Ingénieur de Recherche en Bioinformatique

il y a 1 mois


GifsurYvette, France CNRS Temps plein

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F) – Génomique
Référence : UMR9198-CHLGIR-009
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : mercredi 17 avril 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 10 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Salaire brut mensuel entre 2 866€ à 3 029€ selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Missions

L’ingénieur en bioinformatique aura pour mission de mener un projet d’analyse de données génomiques (ADN et ARN) dans le cadre d’un projet sur la régulation de la formation des crossovers méiotiques chez le champignon filamenteux Sordaria macrospora.

Activités

Concevoir et réaliser des développements bioinformatiques et de biostatistiques :
- Assemblage de novo d'un génome de champignon (35Mb) à partir de données Illumina et PacBio/Nanopore
- Annotation du génome grâce à des données de RNA-seq chez le sauvage
- Analyse de données RNA-seq chez des mutants
- Définir, mettre en œuvre et mettre à jour un Plan de Gestion de Données (PGD)
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, présentations orales
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique

Compétences

-Formation en bioinformatique
-Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ADN
-Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ARN
-Expérience en biostatistiques
-Gestion de workflow
-Rigueur et autonomie
-Connaissances des règles FAIR de reproductibilité
-Connaissances en génomiques et génétiques (transcription, recombinaison)
-Langue anglaise : Niveau A1
-Sens des responsabilités
-Bonne capacité de communication, notamment avec des non bioinformaticiens
-Excellentes qualités relationnelles.

Contexte de travail

L'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) est une très grande unité mixte de recherche CNRS, CEA et Université Paris Saclay, situé sur le campus de recherche de Gif-sur-Yvette. Avec un effectif moyen de près de 650 personnes réparties entre 5 départements scientifiques, l'I2BC rassemble 60 équipes de recherche travaillant sur tous les aspects de la cellule, des constituants cellulaires jusqu'à l'interaction des cellules entre elles.
Le département Biologie des Génomes se focalise sur l'étude du matériel génétique. L’Équipe Appariement et Recombinaison Méiotique s'intéresse aux mécanismes moléculaires de la méiose, une étape clé de la reproduction sexuée. L’équipe est composée de 3 chercheurs et d’une ingénieure de recherche permanents, 2 étudiants en thèse, une post-doctorante et 2 ingénieurs en CDD.

Le projet, coordonné par deux chercheurs permanents, porte sur la caractérisation de différents acteurs régulant la formation des crossovers méiotiques, échanges réciproques d’ADN entre chromosomes homo- logues qui ont lieu pendant la méiose.

Nous utilisons pour ce faire deux organismes modèles : la plante Arabidopsis thaliana et le champignon filamenteux Sordaria macrospora.

Possibilité de restauration CNRS + remboursement partiel des frais de transport en commun.

Contraintes et risques

Pas d’astreinte d’horaires.



  • Saint-Sébastien-sur-Loire, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur en bioinformatique H/F Référence : UMR6286-LEITIR-008 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : NANTES Date de publication : mardi 7 mai 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 24 mois Date d'embauche prévue : 2 septembre 2024 Quotité de travail : Temps complet...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en géochimie isotopique appliquée aux études polaires (H/F) Référence : UMR8212-AMALAN-017 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : mercredi 15 mai 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 4 mois Date...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en géochimie isotopique appliquée aux carottes de glace (H/F) Référence : UMR8212-AMALAN-016 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : mardi 30 avril 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 8 mois Date...


  • Gif-sur-Yvette, France Synchrotron SOLEIL Temps plein

    Descriptif du poste - Nous recherchons un/un.e scientifique de ligne qui fera partie de l’équipe de ligne, composée de deux autres scientifiques et d’un assistant-ingénieur. Il.Elle aura l’opportunité de développer sa propre activité de recherche. Il.Elle sera encouragé.e à développer des collaborations et à attirer de nouveaux utilisateurs....


  • Gif-sur-Yvette, France Servier Temps plein

    Fondé pour servir la santé, Servier est un groupe pharmaceutique international gouverné par une Fondation, qui aspire à avoir un impact sociétal significatif pour les patients et pour un monde durable. Son modèle unique de gouvernance lui permet de servir pleinement sa vocation avec une vision à long terme : être engagé pour le progrès...


  • Gif-sur-Yvette, France INRIA Temps plein

    Contexte et atouts du poste Ce poste est proposé dans le cadre du projet Décysif ( un projet collaboratif qui vise à appliquer des méthodes formelles pour apporter des garanties de correction des programmes critiques pour la sureté et la sécurité. Ce projet réunit l'équipe Inria Toccata ( et des partenaires industriels dont les sièges sont...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France Cea Temps plein

    Vous rejoindrez l'équipe du projet SUPRAFUSION qui a pour ambition de démontrer la faisabilité technologique à grande échelle d'une bobine de machine de fusion thermonucléaire en conducteur supraconducteur haute température (HTc) .En tant qu'ingénieur, vous intégrez l'équipe responsable de l'alimentation et de la protection de la bobine.Votre serez...

