Postdoctorat en modélisation du microbiome marin

il y a 3 semaines

SaintSébastiensurLoire, France CNRS Temps plein

Informations générales

Intitulé de l'offre : Postdoctorat en modélisation du microbiome marin (H/F)
Référence : UMR6004-SAMCHA-006
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : NANTES
Date de publication : mardi 14 mai 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 8 juillet 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 3000 et 4000 EUR bruts mensuels selon expérience.
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Interactions, particules, noyaux du laboratoire au cosmos

Missions

Le plancton marin forme des communautés complexes d'organismes en interaction à la base de la chaîne alimentaire, soutenant les cycles biogéochimiques dans l'océan et participant à la régulation du climat. Les organismes planctoniques sont adaptés à des conditions environnementales spécifiques qui limitent leur biogéographie et leur écologie. Cependant, nos connaissances sont limitées quant à l'interaction des organismes planctoniques pour maintenir des communautés pérennes dans les océans en perpetuels homogénéisation par les courants. Par ailleurs, le rôle des interactions planctoniques dans la réalisation des grands cycles biogéochimiques, tel que la régulation de la pompe biologique à carbone, reste à modéliser et analyser pour une pleine intégration de la composante biologique dans les modèles océaniques. Pour relever ces défis, nous souhaitons développer des outils informatiques pour modéliser les communautés de microorganismes marins soutenant les cycles biogéochimiques (., cycle du carbone et de l'azote) et de simuler les échanges de métabolites sous jacents comme mécanismes de régulation de ces cycles.

Activités

Les principales tâches du projet seront de:
- Modéliser les communautés de microorganismes marins à l'échelle des génomes par des approches d'inférence de graphes de co-occurrence via des données de métagénomiques issues des récentes campagne océanographiques (Tara Oceans, Bio-GO-SHIP, CEODOS et AtlantECO) (tâche principale).
- Modéliser des réseaux métaboliques de ces organismes à l'échelle des génomes par des approches de programmation par contraintes ou multi-objective (tâche principale).
- Développer une approche intégrée de modélisation écologique et métabolique afin d'identifier des mécanismes conjoints façonnant l'assemblage de ces communautés planctoniques et des cycles biogéochimiques associés (tâche principale).
- Simuler numériquement et prédire les effets de multiples facteurs de stress climatique sur ces communautés en identifiant les espèces sentinelles sensibles aux variations (de température et nutriments) et ayant un impact sur d'autres organismes de la communauté (tâche secondaire).

Compétences

La candidate ou le candidat devra être titulaire d'un doctorat en (bio)informatique, en biologie computationnelle, en biostatistique ou dans des domaines connexes, avec des compétences en modélisation des systèmes biologiques.
- Expérience du séquençage à haut débit, de la métagénomique ou des analyses métatranscriptomiques d'ensembles de données à grande échelle.
- Une expérience avec les approches basées sur les réseaux et la modélisation métabolique à l'échelle du génome et des communautés.
- Expérience de l'analyse de données, des statistiques et de la visualisation, par exemple en Python ou en R.
- Des connaissances dans les méthodes d'apprentissage automatique.
- Une capacité à travailler de manière indépendante et en équipe, et à l'interface entre les sciences de la vie et l'informatique.
- Bonnes aptitudes à la rédaction et à la communication en anglais sont attendues ainsi qu'une aptitude au travail en équipe.

Contexte de travail

La candidate ou le candidat travaillera au sein de l'équipe ComBi du LS2N à Nantes, sur le site de l'UFR Sciences et Techniques.
Recrutement dans le cadre du projet européen (H2020) AtlantECO (/).

  • Postdoctorat en modélisation écologique du plancton pour la surveillance de la santé des océans

    il y a 1 mois

    Saint-Sébastien-sur-Loire, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Postdoctorat en modélisation écologique du plancton pour la surveillance de la santé des océans (H/F) Référence : UMR6004-SAMCHA-007 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : NANTES Date de publication : mardi 14 mai 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 24 mois Date d'embauche...

  • Technicien de Maintenance Electronique Marine F/H

    Il y a 2 mois

    Saint-Léonard, France VINCI Energies en France Temps plein

    Actemium Marine (anciennement Barillec Marine), entreprise de VINCI Energies, est un acteur majeur de l’énergie. Nous déployons notre expertise dans l’électricité, l’électronique, l’automatisme et la conversion d’énergie pour le secteur maritime. Vos missions : Rattaché(e) à l’ équipe de maintenance électronique de navigation ,...

