Bioinformaticien Agents Infectieux, spécialisé en analyse de génomes bactériens F/H
il y a 3 jours
Informations générales
Organisme de rattachement
Hôpital Saint-Louis
Référence
APHP_
Date de début de diffusion
/01/2026
Date de parution
/01/2026
Domaine / Métier
Sécurité - Responsable ou personnel de laboratoire
Intitulé du poste
Bioinformaticien Agents Infectieux, spécialisé en analyse de génomes bactériens F/H
Description du poste
Mission principale
• L'implémentation et la mise en place des outils et des workflows d'analyses des données biologiques issues du séquençage haut-débit des génomes bactériens sur la plateforme Moabi
• Finalisation installation interphase pipeline pour le diagnostic de la syphilis
• L'administration et la maintenance des pipelines d'analyses des génomes bactériens
• La participation aux activités du site internet du cnr
• La veille scientifique afin de proposer les méthodes d'analyses de données de séquençage à la pointe de l'innovation
• La valorisation et le partage des application développées dans la communauté scientifique
• Le support technique & scientifique, et la formation des biologistes aux solutions bioinformatiques proposées
Personnel paramédical attribué au CNR des IST bactériennes
2 ingénieurs, 1 bio-informaticien, 1 technicien, 1 technicien ANRS/PHRC
Descriptif du profil recherché
PRE-REQUIS
Master ou doctorat en Biologie/Informatique (double compétence appréciée)
SAVOIR FAIRE REQUIS
• Maitrise de l'environnement UNIX/LINUX et d'un ou des langages de programmation (PYTHON,PERL, R, Bash…)
• Connaissance du gestionnaire snakemake et de Docker
• Maitrise des concepts et outils bioinformatiques en particulier ceux utilisés en génomique et pour l'analyse des données NGS
• Maitrise des bonnes pratiques de développement informatique amenant à la production d'un code fiable
• Organisation et gestion de projet
• Pratique courante de l'anglais scientifique écrit et oral
CONNAISSANCES ASSOCIEES
Formation en Bio-informatique
Localisation du poste
Europe, France, Île-de-France, Paris (75)
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Infirmier - Maladies Infectieuses et Tropicales Jour F/H
il y a 1 semaine
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Infirmier - Maladies Infectieuses et Tropicales Nuit
il y a 2 semaines
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Infirmier - Maladies Infectieuses et Tropicales Nuit
il y a 2 semaines
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Product Owner Data en génomique – Programme ACCES AP-HP F/H
il y a 3 jours
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Infirmier- Maladies Infectieuses et Tropicales Horaire de jour en 9h H/F
il y a 2 semaines
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il y a 2 semaines
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