  • ingenieur radio frequence

    il y a 2 jours


    Gif-sur-Yvette, Île-de-France Cea Temps plein

    Le DACM/Lisah recherche pour l'avant-projet ICONE qui consiste à l'étude d'une nouvelle source nationale de diffusion neutronique basée sur un accélérateur de protons, un ingénieur spécialisé dans les systèmes radiofréquence pour accélérateurs de particules. Il devra prendre en charge le design de certains composants RF clés de ce nouvel...


  • Gif-sur-Yvette, France Cea Temps plein

    Vous rejoindrez l’équipe du projet SUPRAFUSION qui a pour ambition de démontrer la faisabilité technologique à grande échelle d’une bobine de machine de fusion thermonucléaire en conducteur supraconducteur haute température (HTc) .En tant qu’ingénieur, vous intégrez l’équipe responsable de l’alimentation et de la protection de la...

  • CDD Ingénieur transfert H/F

    il y a 3 semaines


    Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : CDD Ingénieur transfert H/F Référence : UMR9198-CHROUL1-114 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : jeudi 25 avril 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 36 mois Date d'embauche prévue : 1 août 2024 Quotité de travail : Temps...


  • Gif-sur-Yvette, France KYOCERA Document Solutions France Temps plein

    ESUS , Intégrateur de solutions documentaires met à disposition de ses clients des compétences transversales et peut ainsi proposer des produits et services s’articulant autour de 3 axes principaux : Le conseil, l’audit et la formation appliqués aux systèmes d’information L’informatique et réseau : proposition de solutions complètes ...


  • Gif-sur-Yvette, France KYOCERA Document Solutions France Temps plein

    ESUS , Intégrateur de solutions documentaires met à disposition de ses clients des compétences transversales et peut ainsi proposer des produits et services s’articulant autour de 3 axes principaux : Le conseil, l’audit et la formation  appliqués aux systèmes d’information L’informatique et réseau : proposition de solutions...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur d’étude en Biochimie/Biologie Cellulaire (H/F) Référence : UMR9198-CECSAU-015 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : samedi 4 mai 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 1 septembre 2024...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Ouverte aux titulaires et CDI CNRS & fonction publique Intitulé de l'offre : Ingénieur-e de prévention des risques H/F Référence : UAR2206-MOBINT-Z52004 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Institut : INC - Institut de chimie Date de publication : vendredi 3 mai 2024 Session : Campagne Printemps 2024 Groupe de Fonction :...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de projets européens H/F Référence : MOY400-STERIG-296 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : mercredi 15 mai 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 36 mois Date d'embauche prévue : 10 juillet 2024 Quotité de travail :...


  • Gif-sur-Yvette, France KYOCERA Document Solutions France Temps plein

    ESUS, Intégrateur de solutions documentaires met à disposition de ses clients des compétences transversales et peut ainsi proposer des produits et services s’articulant autour de 3 axes principaux : Le conseil, l’audit et la formation appliqués aux systèmes d’information L’informatique et réseau : proposition de solutions complètes ...


  • Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Informations générales Ouverte aux titulaires et CDI CNRS & fonction publique Intitulé de l'offre : Assistant-e ingénieur-e en Electronique sur les projets en développements d'instruments embarqués H/F Référence : UAR855-MOBINT-Z58004 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Institut : INSU - Institut national des sciences de l'univers Date de...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France Cea Temps plein

    L'Europe se prépare à l'arrivée des premiers super-calculateurs exaflopiques, dont un en France, au CEA, dès 2025 Votre mission : Au sein d'une nouvelle équipe agile qui se met en place, vous travaillerez en collaboration avec l'écosystème français (notamment NumPEx) et européen autour du HPC et avec les équipes en charge du développement de...

  • Ingénieur expert C++

    il y a 2 semaines


    Gif-sur-Yvette, France Cea Temps plein

    L’Europe se prépare à l’arrivée des premiers super-calculateurs exaflopiques, dont un en France, au CEA, dès 2025 !Ces machines seront hétérogènes, accélérées par des GPUs de marques et d’architectures variées. Assurer performance et portabilité dans ces conditions constitue certainement l'un des plus grands challenges de l’Exascale....


  • Gif-sur-Yvette, France Danone Temps plein

    Short Intro and About the Job Plus de 92% de nos stagiaires et alternants recommandent de faire leur stage, leur alternance ou leur VIE chez Danone (source Happy Trainees). Et si c’était toi notre prochain stagiaire Ingé Packaging ? REJOINDRE DANONE : C’EST…   Rencontrer des Danoners aux personnalités singulières et aux parcours...