Post-Doctorant F/H Biophysique computationnelle

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Post-Doctorant

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

The Inria research centre in Lyon is the 9th Inria research centre, formally created in January 2022. It brings together approximately 300 people in 17 research teams and research support services.

Its staff are distributed in Villeurbanne, Lyon Gerland, and Saint-Etienne.

The Lyon centre is active in the fields of software, distributed and high-performance computing, embedded systems, quantum computing and privacy in the digital world, but also in digital health and computational biology.

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d'un partenariat

• non pertinent,

Le poste est à pourvoir au sein de l'équipe MOSAIC de l'Inria. L'activité scientifique de l'équipe s'articule autour de la

modélisation mathématique et de la simulation numérique dans le domaine de la biologie du développement végétal.

Le poste est à pourvoir dans le cadre du projet MorphosysTens financé par le

programme Explorae de l'Inrae. L'objectif du projet est de combiner les formalismes de la

morphoélasticité avec la biologie des systèmes.

Mission confiée

Sous la supervision d'Olivier Ali (chercheur à l'Inria), les deux principales tâches du jeune chercheur recherché

seront (i) de développer un formalisme mathématique pour adapter une approche systématique

aux équations différentielles à base de tenseurs et (ii) de réaliser des simulations numériques (FEM) pour

simuler la morphogenèse des tissus végétaux en croissance. Les développements théoriques et numériques

seront appliqués à l'étude de la morphogenèse des graines chez la plante modèle

Arabidopsis thaliana, en étroite collaboration avec les biologistes du laboratoire d'accueil.

Les simulations numériques seront réalisées à l'aide de la bibliothèque python dédiée basée sur la MEF

BVPy, développée par l'équipe d'accueil.

Pour plus de contexte et de détails :

Site web de l'équipe : MOSAIC et site web du laboratoire de biologie d'accueil : RDP.

Bibliothèque BVPy V1.0 : publication dans le Journal of Open Source Software et dépôt gitlab.

Collaboration :

Le candidat retenu sera supervisé par Olivier Ali, en étroite collaboration avec les

ingénieurs de recherche de l'équipe d'accueil et en interaction avec les biologistes du laboratoire d'accueil

.

Principales activités

Dérivation théorique de motifs régulateurs à partir des principes fondamentaux de la biophysique, pertinents dans le

contexte de la morphomécanique des tissus végétaux.

Mise en œuvre de simulations numériques basées sur la méthode des éléments finis (FEM), inspirées des résultats expérimentaux.

Interprétation des résultats de simulation à la lumière des développements théoriques susmentionnés.

Activités secondaires :

Activités d'enseignement et de formation (non obligatoires).

Compétences

Compétences techniques :

• Expertise en géométrie différentielle
• Expertise en calcul scientifique
• Connaissance du FEM Langues : anglais français (facultatif, mais peut être utile pour les interactions quotidiennes et informelles)

Autres compétences : expérience avec les outils de programmation modernes (IDE, gestion des versions...) Présidence de réunions scientifiques

Avantages

• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
• Accès à la formation professionnelle
• Sécurité sociale

Rémunération

2788 € gross salary / month

Informations générales

• Thème/Domaine : Biologie numérique

Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A)
- Ville : Lyon
- Centre Inria : Centre Inria de Lyon
- Date de prise de fonction souhaitée :
- Durée de contrat : 1 an, 6 mois
- Date limite pour postuler :

Attention: Les candidatures doivent être déposées en ligne sur le site Inria. Le traitement des candidatures adressées par d'autres canaux n'est pas garanti.

Consignes pour postuler

Sécurité défense :

Ce poste est susceptible d'être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n° relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L'autorisation d'accès à une zone est délivrée par le chef d'établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l'arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l'annulation du recrutement.

Politique de recrutement :

Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

Contacts

• Équipe Inria : MOSAIC
• Recruteur :

Ali Olivier /

L'essentiel pour réussir

Nous recherchons un candidat hautement motivé, possédant une solide formation en mathématiques appliquées

et/ou en informatique. Le candidat retenu aura une expertise dans les méthodes numériques

pour le calcul scientifique. L'équipe MOSAIC travaillant principalement en collaboration,

nous attendons également du candidat qu'il ait l'esprit d'équipe et qu'il s'épanouisse dans les projets collectifs.

Notre environnement de travail et notre domaine scientifique sont par essence multidisciplinaires, c'est pourquoi nous attendons du candidat qu'il fasse preuve d'une

véritable curiosité scientifique, en particulier envers les sciences de la vie.

A propos d'Inria

Inria est l'institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l'interface d'autres disciplines. L'institut fait appel à de nombreux talents dans plus d'une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d'appui à la recherche et à l'innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'efforce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.

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