  • Technicien de Maintenance Electronique Marine F/H

    il y a 2 semaines

    Saint-Léonard, France VINCI Energies en France Temps plein

    ⚓ Actemium Marine (anciennement Barillec Marine), entreprise de VINCI Energies, est un acteur majeur de l’énergie. Nous déployons notre expertise dans l’électricité, l’électronique, l’automatisme et la conversion d’énergie pour le secteur maritime. Vos missions : Rattaché(e) à l’ équipe de maintenance électronique de...

  • Postdoctorat (H/F): Conception par apprentissage automatique d'alliages pour le stockage de l'énergie solaire concentrée

    il y a 1 mois

    Saint-Martin-d'Hères, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Postdoctorat (H/F): Conception par apprentissage automatique d'alliages pour le stockage de l'énergie solaire concentrée Référence : UMR5266-GUIDEF-013 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : ST MARTIN D HERES Date de publication : mardi 7 mai 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat...

  • Etude Fonctionnelle Et Mesure de Conservation

    il y a 1 semaine

    La Roche-sur-Yon, France UMR CNRS GEPEA 6144 Temps plein

    **Etude fonctionnelle et mesure de conservation d’un microbiome d’une station d’épuration industrielle.**: - Réf - **ABG-110376** - Sujet de Thèse- 20/01/2023- Cifre- UMR CNRS GEPEA 6144- Lieu de travail- La Roche sur Yon - Pays de la Loire - France- Intitulé du sujet- Etude fonctionnelle et mesure de conservation d’un microbiome d’une station...

  • Un Agent Ecogarde Marine

    il y a 1 mois

    Golfe de Saint-Tropez, France CC du Golfe de Saint-Tropez Temps plein

    Filière **:Animation** Métier **:Environnement** Catégorie **:C** **Adjoint territorial d'animation-ATA** CDD **COGOLIN** **(Var 83)** **Contractuel** Expérience **:1 à 2 ans** Rémunération statutaire + régime indemnitaire Date limite **:20/03/2024** **Descriptif et missions**: UN AGENT ECOGARDE MARINE H/F **CC du Golfe de Saint-Tropez...

  • CDI-Ingénieur modélisation H/F

    Il y a 2 mois

    Ruelle-sur-Touvre, France Naval Group Temps plein

    Organisation NAVAL GROUP Nous sommes un acteur international dans l'industrie navale de défense depuis plus de 400 ans, repoussant continuellement les limites pour construire l'avenir. Nous recrutons des talents pour concevoir, réaliser et entretenir des produits exceptionnels tels que des sous-marins, des porte-avions et des frégates dont la...

  • Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor

    il y a 3 jours

    Saint-Germain-en-Laye, France RINA Temps plein

    RINA is currently recruiting for a Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor  to join its office in Paris  within the Marine North Europe Region Division. Mission A surveyor in a classification society plays a crucial role in ensuring the safety, compliance, and quality of ships and marine structures. The main responsibilities are aimed at...

  • Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor

    il y a 4 semaines

    Saint-Germain-En-Laye, France RINA Temps plein

    RINA is currently recruiting for a Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor to join its office in Paris within the Marine North Europe Region Division. Mission A surveyor in a classification society plays a crucial role in ensuring the safety, compliance, and quality of ships and marine structures. The main responsibilities are aimed at verifying that...

  • Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor

    il y a 1 semaine

    Saint-Germain-en-Laye, Île-de-France RINA Temps plein

    RINA is currently recruiting for a Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor to join its office in Paris within the Marine North Europe Region Division.MissionA surveyor in a classification society plays a crucial role in ensuring the safety, compliance, and quality of ships and marine structures. The main responsibilities are aimed at verifying that vessels...

  • Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor

    il y a 1 semaine

    Saint-Germain-En-Laye, France RINA Temps plein

    RINA is currently recruiting for a Bourcefranc le Chapus Marine Surveyor to join its office in Paris within the Marine North Europe Region Division. Mission A surveyor in a classification society plays a crucial role in ensuring the safety, compliance, and quality of ships and marine structures. The main responsibilities are aimed at verifying that...

