Deux Post-doctorat

Informations générales

Organisme de rattachement

CNRS  

Référence

UMR3738-DEBPHI-004  

Date de début de diffusion

/01/2026

Date de parution

/01/2026

Date de fin de diffusion

/02/2026

Intitulé long de l'offre

Deux Post-doctorat (H/F) en développement de méthodes d'apprentissage automatique pour les données omiques unicellulaires

Date limite de candidature

07/02/2026

Nature du contrat

CDD d'1 an

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels

Domaine / Métier

Recherche - Chercheuse / Chercheur

Statut du poste

Vacant

Intitulé du poste

Deux Post-doctorat (H/F) en développement de méthodes d'apprentissage automatique pour les données omiq

Descriptif de l'employeur

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l'Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d'éthique, de déontologie et d'intégrité scientifique.

Description du poste

Missions :
Les technologies de séquençage à haut débit à cellule unique génèrent des volumes sans précédent de données moléculaires à résolution cellulaire, ouvrant de nouvelles voies pour l'application de l'apprentissage automatique aux problèmes biologiques fondamentaux. Les chercheurs postdoctoraux seront recrutés pour rejoindre l'équipe Machine Learning for Integrative Genomics de l'Institut Pasteur dans le cadre du ERC Starting Grant MULTI-viewCELL.
Un poste sera axé sur le développement de modèles de fondation multimodaux qui intègrent des omiques à cellule unique avec des informations spatio-temporelles. Le second poste portera sur développement d'un modèle de tissu virtuel, exploitant les données transcriptomiques spatiales et les approches théoriques des réseaux.
Activités :
- conception d'une nouvelle méthode mathématique
- veille documentaire de publications pertinentes pour le domaine
- programmation/codage en Python (Pytorch)
- présentation des résultats obtenus en conférence
- interaction avec les membres de l'équipe et les collaborateurs internationaux
Contexte de travail :
L'équipe Machine Learning for Integrative Genomics genomics/) de l'Institut Pasteur, dirigée par Laura Cantini, travaille à l'interface de l'apprentissage automatique et de la biologie (outils développés par l'équipe : ). L'équipe est composée de 9 personnes : 4 doctorants, 3 post-doctorant, 1 Ingénieur de recherche et 1 assistante. L'équipe est associée au département de biologie computationnelle de l'Institut Pasteur, à l'UMR3738 et à l'Institut d'intelligence artificielle PRAIRIE. L'équipe a récemment remporté un financement ERC StG qui fait l'objet de ce recrutement.
Les personnes recrutées seront placées sous l'autorité hiérarchique de Laura Cantini.

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l'une des plus importantes institutions publiques au monde : femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l'Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l'international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l'innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Descriptif du profil recherché

Competences :
Diplôme : Doctorat en informatique, en apprentissage automatique ou en biologie computationnelle
Nous attendons d'un candidat qu'il dispose d'une solide expérience en apprentissage automatique ou en statistiques. Le candidat doit également maîtriser des langages de programmation comme Python. La familiarité avec les données unicellulaires et l'expérience avec les méthodes et les logiciels existants pour les cellules uniques représenteraient un fort avantage. D'excellentes compétences en communication et un esprit d'équipe, ainsi qu'une capacité à travailler en autonomie sont essentiels. Un anglais courant, tant à l'oral qu'à l'écrit, est requis.
Contraintes et risques :
Travail sur ordinateur

Temps plein

Oui

Rémunération contractuels (en € brut/an)

€ et € brut mensuel selon expérience

Localisation du poste

Europe, France, Île-de-France, Paris (75)

Géolocalisation du poste

PARIS 15

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

75724 PARIS 15 (France)

Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme

Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents

Spécialisation

Formations générales

Langues

Français (Seuil)

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