Ingénieur-e en bio-informatique
il y a 5 jours
Retour à la liste des résultatsPrésentation INRAEL'Institut français de la vigne et du vin (IFV) est un institut technique qui rassemble 170 collaboratrices et collaborateurs dans les principales régions viticoles françaises. Sa mission est d'apporter par son activité de recherche appliquée des solutions et des références techniques à la filière vitivinicole française.Rejoindre l'IFV, c'est prendre part à la transformation de la filière et aux enjeux du futur, agir activement dans la diffusion des résultats de recherche et d'expérimentation et partager son engagement RSE.A Colmar, l'équipe rassemble des compétences en œnologie, technologies de séquençage à haut débit et dépérissements.Environnement de travail, missions et activitésDans le cadre de ses activités liées au séquençage haut-débit (HTS), l'IFV pôle Alsace au travers du LPA Vitivirobiome, recrute un(e) ingénieur(e) bio-informatique, basé(e) à Colmar dans les locaux de l'INRAE. La personne recrutée aura la responsabilité d'analyser des données de transcriptomiques, amplicon Seq, principalement pour obtenir des informations sur le virome de la vigne. La personne travaillera en étroite interaction avec l'équipe de virologie et de génomique de la vigne de l'IFV/INRAE.MissionsMaintenance et évolution d'un pipeline Nextflow existant pour l'assemblage de génomes viraux à partir de données RNA-seqDéveloppement d'analyses en R et Python (traitement, statistiques, visualisation, rapports).Conception, développement/versioning, documentation et maintenance de pipelines bio-informatiques dans un environnement LinuxLancement et supervision des analyses sur cluster de calcul sous SLURMMise en place et application d'un plan de gestion de donnéesValidation de la qualité des données et de l'intégrité des fichiers, traçabilité et sauvegarde des fichiers, au travers de la création de bases de donnéesFormations et compétences recherchéesMaster/Ingénieur (Bac+5)Bac +5 (ou expérience équivalente) en bio-informatiqueExpérience sur des traitements de données de séquençage haut-débit. Une expérience en assemblage de génome viraux est un atout. Expérience préalable à naviguer sur les bases de données publiques majeurs SRA, ENA souhaitéeExpérience avec des systèmes de workflows reproductibles (Nextflow, Snakemake ou équivalent).Aisance pour travailler sur cluster de calcul Linux (scripting Bash, Slurm, gestions des jobs et ressources, logs, …) avec une expérience sur l'utilisation de conteneurs (Singularity/Apptainer, Docker).Expérience en bonnes pratiques de développement informatique (Git, versioning)Maitrise d'au moins un langage de programmation de haut niveau Python ou R (Python est un plus).Connaissances de base de l'anglais scientifique pour une recherche bibliographique et documentation officielle efficienteVotre qualité de vie à INRAERestauration collective.Tickets restaurant et avantages CEModalités pour postulerJ'envoie mon CV et ma lettre de motivationLes personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l'obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l'exercice de leurs fonctions, qu'elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu'elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : sitefonction
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Technicien support informatique H/F
il y a 2 semaines
Strasbourg, Grand Est, France JGS INFORMATIQUE Temps pleinNotre entreprise familiale spécialisée en infogérance et services informatiques sur mesure pour les professionnels recherche un(e) technicien(ne) ou ingénieur(e) informatique pour renforcer son équipe de support et de maintenance.Vous interviendrez auprès de nos clients professionnels pour assurer le bon fonctionnement de leur parc informatique, leur...
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Ingénieure/Ingénieur Informatique Industrielle
il y a 1 jour
Strasbourg, Grand Est, France Capgemini Temps pleinDans le cadre du développement de nos activités à Strasbourg, nous recherchons des Ingénieurs Informatique Industrielle H/F pour intervenir sur différents projets dans le secteur pharmaceutique. Vous aurez comme principales missions de : • Réaliser le développement de fonctions logicielles • Participer activement aux phases de débogage et...
