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Ingénieur de Recherche
Il y a 2 mois
Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche (H/F) en biologie moléculaire du Plasmodium
Référence : UMR5294-ANTCLA-006
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 26 juillet 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2875 € brut mensuel ajustable selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Missions
Le paludisme tue un demi-million d'enfants par an, cependant dans les zones endémiques, la plupart des infections par Plasmodium falciparum restent asymptomatiques. Le but de notre recherche est de comprendre les mécanismes génomiques et transcriptomiques qui permettent à P. falciparum d'établir une infection chronique et asymptomatique chez l'homme. Nous testons des hypothèses basées sur des cultures in vitro avec des isolats de terrain collectés dans des pays endémiques. Plus spécifiquement, nous caractérisons comment le parasite échappe au système immunitaire en changeant régulièrement ses antigènes de surface.
Activités
Avec des collègues du Cameroun et du Ghana, nous avons récemment collecté une biobanque unique d'isolats de P. falciparum cryopréservés provenant d'individus symptomatiques et asymptomatiques. Nous visons à séquencer le génome et le transcriptome de ces parasites, y compris au niveau de la cellule unique (en collaboration avec l'Université de Copenhague et la London School of Hygiene & Tropical Medicine). En pratique, vous allez :
•Adapter certains isolats de P. falciparum à la culture in vitro
•Réaliser des extractions d'ADN et d'ARN du parasite
•Caractériser l'expression des gènes var par RT-PCR couplée au séquençage d'amplicons
•Déterminer la multiplicité de l'infection au sein de chaque isolat par séquençage d'amplicons d'ADN
•Utiliser la cytométrie en flux et SMARTseq pour séquencer le transcriptome du parasite
•Sélectionner des isolats adaptés à la culture pour l'expression de protéines spécifiques PfEMP1 avec des anticorps monoclonaux
•Passer les commandes de consommables et gérer le laboratoire au quotidien
•Optionnel : analyser les données en utilisant R
Compétences
•Essentiel : formation en biologie moléculaire/cellulaire
•Travail avec la rigueur nécessaire pour la culture cellulaire
•Connaissance en bioinformatique, génétique des populations et/ou phylogénétique est un plus
•Capable de travailler de manière autonome
•Bonnes compétences en communication en anglais
•Passionné par les découvertes scientifiques
•Participer activement à la vie du laboratoire et de l'institut
•Autres compétences souhaitables : connaissance de la biologie du paludisme, volonté de superviser occasionnellement un étudiant en Master
Contexte de travail
Antoine Claessens (PI) est un malariologue formé à l'Université d'Édimbourg, au Sanger Institute, à la LSHTM et au MRC-Gambie. Il a rejoint l'Université de Montpellier en 2018 en tant que “Chargé de Recherche INSERM” et dirige une équipe FRM, actuellement composée de quatre doctorants post-doctorants et d'un ingénieur permanent, avec un mélange de recherches en laboratoire et bioinformatique. Ce poste sera financé par un financement ANR.
Vous interagirez étroitement avec d'autres biologistes moléculaires et bioinformaticiens du LPHI, avec des contacts réguliers avec des scientifiques de MIVEGEC. Les deux ‘UMR’ sont très internationales, avec des scientifiques compétents et amicaux. Plus généralement, Montpellier est un grand centre de recherche en sciences de la vie, en particulier dans le domaine de la biologie évolutive. Parler français n'est pas une exigence. Vous rejoindrez une équipe jeune et dynamique. Je ferai de mon mieux pour transmettre ma passion pour la biologie de P. falciparum.
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