  • CDI – Ingénieur Développement

    Il y a 2 mois

    Saint-Tropez, France Naval Group Temps plein

    Organisation NAVAL GROUP Nous sommes un acteur international dans l'industrie navale de défense depuis plus de 400 ans, repoussant continuellement les limites pour construire l'avenir. Nous recrutons des talents pour concevoir, réaliser et entretenir des produits exceptionnels tels que des sous-marins, des porte-avions et des frégates dont la...

  • CDI – Ingénieur Développement

    il y a 2 semaines

    Saint-Tropez, France Naval Group Temps plein

    Organisation NAVAL GROUP Nous sommes un acteur international dans l'industrie navale de défense depuis plus de 400 ans, repoussant continuellement les limites pour construire l'avenir. Nous recrutons des talents pour concevoir, réaliser et entretenir des produits exceptionnels tels que des sous-marins, des porte-avions et des frégates dont la...

  • Ingénieur de recherche DAS et sédiments H/F

    il y a 2 semaines

    Saint-Étienne, France Marine Nationale Temps plein

    La Marine nationale est une des composantes des forces armées qui dépend du ministère des Armées. Les équipages de nos bâtiments de surface, sous-marins, aéronefs, unités de fusiliers marins et commandos marine protègent les Français et défendent les intérêts de la France sur toutes les mers du monde, 24/24h, 365j/an. Choisir la Marine, c'est...

  • Alternance - Ingénieur Simulation Numérique H/F

    il y a 2 semaines

    SAINT TROPEZ, France Naval Group Temps plein

    Le site de Saint-Tropez accueille des activités d'étude, de conception, de construction et de maintenance de systèmes d'armes sous-marines et des systèmes associés : torpilles, contre-mesures et drones sous-marins.Naval Group, leader européen du naval de défense est l'un des rares industriels dans le monde capable de concevoir, réaliser...

  • Management de Projets Numériques

    il y a 2 semaines

    Saint-Mandrier-sur-Mer, France Marine Nationale Temps plein

    Le contrat de volontaire officier aspirant permet aux jeunes diplômés ou aux étudiants à la recherche d'une année de césure ou d'une première expérience professionnelle, de s'engager au sein de la Marine nationale pendant douze mois et d'y découvrir un environnement hors du commun. Les domaines de compétences recherchées sont très larges :...

  • Management de Projets Numériques

    Il y a 2 mois

    Saint-Mandrier-sur-Mer, France MARINE NATIONALE Temps plein

    **Activités principales**: - Mener des activités de recueil du besoin et conduite du changement ; - Evaluer/mettre au point des produits numériques de qualité à fort impact pour les usagers ; - Situer la transformation numérique et les grandes évolutions technologiques ainsi que leurs impacts sur la transformation des métiers ; - Rédiger et/ou...

  • RESERVISTE - Data analyst

    Il y a 2 mois

    Saint-Étienne, France Marine Nationale Temps plein

    La Marine nationale est une des composantes des forces armées qui dépend du ministère des Armées. Les équipages de nos bâtiments de surface, sous-marins, aéronefs, unités de fusiliers marins et commandos marine protègent les Français et défendent les intérêts de la France sur toutes les mers du monde, 24/24h, 365j/an. Choisir la Marine, c'est...

  • RESERVISTE - Data analyst

    Il y a 2 mois

    Saint-Brieuc, France Marine Nationale Temps plein

    La Marine nationale est une des composantes des forces armées qui dépend du ministère des Armées. Les équipages de nos bâtiments de surface, sous-marins, aéronefs, unités de fusiliers marins et commandos marine protègent les Français et défendent les intérêts de la France sur toutes les mers du monde, 24/24h, 365j/an. Choisir la Marine, c'est...

  • Stage Etude Du Flambement de Conduites Flexibles

    Il y a 2 mois

    Saint-Herblain, France Bureau Veritas Temps plein

    **Découvrez un projet qui vous correspond vraiment** Depuis près de 200 ans, Bureau Veritas Marine & Offshore est reconnue pour son expertise technique et sa fiabilité dans le monde entier. Nous sommes spécialisés dans la classification et la certification de navires, de structures offshores, de terminaux pétroliers et gaziers, ainsi que dans la...