Ingenieur-e de recherche en bioinformatique

L'université de Caen Normandie (UNICAEN) est un acteur majeur et un moteur de développement de l'enseignement supérieur et de la recherche en Normandie. UNICAEN est membre de la communauté d'universités et d'établissements Normandie Université.

Pluridisciplinaire, elle accueille plus de étudiants au sein de 12 composantes (UFR, écoles, instituts ).

Afin de mener ces missions, elle s'appuie sur 2 700 professionnels, dont 1 600 personnels enseignants et 540 ) et 1 100 personnels des bibliothèques, ingé, , techniques, sociaux et de santé (BIATSS).

Présentation de l'unité de recherche :

L'unité ISTCT « Imagerie et Stratégies Thérapeutiques pour les Cancers et Tissus Cérébraux », UMR6030 est une unité mixte de recherche du CNRS et de l'Université de Caen-Normandie (UNICAEN) hébergée au GIP CYCERON à Caen.

Les activités de recherche d'ISTCT visent à mieux comprendre la physiopathologie des tumeurs hypoxiques (cerveau-poumon) et identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la tumeur et son microenvironnement mais aussi à protéger le tissu sain environnant des traitements anti-cancéreux tels que la radiothérapie.

Positionnement hiérarchique :

Sous la responsabilité du Dr Aurélien JUSTET, MCU-PH (n+1) et la direction unité (Dir. Myriam BERNAUDIN, Dir Adj. Samuel VALABLE).

Missions :

Dans le cadre des activités de recherche du projet SOMAFIBRAD porté par A. JUSTET au sein de l'unité ISTCT, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données transcriptomique et génomique en vue d'identifier les mutations somatiques associées à l'existences de populations cellulaires impliquées dqns la fibrogenèse pulmonaire.

Activités principales du poste :

• Définition et mise en oeuvre le protocole d'analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues d'ananlyse transcriptomique à noyaux unique
• Identification de mutations somatiques à partir du pipeline GATK mise en place par le broadInstitute
• Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python
• Interaction avec l'équipe-projet : échanges réguliers avec biologistes, cliniciens et biostatisticiens ; participation aux réunions de projet et des collaborateurs internationaux (Yale University,Univeriste d' Hannovre)
• Diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de communication scientifique et préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.
• Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques en recherche (PGD, FAIR, traçabilité).
• Veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
• Formation, en interne (ex Doctorants, post-doctorants) et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques citées précédemment.

Conditions particulières d'exercice :

• Télétravail possible (avec un maximum de 2 jours par semaine et selon les contraintes du projet/service)
• Nécessité d'adaptation aux contraintes de service et d'horaires
• L'agent sera amené à accompagner et former les nouveaux arrivants dans l'unité à la culture cellulaire.

Catégorie d'emploi : A

Diplôme requis :

Diplôme d'ingénieur, Doctorat

Formation solide en bioinformatique, biostatistiques, data science ou équivalent

Compétences attendues:

Connaissances :

• Bioinformatique, biostatistiques, analyse de données omiques.
• Connaissances solides en R et/ou Python (ou autre langage de programmation)
• Notions avancées en cytométrie en flux ou en protéomique (au moins l'un des deux ; idéalement les deux).
• Connaissances en méthodes d'intégration de données multi-omics.
• Compréhension générale de la biologie des systèmes, immunologie ou cancérologie (apprécié).
• Connaissance des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion des données.

Compétences opérationnelles :

• Concevoir, traiter et analyser des données multiparamétriques volumineuses
• Construire et documenter des pipelines d'analyse reproductibles
• Mettre en œuvre des analyses statistiques avancées
• Visualiser et présenter clairement des résultats complexes
• Rédiger des méthodologies, des rapports et des documents techniques
• Travailler en équipe

Compétences comportementales :

• Rigueur scientifique
• Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
• Autonomie dans la gestion des projets d'analyse
• Esprit analytique, capacités de synthèse
• Qualités relationnelles
• Organisation et gestion de projets
• Capacité d'adaptation
• Capacité à anticiper et résoudre les problèmes
• Bonnes compétences de communication orale et écrite

Conditions de recrutement :

Recrutement sur contrat de recherche, sous réserve de la disponibilité du financement.

Poste à temps complet, ouvert uniquement aux contractuels (CDD).

Rémunération statutaire et appréciée en fonction de l'expérience professionnelle.

A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et aux autres bénéficiaires de l'obligation d'emploi.

Poste à pourvoir : 1er avril 2026 au 30 juin 2027, renouvelable.

Date limite de candidature : 01/03/2026