Mentre de l'unité inserm IAME paris.

Un des enjeux sera le développement de designs optimaux pour obtenir des estimations fiables des paramètres viro-immunologiques dans les modèles expérimentaux chez le primate non humain. Ces modèles sont essentiels pour l'étude de la pathogénie virale et des stratégies thérapeutiques. L'estimation de ces paramètres reste toutefois difficile en raison de contraintes de ressources et de conception expérimentale. Le travail portera sur l'usage de simulations pour analyser l'impact de différentes doses d'inoculation et d'une hétérogénéité accrue dans le calendrier des interventions, afin d'améliorer la robustesse des estimations et la capacité à identifier des corrélats de protection.

Activités principales

Réaliser une veille bibliographique des résultats en immunologie dans les domaines évoqués ci-dessus, ainsi que sur les modèles mathématiques associés

Participer à la construction des modèles d'équations differentielles de la réponse immunitaire

Réaliser des analyses de données issues d'études cliniques vaccinaux via l'utilisation des modèles développés

Participer à la vie scientifique de l'équipe

Valoriser le travail de recherche par la rédaction d'articles et la présentation de communications orales ou affichées

Connaissances

Expertise en immunologie

Experience dans l'analyse de la réponse immunitaire induite par vaccination

Des compétences en programmation et/ou analyse statistique de population et/ou modélisation mathématique seront grandement appréciées.

Anglais scientifique et technique

Savoir Faire

Analyse et mise en forme de données issues d'essai cliniques vaccinaux

La maitrise du logiciel Monolix sera appréciée.

Gérer la confidentialité des informations et des données

Aptitudes

Rigueur

Autonomie

Sens de l'organisation

Travail en équipe

·Aptitude à la rédaction scientifique

Expériences souhaitées : 3 ans d'experience dans l'analyse de la réponse immunitaire post-vaccination/infection ou dans sa modélisation mathématique

Pour valider votre candidature, nous vous demandons de fournir les éléments suivants, vous devrez télécharger les pièces demandées directement lors de votre inscription.

Toute candidature incomplète ne sera pas traitée par nos services.

Document(s) :

• Curriculum Vitæ
• Lettre de motivation