Réseau de neurones convolutifs pour la classification de signaux calciques astrocytaires dans des images 3D+temps de microscopie LLSM

il y a 1 mois


Rennes, France INRIA Temps plein

Contexte et atouts du poste

Les astrocytes sont des cellules gliales du système nerveux central qui sont récemment apparues comme des partenaires clés des neurones pour le traitement de l'information. Les signaux calciques astrocytaires sont impliqués dans de nombreuses fonctions cérébrales clés (par exemple, la mémoire et l'apprentissage), et leurs altérations peuvent conduire à des maladies du cerveau. Ces signaux présentent également une importante diversité spatio-temporelle, et on ignore encore si cette variabilité est liée à leur rôle dans des fonctions neurobiologiques distinctes. L'émergence récente de la microscopie à feuille de lumière en réseau (LLSM) permet maintenant une imagerie 3D en haute résolution spatio-temporelle de ces signaux. Malheureusement, la communauté manque actuellement d'outils d'analyse d'image pour détecter, segmenter et quantifier ces signaux dans les images LLSM.

Mission confiée

Dans ce contexte, nous développons actuellement un outil de traitement d'image pour les neurobiologistes qui 1) détecte et segmente les signaux calciques dans les images LLSM 3D+temps, et 2) classifie ces signaux sur la base de leur caractéristique morphologique 3D espace-temps. Pour ce faire, nous nous concentrons sur les réseaux convolutifs 3D non supervisés et les techniques d'apprentissage automatique.

Principales activités

Principaux objectifs :

Développement d’un CNN non supervisé pour classifier les différents types de signaux calciques Développement d’un plugin napari pour annoter des données 3D+temps

Compétences

Compétences techniques et niveau requis : Traitement et analyse d'images, deep learning (CNNs), Python, et Keras, Tensorflow ou Pytorch.



  • Rennes, Bretagne, France Orange Sa Temps plein

    Votre rôle est d'effectuer un travail de thèse sur le codage audio multicanal par réseaux de neurones.Contexte global et problématique du sujetAprès MPEG-H pour le streaming, le standard 3GPP IVAS (Immersive Voice and Audio Services) auquel Orange a contribué inaugure la capacité d'un codec conversationnel à adresser des services immersifs avec même...

  • Agent de Signalisation

    il y a 4 semaines


    Rennes, France Direction de la Voirie Temps plein

    **Rennes Ville & Métropole et ses 5500 agents œuvrent au quotidien** pour faire de leur territoire un lieu de vie dynamique, en phase avec les enjeux d’aujourd’hui et de demain. Nous rejoindre, c'est faire le choix d'intégrer une collectivité qui mise sur la diversité des profils, l'accompagnement des parcours et la qualité de vie au travail de ses...

  • Vendeur Cdd à Temps Partiel

    il y a 4 semaines


    Rennes, France LE TEMPS DES CERISES Temps plein

    **Développez vos talents !** Le Temps des Cerises est né en 1998 au cœur du berceau du denim, de la passion de ses fondateurs, Lylian Richardière et son père, pour la toile bleue. C’est dans le bassin Méditerranéen que la marque a su perpétrer un savoir-faire unique dans la fabrication de ses jeans et développer ainsi ses propres recettes pour la...


  • Rennes, France CHU de Rennes Temps plein

    Vos activités principales sont : Définir et préparer les interactions avec les différents acteurs du protocole Participer à l’organisation administrative et logistique des études Clinique du pôle S’assurer de la programmation et de la réalisation des examens, Transmettre les résultats suivants les modalités prévues, Assurer le...


  • Rennes, France Institut National des Sciences Appliquées de Rennes Temps plein

    Descriptif du poste **Enseignement** La personne recrutée interviendra principalement au sein du département E&T, mais aussi dans la formation par apprentissage en Electronique ? Systèmes Embarqués et Télécommunications (E-SET). Elle aura pour mission de participer aux missions du projet RIS3 incluant le montage de formations dans l'école de...


  • Rennes, France Direction de la Voirie Temps plein

    **Rennes Ville & Métropole et ses 5500 agents œuvrent au quotidien** pour faire de leur territoire un lieu de vie dynamique, en phase avec les enjeux d’aujourd’hui et de demain. Nous rejoindre, c'est faire le choix d'intégrer une collectivité qui mise sur la diversité des profils, l'accompagnement des parcours et la qualité de vie au travail de ses...

  • Administrateur Réseau

    il y a 4 semaines


    Rennes, France Ministère de la Justice Temps plein

    **Le service du numérique recrute : rejoignez-le !** Le ministère de la Justice s’est engagé dans une dynamique de transformation numérique ambitieuse au profit d’une justice plus lisible, plus accessible et plus efficace. L’ambition est de faire du ministère de la Justice un acteur majeur dans le développement de l’administration numérique....

  • Administrateur Reseau

    il y a 1 mois


    Rennes, France Ministère de la Justice Temps plein

    **Le service du numérique recrute : rejoignez-le !** Le ministère de la Justice s’est engagé dans une dynamique de transformation numérique ambitieuse au profit d’une justice plus lisible, plus accessible et plus efficace. L’ambition est de faire du ministère de la Justice un acteur majeur dans le développement de l’administration numérique....


