Technicien-Technicienne en virologie et génomique cliniques

Créée en 1825, l'École Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), la plus ancienne des grandes écoles toulousaines, s'est forgée de longue date une renommée nationale et internationale. C'est l'une des quatre Ecoles nationales vétérinaires françaises (ENVF) et l'un de 12 établissements publics d'enseignement supérieur agronomique, vétérinaire et forestier, sous la tutelle du Ministère de l'Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire.

Ses activités de recherche, conduites en partenariat avec INRAE, l'INSERM, des équipes de l'Université de Toulouse, témoignent de la qualité de son travail scientifique.

Ancrée dans les terroirs d'Occitanie (ruraux et urbains) par ses activités cliniques, l'ENVT a su également s'ouvrir à l'international. L'école est, en effet, impliquée dans 36 accords bilatéraux, offrant ainsi de nombreuses possibilités de mobilité à ses étudiants, enseignants et chercheurs.

L'ENVT forme ainsi depuis des décennies des vétérinaires – biologistes de haut niveau, médecins et chirurgiens – tournés vers le monde animal (de compagnie, de sport ou de production). Autant de praticiens qui en contribuant au bien-être animal ou à la qualité des animaux d'élevage, participent à garantir la santé publique.

Intégrer l'ENVT c'est aussi intégrer un campus exceptionnel de 54 hectares, situé à quelques kilomètres seulement du centre-ville de Toulouse. Bordé au nord par la coulée verte qui serpente le long du « Touch », il abrite un centre équestre et offre à ses étudiants de belles escapades à pied ou à cheval entre espaces boisés et rive de la Garonne.

Une école où il fait bon vivre, travailler et étudier.

Au sens large, les objectifs du poste consistent à appuyer les projets de recherche en virologie : assurer un soutien technique, participer aux taches transversales dans l'unité et participer à l'encadrement et la formation des étudiants et stagiaires

Mission 1 : virologie clinique

• Réceptionner, reconditionner, enregistrer (barcoding) et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, tenir un cahier d'expériences, rassembler et analyser les résultats, les mettre en forme et en rendre compte
• Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d'analyse utilisant un ensemble de techniques (culture virale sur cellules et in ovo, PCR conventionnelle, temps réel et digitale, électrophorèse sur gel d'agarose, autres techniques de biologie moléculaire…)
• Actualiser le dossier de protocoles techniques
• Consulter et exploiter une documentation technique

Mission 2 : génomique appliquée à la virologie clinique

• Mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléique en vue du séquençage NGS
• Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage et gestion des consommables de séquençage
• Sauvegarde des données de séquençage NGS et premières analyses de contrôle qualité

Mission 3 : formation et encadrement des étudiants et stagiaires

• Accompagnement de stagiaires et de thésards vétérinaires (thèse d'exercice vétérinaire), résidents des collèges de spécialistes vétérinaires,
• Accompagnement d'étudiants en stage de master et doctorants en thèse de 3ème cycle), notamment dans le cadre de l'EUR UNITEID.
• Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires (bonnes pratiques de laboratoire, règles d'hygiène et sécurité), en lien avec l'assistante de prévention Hygiène et sécurité de l'UMR IHAP et des assistants de prévention des tutelles ENVT et INRAE

Mission 4 : appui logistique à l'activité du laboratoire de virologie clinique et de l'UMR IHAP

• Assurer la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l'entretien du laboratoire
• Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs
• Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d'hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits
• Participer à la gestion des stocks et des commandes
• Participer activement à la mise à jour du processus qualité du laboratoire

Savoirs

• Connaitre les techniques de biologie moléculaire de base
• Bonnes pratiques de laboratoire
• Savoir appréhender les risques chimiques et biologiques liés aux produits, matériels et techniques utilisées.
• Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats.
• Comprendre une documentation en anglais
• Bonnes capacités rédactionnelles
• Des notions de NGS et métagénomiques seraient appréciées.

Savoir-faire

• Organiser et conduire son activité avec rigueur, autonomie et fiabilité
• Savoir manipuler dans des conditions stériles et travailler en milieu confiné
• Savoir utiliser les équipements de base d'un laboratoire (thermocycleur, microscope, centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …)
• Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d'un projet.
• Savoir rendre compte, travailler en équipe
• Savoir transférer ses connaissances pour l'accompagnement à l'utilisation d'outils