Ingénieur biologiste en analyse de données

il y a 4 jours

SaintMartindHères, Auvergne-Rhône-Alpes, France Université Grenoble Alpes Temps plein

Type de recrutement :

Poste ouvert en CDD

Quotité de travail :

100%

Niveau d'emploi :

A - IGR - Ingénieur de Recherche

Durée du contrat :

Du 01 janvier 2026 au 31 octobre 2026

Localisation :

LIG

700 Avenue centrale

38400 Saint Martin d'Hères

Présentation de la structure

Le LIG (laboratoire d'informatique de grenoble) comporte 22 équipes de recherche (~450 personnes) qui contribuent au développement des aspects fondamentaux de l'informatique (modèles, langages, méthodes, algorithmes) et développent une synergie entre les défis conceptuels, technologiques et sociétaux associés à cette discipline.

Les cinq axes principaux sont :

  • Génie des Logiciels et des Systèmes d'Information
  • Méthodes Formelles, Modèles et Langages
  • Systèmes Intelligents pour les Données, les Connaissances et les Humains
  • Systèmes Interactifs et Cognitifs
  • Systèmes Répartis, Calcul Parallèle et Réseaux

La personne recrutée sera encadrée par Antoine Frenoy (maitre de conférences Grenoble INP), au sein de l'équipe Aptikal du LIG dirigée par Emilie Devijver.

Cette équipe comporte une dizaine de bioinformaticiens avec lesquels la personne recrutée interagira régulièrement, à travers des réunions thématiques, séminaires, discussions informelles, et collaborations potentielles.

Les activités scientifiques de l'équipe Aptikal sont centrées sur l'apprentissage statistique et la science des données. Les principales thématiques couvertes en bioinformatique sont la biologie évolutive / biologie des populations et la biologie computationnelle du cancer.

Missions principales

Récolte, nettoyage et analyse de jeux de données multi-omiques publiques, Développement logiciel, Développement de nouveaux outils statistiques, Veille scientifique, bibliographie

Activités principales

  • Développement d'une méthode de déconvolution de l'hétérogénéité tumorale dans le cancer du pancréas à partir de données en cellules uniques
  • Organisation et mise en oeuvre technique de data challenges sur la plateforme codabench
  • Management des ressources computationnelles de l'équipe (maintenance des projets en cours, formation des nouveaux arrivants, organisation des ressources de stockage et de calcul scientifique, data management)
    Veille technologique sur les développement méthodologiques en lien avec les activités de recherche de l'équipe
  • Travail sur écrans

    Déplacements professionnels possibles (séminaires, conférences)

Compétences attendues

  • Des compétences en programmation (R, Python, bash), une expérience préalable avec des logiciels d'analyse et les packages associés
  • Des connaissances en informatique, data management et developpement de projets collaboratifs
  • Des connaissances en biologie moléculaire
  • Capacité à communiquer en anglais parlé et écrit
  • Autonome et avec un esprit critique, capacité à gérer et à analyser des ensembles de données volumineux et variés, avec des informations biologiques et cliniques
  • Bonnes compétences en communication permettant des interactions productives avec une équipe interdisciplinaire (y compris des informaticiens, des biologistes et des cancérologues)
  • Doctorat en bioinformatique ou biologie computationnelle ; Master en bio-informatique ou bio-statistique

Conditions de diplômes

Bac + 5

Rémunération

A partir de 2289€ mensuel brut et en fonction de l'expérience.

Vous percevrez en plus de votre salaire un régime indemnitaire d'un montant mensuel brut de 716 €.

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