Ingénieur de recherche hospitalier en bactériologie et virologie

Le Centre Hospitalier Universitaire d'Orléans, situé à une heure de Paris, est un établissement de santé d'envergure universitaire. Établissement support du Groupement Hospitalier de Territoire des hôpitaux du Loiret, le CHU d'Orléans est doté de services de hautes spécialités, d'un plateau technique performant et d'équipements de pointe : Robot chirurgicaux, salle bi plan, appareils d'imagerie innovants.... Il offre une prise en charge de qualité pour les soins de proximité et de recours sur l'ensemble du territoire du Loiret. Plusieurs centres de formation, un centre de simulation, 12 filières de cancérologie, maternité de niveau 3 et 8 centres de compétences maladies rares pour enfants et adultes en font un établissement de référence.

Le CHU d'Orléans, établissement Haute Qualité Environnementale installé depuis 2015 dans ses nouveaux locaux, se compose de 1300 lits et places. Il regroupe sur un site unique les activités de court et de moyen séjour tout en conjuguant évolutivité et modernité ( locaux modernes, climatisés, équipement de prévention des troubles musculo squelettiques…) Avec plus de 5000 agents, dont 700 médecins, le CHU d'Orléans est doté de plus de 40 services, répartis-en 11 pôles cliniques et médico-techniques.

L'établissement se compose de l'Hôpital de la Source, d'un dispensaire en centre-ville (Vaccination, PASS, CEGGID) et d'un site de chirurgie nommé site Jeanne d'Arc à Gien . Il gère également 3 établissements d'accueil des personnes âgées : la résidence du Bois Fleuri, la résidence Pierre Pagot et la résidence des Ecureuils.

Description de la mission :

Rejoignez le CHU d'Orléans, un hôpital en pleine universitarisation, engagé dans la transition écologique, acteur de son territoire en faveur de ses patients et de ses professionnels Orléans, ville dynamique, capitale de la région Centre Val-de-Loire, offre un cadre de vie agréable (bords de Loire, châteaux de la Loire, Sologne…) à 1h de Paris.

Les missions qui vous attendent en quelques mots ?

Au sein de l'équipe de bactériologie et virologie, vous participerez au développement de recherches innovantes dans le champ de la persistance des infections bactériennes et virales. Vous aurez pour mission de mettre au point des techniques spécialisées de biologie moléculaire et de microbiologie et de coordonner la réalisation de ces techniques dans le cadre de projets de recherche sous la responsabilité des investigateurs hospitalo-universitaires. Vous participerez à l'interprétation, à la mise en forme des résultats (analyses statistiques…) et à leur valorisation.

Vous serez en charge de :

• développer et conduire des approches de biologie moléculaire (préparation d'acides nucléiques, qPCR, ddPCR, préparation de librairies, séquençage à haut débit PacBio), de virologie (culture cellulaire…) et de bactériologie (culture, comparaison de souches, étude de la transmission de la résistance aux antibiotiques), rédiger les protocoles techniques ;
• analyser et mettre en forme les données ;
• former les stagiaires aux différentes techniques et encadrer les techniciens ;
• assurer la veille technologique des techniques moléculaires et leur adaptation ;
• participer à la vie de l'équipe (gestion des stocks et des commandes, …).

À terme, vous deviendrez la personne référente des savoir-faire technologiques et compétences en biologie moléculaire pour l'équipe.

Vous serez amené à réaliser une partie de vos activités en conditions confinées de niveau BSL2 et BSL3.

L'équipe que vous allez rejoindre

L'équipe travaille sur les infections microbiennes persistantes. Elle mène des études innovantes sur le VIH, dans le contexte de recherche de stratégies de rémission de l'infection, par l'étude des réservoirs viraux qui sont le principal obstacle à l'éradication. Elle s'intéresse également à l'émergence de la résistance aux antibiotiques par des approches in vitro dynamiques de modélisation de la transmission de la résistance, en particulier au sein du microbiote digestif.

Toutes ces études s'appuient sur les cohortes de patients prises en charge au CHU.

L'équipe du laboratoire est composée de 5 personnes auxquelles sont associés quatre cliniciens de réanimation et d'infectiologie. Elle accueille des étudiants de Master1, Master 2 et thèse de Doctorat au sein de locaux neufs de 450 m2. Le laboratoire est doté d'équipements de biologie moléculaire (qPCR, ddPCR, séquenceur à haut débit PacBio…) et de bactériologie (chambre anaérobie, système Hollow Fiber, infrarouge biotyper…).

Les particularités du poste :

• Horaires du poste et rythmes de travail : contrat cadre (25 CA, 19 RTT).
• Type de poste : CDI
• Possibilité de télétravail ponctuel en fonction des missions.
• Date de début souhaité : dès que possible
• Rémunération : en fonction de l'expérience et du profil.

Les petits + du CHU d'Orléans :

• Une politique sociale dynamique : possibilité de place dans les crèches du CHU et de la métropole, accès au self de l'établissement …
• Un accès aux CGOS et à ses nombreux avantages : chèques vacances, billets de spectacle, chèques loisirs…
• Un engagement en faveur de la transition écologique : prise en charge à 75% de l'abonnement transport en commun, éligibilité au forfait mobilité durable pour l'usage du vélo ou du covoiturage, politique de réduction des émissions de gaz à effet de serre…

Contacts :

Pr Véronique AVETTAND-FENOEL, PU-PH Virologie

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Pr Etienne CARBONNELLE, PU-PH Bactériologie

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Profil recherché :

• Ce poste est fait pour vous si :

• Vous êtes ingénieur de recherche avec expérience ou titulaire d'un master 2 et d'une thèse de sciences, dans les domaines de la biologie moléculaire et de la microbiologie, avec des connaissances théoriques en génétique microbienne, virologie, bactériologie.

• Vous disposez d'une solide expérience professionnelle, en particulier en séquençage à haut débit ; vos compétences en bioinformatique et en statistiques seront également valorisées.
• Vous êtes rigoureux, dynamique et autonome, avec une bonne capacité à vous organiser et à exécuter des expériences de manière indépendante.
• Vous souhaitez travailler au sein d'une équipe pluridisciplinaire disposant de compétences diversifiées, et contribuer à la formation de vos collègues sur vos domaines de compétences.
• Vous maitrisez l'anglais.
• Vous possédez des notions de règlementation en matière d'hygiène et de sécurité.

Horaires : Horaires normaux

Période de la journée : Jour

Contrat à durée indéterminée, Contrat à durée déterminée