Ingénieur IA en alternance

il y a 4 semaines


Orléans, France CNRS Temps plein

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur IA en alternance (H/F)
Référence : UPR4301-LAELEG-033
Lieu de travail : ORLEANS
Pays : France
Date de publication : vendredi 24 mai 2024
Type de contrat : Contrat d'apprentissage
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 septembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération :
Niveau de diplôme préparé : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Description du poste

L’apprenti aura la charge de mettre en place un pipeline automatisé pour la prédiction des structures 3D de protéines et de complexes protéiques à l'aide de programmes utilisant des réseaux de neurones profonds (Alphafold2, trRosetta, …). Dans un premier temps, l’apprenti sera formé aux bases de la science des protéines et de l’analyse bio-informatique des séquences d’ADN et protéines. Le travail consistera ensuite à générer des scripts pour le formatage des fichiers d'entrées, pour l'exécution des programmes d’IA sur des entrées multiples, et pour l'analyse d’un volume conséquent de résultats. L'apprenti s'intéressera non seulement à l'utilisation des procédures de « machine learning » mais également à ses fondements. Il devra étudier comment les programmes de prédiction de structure 3D utilisant l’IA ont été créé et comment améliorer leur performance en temps de calcul et de taux de succès. Le pipeline sera validé sur un ensemble de domaines protéiques humains appelés BTB, un motif structural sur lequel notre équipe de recherche travail actuellement.
L’apprenti participera également à la mise en place et la gestion d’un serveur de calcul GPU de dernière génération dédié au « machine learning » qui sera acheté prochainement.

Description de l'employeur

Le Centre National de la Recherche Scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation. Ses 10 instituts scientifiques couvrent tous les champs de la connaissance en biologie, physique, chimie, ingénierie, sciences humaines et sociales, mathématiques, écologie, sciences de l’information et sciences de l’univers.

Le CNRS emploie près de 32 000 personnes, dont plus de 11 000 chercheurs travaillant au sein de 1 144 laboratoires répartis sur tout le territoire national. Les 17 délégations régionales (DR) du CNRS ont un rôle de gestion et d’accompagnement de proximité de ces unités de recherche, en particulier dans le domaine des Ressources Humaines.
La personne recrutée travaillera au sein du Centre de Biophysique Moléculaire (CBM) , unité propre du CNRS d'environ 140 personnes qui développe des recherches à l'interface de la Chimie, de la Biologie et de la Physique qui s'intéressent aux mécanismes moléculaires du vivant et aux dysfonctionnements qui conduisent au développement de certaines maladies. L
La personne recrutée exercera ses activités au sein de l'équipe dirigée par Bertrand Castaing et Marcin Suskiewicz sous la responsabilité de Franck Coste, Ingénieur de revcherche.
Pour toute information complémentaire, il est possible de consulter le site Internet du CNRS : / et du CBM : http:///

Descriptif du profil recherché

Le candidat sélectionné devra avoir une licence en mathématiques/informatique, maîtriser le langage python mais n’a pas besoin d’avoir de connaissances en biochimie/biologie structurale.

Conditions particulières d'exercice

Néant

Langues

Anglais niveau B minimum


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