Ingénieur de recherche en apprentissage par renforcement pour l'embryogenèse

Informations générales

Organisme de rattachement

CNRS  

Référence

UMR5077-MARPEL1-019  

Date de début de diffusion

/01/2026

Date de parution

/01/2026

Date de fin de diffusion

/01/2026

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels

Domaine / Métier

Recherche - Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

Statut du poste

Vacant

Intitulé du poste

(H/F) Ingénieur de recherche en apprentissage par renforcement pour l'embryogenèse

Descriptif de l'employeur

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l'Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d'éthique, de déontologie et d'intégrité scientifique.

Description du poste

Missions :
Le ou la candidat·e retenu·e développera un cadre computationnel pour étudier l'émergence d'information durant l'embryogenèse, en combinant théorie de l'information, mesures de complexité et apprentissage par renforcement multi-agents afin de révéler et quantifier la complexité morphogénétique fonctionnelle
Activités :

• Concevoir et implémenter des métriques d'information et de complexité appliquées à des données embryonnaires 3D+temps (ex. information mutuelle, information positionnelle/corrélationnelle, complexité algorithmique, métriques topologiques / invariants).

• Développer une approche d'apprentissage par renforcement multi-agent où les cellules sont modélisées comme des agents apprenant des politiques d'action sous contraintes mécaniques/biophysiques, avec définition de signaux de récompense (structure finale, robustesse, contraintes topologiques, etc.).

• Construire et maintenir une chaîne de calcul reproductible (pipelines de données, entraînements, évaluation, gestion d'expériences), et contribuer à la diffusion logicielle (documentation, dépôt, bonnes pratiques).

• Interagir étroitement avec les biologistes/biophysicien·nes et les autres profils computationnels de l'équipe, participer à la rédaction d'articles, présentations et à la vie scientifique de l'unité.

Contexte de travail :
Le ou la candidat·e retenu·e rejoindra l'équipe interdisciplinaire Multiscale Physics of Morphogenesis, dirigée par Hervé Turlier et composée d'une demi-douzaine de chercheurs.
L'équipe s'engage à offrir un environnement de travail bienveillant, inclusif et diversifié.

Elle sera située à partir du 1er mars au Centre de Biologie Intégrative sur le campus Paul Sabatier de l'Université de Toulouse, dans un environnement scientifique idéal pour développer les interfaces entre biologie, modélisation physique et numérique et apprentissage machine.

Le ou la candidat·e disposera d'un poste de travail individuel dans des locaux rénovés, d'un ordinateur portable performant et d'un accès à un cluster de calcul haute performance dédié à l'équipe (12 GPU, 396 CPU).

Le poste ne présente aucune contrainte ou risque particulier et un jour de télétravail par semaine est possible.

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l'une des plus importantes institutions publiques au monde : femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l'Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l'international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l'innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Descriptif du profil recherché

Competences :
Compétences indispensables :

• Très bon niveau en programmation scientifique (Python) et environnement data/IA (NumPy/SciPy, PyTorch ou JAX, gestion d'expériences).

• Solides bases en apprentissage automatique, idéalement RL (policy gradients/actor-critic, exploration, reward shaping).

• Maîtrise des outils de dev/reproductibilité : Git, tests, packaging, environnements (conda/poetry), conteneurs (Docker/Singularity), scripts HPC.

• Capacité à conduire un travail de recherche : lecture critique, prototypage, validation, documentation, transfert aux collègues.

Compétences appréciées :

• Connaissances en théorie de l'information, statistiques, inférence.

• Notions en biophysique / mécanique des tissus ou intérêt fort pour la modélisation du vivant.

• Expérience avec données spatio-temporelles 3D, graphes dynamiques, ou analyse topologique (selon l'orientation choisie).

Savoir-être :

• Goût pour le travail interdisciplinaire (biologie–physique–informatique), autonomie, rigueur, sens du partage (code, méthodes), communication scientifique (écrit/oral).

Contraintes et risques :
Télétravail possible 1j/semaine
Contrat de 6 mois, avec possibilité de doctorat au 1er septembre 2026.

Temps plein

Oui

Rémunération contractuels (en € brut/an)

Entre € et € brut mensuel selon l'expérience

Localisation du poste

Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31)

Géolocalisation du poste

TOULOUSE

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

31062 TOULOUSE (France)

Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme

Niveau 7 Master/diplômes équivalents

Spécialisation

Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

Français (Seuil)

---