  • Rennes, France De Rent Company Temps plein

    Depuis sa création, "De Rent Company" s'est imposée comme l'un des leaders en matière de travaux d’investissement locatif clef en main pour les investisseurs en France. Notre renommée repose sur une expertise reconnue, forgée par des années d'expérience et une passion inégalée pour notre métier. Notre savoir-faire est de pouvoir obtenir et...

  • Data Scientist Nlp

    il y a 1 mois


    Rennes, France Ouest France Temps plein

    Fidèle à ses valeurs, résolument tourné vers l'avenir, Ouest-France, 1er quotidien d'information générale en France, accélère ses évolutions vers le numérique et poursuit son développement. Pour accompagner ces évolutions, Ouest-France recherche un De formation supérieure en informatique, vous justifiez d’une **première** **expérience en...

  • Data Scientist Nlp

    il y a 7 jours


    Rennes, France Ouest France Temps plein

    Fidèle à ses valeurs, résolument tourné vers l'avenir, Ouest-France, 1er quotidien d'information générale en France, accélère ses évolutions vers le numérique et poursuit son développement. Pour accompagner ces évolutions, Ouest-France recherche un De formation supérieure en informatique, vous justifiez d’une **première** **expérience en...


  • Rennes, France Le Groupe La Poste Temps plein

    La Poste Groupe change, nos métiers évoluent. Etre toujours au plus près des Français, développer la confiance dans le numérique et être acteur de la transformation écologique, c'est aussi le sens de notre métier. Rejoindre La Poste Groupe, c'est rejoindre une entreprise responsable, riche de ses 238 000 collaborateurs ! Pour l'égalité des...


  • Rennes, Bretagne, France Orange Sa Temps plein

    Votre rôle est d'effectuer un travail de thèse sur la : " Séparation de sources par IA générative. Application à des contenus ambisoniques " Contexte global et problématique du sujetLes récents progrès de la reconnaissance automatique de la parole, portés par les avancées en deep learning, ont grandement participé à mettre en avant les services...

  • Agent.e Polyvalent.e

    il y a 4 semaines


    Rennes, France Direction de l'Assainissement Temps plein

    **Rennes Ville & Métropole et ses 5500 agents œuvrent au quotidien** pour faire de leur territoire un lieu de vie dynamique, en phase avec les enjeux d’aujourd’hui et de demain. Nous rejoindre, c'est faire le choix d'intégrer une collectivité qui mise sur la diversité des profils, l'accompagnement des parcours et la qualité de vie au travail de ses...

  • Monteur en réseau TP

    il y a 1 mois


    Rennes, France Manpower CABINET DE RECRUTEMENT DE RENNES Temps plein

    Le poste de Monteur en réseau TP (H/F) Expert des réseaux aériens et souterrains électriques, vous recherchez une entreprise soucieuse du bien-être de ses salariés ?Benjamine, Consultante Recrutement au Cabinet Conseil Manpower, recherche pour son client, spécialiste du réseau électrique, un Monteur Réseaux (H/F) dans le cadre du...


  • Rennes, France Direction de la Voirie Temps plein

    **Rennes Ville & Métropole et ses 5500 agents œuvrent au quotidien** pour faire de leur territoire un lieu de vie dynamique, en phase avec les enjeux d’aujourd’hui et de demain. Nous rejoindre, c'est faire le choix d'intégrer une collectivité qui mise sur la diversité des profils, l'accompagnement des parcours et la qualité de vie au travail de ses...

  • Data Scientist NLP

    il y a 1 mois


    Rennes, France Ouest France Temps plein

    Le poste de Data Scientist NLP & Images (H/F)Notre Direction des services informatiques, composée de plus de 200 personnes recherche un Data Scientist (H/F) en CDI. Au sein du service informatique Banque de Contenus, vous travaillerez en étroite collaboration avec les directions métiers. Passionné(e) par le traitement automatique des langues, l'analyse...


  • Rennes, France Direction de l'Assainissement Temps plein

    **Rennes Ville & Métropole et ses 5500 agents œuvrent au quotidien** pour faire de leur territoire un lieu de vie dynamique, en phase avec les enjeux d’aujourd’hui et de demain. Nous rejoindre, c'est faire le choix d'intégrer une collectivité qui mise sur la diversité des profils, l'accompagnement des parcours et la qualité de vie au travail de ses...


  • Rennes, France Université de Rennes Temps plein

    **RESEAUX D'ANTENNES COMPACTS à FORMATION DE FAISCEAU et à POLARISATION CIRCULAIRE**: - Réf **ABG-121294** - Sujet de Thèse- 15/03/2024- Autre financement public- Université de Rennes- Lieu de travail- Rennes - Bretagne - France- Intitulé du sujet- RESEAUX D'ANTENNES COMPACTS à FORMATION DE FAISCEAU et à POLARISATION CIRCULAIRE- Champs...


  • Rennes, France Université de Rennes 1 Temps plein

    **À propos de nous**: L’IRISA (Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires), créé en 1975, est aujourd'hui l’un des plus grands laboratoires de recherche français (+ de 850 personnes) dans le domaine de l’informatique et des nouvelles technologies de l’information. Structuré en sept départements scientifiques, le laboratoire...