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Strasbourg, Grand Est, France TechnoRH Temps pleinLe Groupe INOSTRALE, acteur majeur de la santé et du bien-être en France (Les Trois Chênes, Color et soin, Eric Favre...), recherche pour sa filiale bio en plein développement (marques telles que Dermaclay, Beliflor...), un(e) Commercial(e).Vous avez une bonne connaissance et/ou une forte sensibilité aux produits bio, sains et naturels ?Vous souhaitez...
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Ingénieur Développement C# .Net
il y a 3 jours
Strasbourg, Grand Est, France MCA Temps pleinMCA est un Groupe de Conseil en Ingénierie et Hautes Technologies qui compte 1450 collaborateurs en France et à l'International.Fort de nos 30 ans d'expérience, nous accompagnons nos clients dans la réalisation de leurs projets.Nous rejoindre, c'est intégrer une entreprise dynamique qui a à cœur d'accompagner ses collaborateurs.Vous bénéficiez d'un...
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Ingénieur informatique industrielle F/H
il y a 5 jours
Strasbourg, Grand Est, France Eiffage Temps pleinEiffage Énergie Systèmes conçoit, réalise, exploite et maintient des systèmes et équipements en génies électrique, industriel, climatique et énergétique dans le respect des Hommes et de l'environnement.Eiffage Énergie Systèmes propose une offre sur mesure pour les marchés de l'industrie, des infrastructures et réseaux, des villes et...
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Ingénieur Logiciel de Sécurité H/F
il y a 1 jour
Strasbourg, Grand Est, France Clearsy Temps pleinCLEARSY recherche un(e) ingénieur(e) logiciel expérimenté(e) avec mission de : Développer des applications logicielles critiques et/ou sécuritaires ferroviaires (SIL3 ou SIL 4) sur l'ensemble du cycle de développement (conception, codage, test, intégration, validation) Mettre en œuvre de la norme CENELEC EN50128. Vous : Ingénieur(e) de formation ou...
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Ingénieur d'Affaires
il y a 3 jours
Strasbourg, Grand Est, France agap2 Temps pleinAgap2est un acteur majeur du conseil en ingénierie et en informatique, fort de plus de5 000 collaborateursrépartis dans toute l'Europe. Nous accompagnons nos clients – grands groupes, PME ou start-ups – dans la réalisation de leurs projets industriels et technologiques, aussi bien dans le secteur public que privé.Nos domaines d'intervention couvrent...
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Ingénieur méthodes/maintenance
il y a 2 semaines
Strasbourg, Grand Est, France EFOR Temps pleinDans le cadre de son développement, l'un de nos clients recherche un(e)Ingénieur Méthodes Maintenanceafin de renforcer son équipe. Rattaché(e) au Responsable Maintenance, votre mission consistera à améliorer la performance et à optimiser l'organisation de la maintenance via les outils deGMAO.Missions principales :Paramétrer et assurer...
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Ingénieur(e) d'Application Senior H/F
il y a 1 semaine
Strasbourg, Grand Est, France Quest for change Temps pleinLien pour une candidature en ligne : À PROPOS DE FUTURAILFuturail est une startup deeptech qui développe les briques technologiques d'autonomie pour les trains autonomes. Notre mission est de faire du rail le mode de transport le plus attractif, en permettant des services fréquents, fiables et bas-carbone grâce à la technologie de conduite autonome.Avec...
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Agent polyvalent H/F
il y a 3 jours
Strasbourg, Grand Est, France Bio67 - Bio Sphère Temps pleinAgent Polyvalent H/FOUILAB – BIO SPHERE est un laboratoire de biologie médicale multi-sites composé à ce jour de plus de 40 laboratoires implantés dans le Bas-Rhin. Nous nous sommes développés au fil des ans de par la volonté des biologistes de mettre en commun tous les moyens possibles pour offrir à nos patients la meilleure qualité de service...
