Stage - Amélioration de l'algorithme d'analyse de PCR multiplexées

LA SOCIÉTÉ

BforCure est une PME française créée en 2018 dont la mission est de révolutionner les technologies de bio-détection dans le but ultime de faire de notre planète un lieu plus sûr face aux menaces biologiques.

Dans cet objectif, l'entreprise conçoit, produit, et commercialise des solutions innovantes de bio-détection pour la recherche, la défense et l'industrie agro-alimentaire.

Reconnue et soutenue par des acteurs clés de l'innovation, BforCure fait évoluer les méthodes de biodétection en développant une plate-forme technologique au programme de R&D ambitieux, en rupture avec l'état de l'art. Il met la microfluidique au service du diagnostic médical, de la défense, de l'industrie et de la protection de l'environnement.

La concrétisation du projet BforCure nécessite aujourd'hui de construire une « Machine produisant de manière fortement automatisée des solutions innovantes ».

CULTURE & VALEURS

Fort de sa culture à la croisée du software, du hardware et de la biologie moléculaire, BforCure inscrit son organisation dans la vision moderne de l'industrie 4.0. L'entreprise vise l'excellence opérationnelle à tous les niveaux par la convergence des technologies, l'intégration verticale et la digitalisation de tous les processus de l'entreprise.

Vous rejoindrez une équipe multiculturelle de passionnés, unie et investie pour révolutionner le domaine du diagnostic in vitro.

S'engager avec BforCure signifie donner le meilleur, entouré de collègues qui appliquent leur savoir-faire avec rigueur et se dépassent dans un environnement d'excellence international encadré par un management bienveillant où le respect et l'entraide règnent.

S'engager avec BforCure signifie être un acteur habité par l'idée de changer le statu quo, à la hauteur des plus grandes ambitions technologiques et scientifiques.

Dans le cadre d'un stage, vous rejoindrez une équipe dynamique, unie et investie pour révolutionner le domaine de la sécurité biologique.

Vous travaillerez dans un environnement essentiellement composé d'ingénieurs et de scientifiques, et encadré par un management bienveillant qui prend soin de ses équipes.

Les langues de travail sont le français et l'anglais.

Contexte
Dans le cadre de l'évolution de ses solutions d'analyse de données en biologie moléculaire, l'entreprise développe des algorithmes permettant de suivre et d'interpréter des réactions de PCR multiplexées intégrées à des produits industriels.

L'algorithme actuel permet de déterminer l'avancement de la réaction de PCR pour chaque espèce détectable par un kit de PCR multiplexé. L'objectif de ce stage est de faire évoluer cet algorithme afin d'augmenter le nombre d'espèces détectables par un même kit, tout en garantissant des propriétés essentielles pour un usage industriel : explicabilité des résultats, robustesse au bruit de mesure et résistance à la variabilité inhérente à la biologie moléculaire.

Le ou la stagiaire travaillera au sein de l'équipe R&D algorithmique et en synergie avec l'équipe R&D biologique.

Objectifs du stage

• Faire évoluer l'algorithme existant afin d'augmenter le nombre d'espèces détectables par un kit de PCR multiplexé.

• Garantir le caractère explicable de l'algorithme afin de faciliter son appropriation par les équipes R&D et les utilisateurs.

• Renforcer la robustesse de l'algorithme face aux bruits de mesure et à la variabilité des données expérimentales.

• Limiter le nombre d'expériences nécessaires à l'apprentissage et à la validation robuste de l'algorithme.

• Contribuer à l'industrialisation du code et à son intégration dans un produit existant.

Missions

• Analyse de l'algorithme existant et identification des limites liées à l'augmentation du nombre d'espèces détectables par un kit de PCR.

• Conception et implémentation d'améliorations algorithmiques adaptées à l'analyse de données issues de PCR multiplexées.

• Développement et amélioration d'outils d'apprentissage permettant à l'équipe R&D bio et aux clients de développer des kits en autonomie.

• Développement d'outils de visualisation de données visant à mieux comprendre et évaluer la dynamique des signaux produits par la PCR.

• Validation des performances de l'algorithme sur des données expérimentales, en lien avec l'équipe R&D biologique.

• Contribution à un code de qualité industrielle, maintenable et documenté.

Profil recherché

• Étudiant(e) en école d'ingénieur.

• Spécialisation ou fort intérêt pour la data science et/ou la bioinformatique.

• Bonne maîtrise de Python et des bibliothèques classiques de data science.

• Intérêt pour l'analyse de données et les problématiques liées aux signaux expérimentaux.

• Capacité à travailler en interaction avec des profils pluridisciplinaires.

• Rigueur, autonomie et intérêt pour des développements à vocation industrielle.

Modalités

• Stage de 4 à 6 mois.

• Début souhaité à partir de mars.

• Localisation : Montreuil (93).