Scientifique expert(e) en Génomique H/F

TreeFrog Therapeutics est une biotech innovante dont le but est de rendre les thérapies cellulaires accessibles à des millions de patients, grâce à la technologie C-StemTM. TreeFrog propose une approche unique dans le développement de thérapies cellulaires, réunissant des biophysiciens, des biologistes cellulaires et des ingénieurs en bioproduction pour relever les défis de l'industrie - produire et différencier des cellules de qualité à une échelle sans précédent, de manière rentable. Depuis sa création en 2018, TreeFrog Therapeutics développe ses propres programmes thérapeutiques tel que Parkinson et des partenariats avec des acteurs biotechnologiques et industriels de premier plan dans d'autres domaine tel que Vertex.

Chez TreeFrog, nous cultivons une culture de confiance et collaboration, où l'entraide et l'échange d'idées sont au cœur de chaque projet. Nous croyons fermement que l'innovation naît de la diversité et de l'engagement de chacun. Ici, la curiosité est encouragée, les idées sont écoutées. Travailler chez TreeFrog, c'est évoluer dans un cadre fun et stimulant, où l'excellence scientifique va de pair avec l'esprit d'équipe et le respect mutuel.

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En lien permanent avec les équipes dédiées à la Recherche et au Développement de procédé de TreeFrog, et au sein de l'équipe de Développement Analytique, vous aurez en charge l'exécution des activités de développement de méthodes de biologie moléculaire (dPCR, qPCR) et de suivi des prestations externes de séquençage génomique et dPCR, afin de caractériser les cellules iPSC cultivées en 2D et 3D, et produits de thérapie cellulaire développés par Treefrog.

Vos principales activités seront :

Développement des méthodes

• Compréhension et définition au cas par cas des besoins des équipes de Recherche et Développement en matière d'analyses en dPCR/qPCR et en séquençage pour le suivi de l'intégrité génomique des cellules pluripotentes et des produits issus de culture cellulaire
• Développement des méthodes analytiques dPCR/qPCR adaptées aux projets, au regard des besoins des équipes, des exigences réglementaires et de la littérature scientifique existante
• Participation à la veille technologique concernant de nouvelles méthodes analytiques et à la mise en place de nouvelles méthodes dans le domaine de la biologie moléculaire-génomique, y compris la recherche de sous-traitants pour la partie séquençage

Réalisation des analyses

• Mise en place de l'activité dPCR/qPCR pour support en routine au laboratoire

o Respect du système de traçabilité des expériences et de leurs résultats

o Respect des règles EHS et de marche en avant du laboratoire

o Retour d'expérience sur les protocoles existants dans une démarche d'amélioration continue des méthodes analytiques

• Suivi de la sous-traitance des analyses de séquençage (Optical Genome Mapping - Bionano, Whole Genome Sequencing long read – PacBio, Whole Exome Sequencing short read - Illumina) et des analyses externalisées en ddPCR:

o Suivi de la réalisation des analyses en respectant le cahier des charges et les délais définis avec les équipes

o Suivi des rendus de résultats analytiques (forme directe et/ou rapport et/ou système de reporting).

o Suivi des contrats de confidentialité, des envois d'échantillons, des données brutes et de la facturation de ces prestations

o Collaboration étroite avec la manager du pôle Bio-informatique pour le rendu de résultat de séquençage

• Reporting et force de proposition dans les équipes projets dédiés

De formation initiale ingénieur en biologie ou PhD en biologie moléculaire et/ou génétique ou formation équivalente, vous justifiez d'une expérience professionnelle minimum de 5 ans dans un poste équivalent de scientifique/ingénieur en développement ciblé sur l'analyse en dPCR/qPCR et/ou le séquençage d'ADN humain.

Vous maîtrisez les techniques d'extraction d'ADN, de contrôle qualité ainsi que la technique de dPCR/qPCR et avez de l'expérience de déploiement de ces techniques pour des applications dans le cadre des cultures de cellules pluripotentes.

Idéalement, vous avez de l''expérience sur la technologie dPCR de Stilla Technologies (système Nio/ Chip Ruby).

Vous maitrisez les méthodologies de préparation et d'analyse du génome humain, idéalement OGM (Bionano) et séquençage Long read (PacBio)/Short read (Illumina). Vous êtes à l'aise dans l'utilisation et la recherche d'informations à l'aide de bases de données telles que NCBI, Ensembl, UCSC ou autres afin de comprendre et interpréter les possibles conséquences fonctionnelles d'éventuels variants identifiés.

Des connaissances (théoriques et pratiques) en bio-informatique seraient un atout.

La maîtrise de l'anglais (écrit et oral) est un requis dans une équipe à vocation internationale.

Nous cherchons une personne passionnée par la compréhension des mécanismes biologiques, et leur interprétation au travers des méthodes analytiques. Autonome et orienté résultat, vous mettez tout œuvre pour respecter et comprendre les enjeux des projets. La rigueur et la flexibilité du travail en laboratoire sont des atouts nécessaires pour ce poste.

L'intérêt pour l'analyse statistique des données et le sens de la satisfaction client sont deux qualités indispensables pour réussir.

Rodé(e) aux environnements en changement constant (type start-up), vous êtes force de proposition et êtes reconnu(e) pour vos capacités à travailler en équipe pluridisciplinaire, et à vous adapter (au plan technique et relationnel). Vous avez également l'habitude de travailler transversalement avec des experts biologistes : welcome on board

Conditions :

Contrat : CDD 12 mois

Début : Dès que possible

Lieu de travail : 31 Rue Thomas Edison, 33610 Canéjan, France

Flexibilité du travail : Télétravail possible

Avantages :

Aide au déménagement : Si vous n'habitez pas proche de Bordeaux, nous pouvons vous accompagner dans vos recherches de logement via une enveloppe financière

• Mobilité durable : Nous faisons la promotion d'une mobilité douce grâce à notre partenaire qui propose une solution pour aider nos collaborateurs dans l'achat d'un vélo et Karos qui est une solution de covoiturage et nous remboursons l'ensemble des abonnements liés au transport à hauteur de 50%

Empreinte environnementale : TreeFrog souhaite sauver des vies mais aussi participer à la sauvegarde de notre planète. Plusieurs de nos collaborateurs travaillent ensemble à la réduction de nos déchets et de nos émissions carbones. Nous avons par exemple un frigo connecté zéro déchet.

Sport : des cours de Crossfit, d'Afrofit et de Yoga sont proposés plusieurs fois par semaine dans nos locaux

Restauration : Nous proposons des tickets restaurant de 9€80 pris en charge à 60% par l'employeur. Nous avons aussi plusieurs solutions de livraisons pour des repas de qualité et à petits prix dans nos locaux.