Ingénieur
il y a 2 semaines
Contexte
Situé au cœur de la ville d'Angers et du Campus santé, le CHU d'Angers met en œuvre et exploite un entrepôt de données de santé. En charge de l'exploitation de cet entrepôt, le CDC a pour objectifs de contribuer à l'amélioration des soins par l'analyse et la réutilisation des données médicales et leur mise à disposition des chercheurs cliniciens dans un cadre sécurisé et dans le respect de la réglementation. Le CDC intervient sur des projets de recherche régionaux et nationaux.
Pour le développement de cette activité, le Département Sciences de la Donnée de la Direction de la Recherche et Innovation du CHU d'Angers (DRI) recrute un ingénieur en traitement automatique du langage (TAL).
Responsabilités
Développer et mettre en œuvre des méthodes d'analyse et de modélisation pour exploiter le langage naturel et les données textuelles issues des comptes rendus (CR) et bases structurées, dans le but d'en extraire des concepts, et automatiser la compréhension des documents.
- Extraction et qualification de concepts à partir de textes et données structurées (ex. pathologies, traitements, observations).
- Enrichissement sémantique des données via des graphes de connaissances, lexiques métiers, embeddings ou ontologies médicales.
- Classification automatique de documents (
machine learning, deep learning
, LLM) selon des typologies définies. - Préparation, nettoyage et annotation de corpus pour entraîner des modèles NLP (NER, text classification, relation extraction…).
- Évaluation et benchmark des modèles (Hugging Face, spaCy, modèles propriétaires, etc.).
- Data visualization
et restitution claire des résultats auprès des équipes métier et recherche. - Contribution aux études complexes mêlant texte, données structurées et raisonnement statistique.
Qualifications
- Langage : Python (Pandas, Scikit-learn, PyTorch, Transformers, spaCy, NLTK).
- Data engineering léger : SQL, manipulation de données textuelles volumineuses.
- Outils NLP : Hugging Face, spaCy, fastText, embeddings (Word2Vec, BERT, etc.).
- MLOps basique : MLflow, Streamlit, API REST pour servir des modèles (souhaité).
- DataViz : Plotly, Matplotlib, ou équivalent.
- Connaissance des ontologies médicales ou terminologies métier (SNOMED, UMLS…) (souhaité)
Profil Recherché
- Formation Bac+5 / PhD en Data Science, Informatique, TAL ou domaine équivalent.
- Expérience confirmée (ou stage solide) en NLP appliqué à des données métier.
- Capacité à passer du besoin métier à la mise en production d'un modèle.
- Capacité à travailler en équipe, à gérer la mise en œuvre d'un projet et sa documentation technique.
- Curiosité, rigueur scientifique, sens de la communication.
Vous intégrerez une équipe jeune et dynamique
actuellement composée de 4 ingénieurs (2 ingénieurs data, 2 data scientist).
La Coordination Scientifique est assurée par un Professeur des Université en Biostatistique (PU-PH).
Un Médecin, Maitre de Conférence des Universités assure la coordination Médicale (MCU-PH)
L'équipe d'ingénieurs est encadrée par un ingénieur DRI/DSN chevronné et par le coordonnateur chargé des opérations.
L'équipe du CDC fait partie du réseau RiCDC des 5 CDC
du grand Ouest (Angers, Brest, Nantes, Rennes et Tours). Au sein de ce réseau des partages d'expériences et de connaissances techniques, scientifiques, et méthodologiques sont régulièrement organisés
Procédure de candidature
Les candidatures sont à envoyer uniquement via le lien suivant :
https://chu-
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