Ingénieur-e biologiste en traitement de données H/F
il y a 2 semaines
Informations générales
Ouverte aux titulaires et CDI CNRS & fonction publique
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e biologiste en traitement de données H/F
Référence : UMR5667-MOBINT-Z53022
Lieu de travail : LYON 07
Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
Date de publication : vendredi 3 mai 2024
Session : Campagne Printemps 2024
Groupe de Fonction : IEG3
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données
Missions
Au sein d'un pôle de bioinformatique en construction au laboratoire RDP, le (la) ingénieur (e)
biologiste en traitement de données aura pour mission d'apporter un soutien bio-informatique (NGS)
et l'integration des projets au sein d'un hub bio-informatique (coordination et traitement des
demandes de soutien par des biologistes et accompagner les bioinformations recrutés sur projet).
Activités
-Renforcer le pôle bioinformatique du laboratoire dans le conseil, l'accompagnement des
bioinformaticiens recrutés sur projet et la formation des biologistes aux bonnes pratiques et
méthodologies d'analyses NGS
-Réaliser l'analyse bioinformatique (et statistique) des données (épi)génomiques issues
de séquençage haut-debit (Illumina RNA-, ChIP-, ATAC-, Bisulfite-seq, Cut&Run-, Cut&Tag-seq;
Nanopore-seq, traitement de données single cell/nuclei-seq)
-Etablir des standards informatiques (Git, Nextflow) afin de pérenniser et mutualiser les
méthodologies mises en place et permettre leur adaptation aux projets des équipes
-Effectuer le stockage et la visualisation des données complexes.
-Utiliser les outils computationnels préexistants, réaliser leur adaptation et
éventuellement le développement de nouveaux outils bioinformatiques
-Effectuer la mise en forme des analyses réalisées et des résultats obtenus ainsi que
leur restitution didactique
-Réaliser la veille scientifique sur les méthodes du domaine
Compétences
Connaissances:
-Connaissance approfondies des analyses computationnelles
-Connaissances générales en biologie moléculaire et cellulaire, en génétique et volonté
de compréhension des problématiques biologiques. Savoir de base de biologie végétale
souhaitable.
Savoir-faire :
-Maîtrise d'un outil gestionnaire de version de code (Git) et de pipelines (Nextflow)
-Maîtriser les bonnes pratiques et méthodes d'analyse de données NGS de deuxième et
troisième génération validée par une expérience professionnelle significative
-Maîtriser des langages de programmation , notamment Python, R et Bash
-Des compétences en biostatistiques et statistiques en grande dimension (classification,
réduction de dimension, `) seront un atout
Savoir-être :
-Goût pour le travail en équipe et le partage des connaissances. Autonomie, rigueur et
sens de l'organisation. Esprit d'initiative, curiosité, créativité
-Qualités relationnelles, d'écoute et de communication à l'oral comme à l'écrit (français
et anglais)
-Compétences pédagogiques pour la formation de biologistes expérimentaux et de
bioinformaticiens contractuels
Contexte de travail
Le laboratoire RDP (Reproduction et Développement des Plantes) est une Unité mixte de recherche
multi-tutelles (CNRS, INRAe, ENS de Lyon, UCBL, INRIA) composée de 8 équipes de recherche (~150
personnes). Le laboratoire est situé sur le site Monod de l'ENS de Lyon. Le laboratoire RDP mène
une activité de recherche fondamentale visant à une compréhension multi-échelle (du génome à
l'organisme) et quantitative du développement et de l'évolution des structures reproductives des
plantes.
L'agent travaillera au sein du pôle bioinformatique de l'unité qui est actuellement en
construction. Ce pôle sera dirigé par un chercheur de l'unité et constitué d'un autre
bioinformaticien permanent (IR CNRS). Des réunions régulières seront organisées entre les
personnels du pôle, mais également avec les bioinformatitiens recrutés sur contrat et l'ensemble
des personnels concernés (ITAs, chercheurs, doctorants, postdoctorants) par les projets de
bioinformatique dans les différentes équipes du RDP. L'ingénieur travaillera sur projet en relation
avec toutes les équipes du RDP. La priorisation des projets sera gérée par le responsable d'équipe
en lien avec les bioinformaticiens du pôle.
-
Biologiste Médical
il y a 4 semaines
Lyon, France UNIBIO Temps pleinBiologiste médical — H/F Chasse sur Rhône En complément de son développement, UNIBIO souhaite poursuivre son modèle indépendant en recrutant un pharmacien ou médecin biologiste médical (H/F) pour exercer sur le nouveau plateau technique de microbiologie de Chasse sur Rhône (Sud de Lyon). **VOS MISSIONS**: Temps plein en microbiologie -...
-
Assistant-e Ingénieur-e Biologiste
il y a 2 semaines
Lyon, France CNRS Temps pleinInformations générales Ouverte aux titulaires et CDI CNRS & fonction publique Intitulé de l'offre : Assistant-e Ingénieur-e Biologiste - Microscopiste H/F Référence : UMR5284-MOBINT-Z53033 Lieu de travail : LYON 08 Institut : INSB - Institut des sciences biologiques Date de publication : vendredi 3 mai 2024 Session : Campagne Printemps 2024...
-
Pharmacien Biologiste
il y a 7 jours
Lyon, France PHI RH Temps pleinPHARMACIEN BIOLOGISTE H/F (69) PHI Santé, division spécialisée du cabinet de recrutement PHI RH, recherche pour un laboratoire d'analyses médicales situé dans le Rhône, un Pharmacien biologiste (h/f). Vos missions principales : Être responsable du laboratoire pré-post analytique Être garant du bon fonctionnement du laboratoire et de la satisfaction...
-
Enseignant(e) en Traitement de données
il y a 4 semaines
Lyon, France Diderot Education - Campus de Lyon Temps pleinDescription de l'entrepriseLe Groupe Diderot Éducation est aujourd’hui un des groupes leaders de l’enseignement privé en France. Il se distingue par l’encadrement des jeunes à travers la pédagogie de projets et par les valeurs qu’il revendique.Diderot Education se déploie sur 9 Campus représentant plusieurs écoles :le Cours Diderot :...
-
Biologiste (F/H)
il y a 4 semaines
Lyon, France SYNLAB Temps pleinMâcon (71000) CEL **Date de publication **:17 avril 2024 **SEL **:SYNLAB BOURGOGNE **Qui sommes nous ?****: Où vous travaillez au sein d'une équipe solidaire engagée pour la santé des Français ? Alors postulez chez SYNLAB, nous sommes faits pour nous entendre ! **SYNLAB : la force des dynamiques locales, la puissance d'un réseau** Leader...
-
Biologiste médical
il y a 2 semaines
Lyon, France HARRY HOPE Temps pleinHarry Hope, cabinet de recrutement accompagne candidats et entreprises dans leurs recherches des meilleures opportunités en France et à l'international. Afin de mieux répondre à vos enjeux, tous nos consultants sont spécialisés par secteur d'activité et zone géographique. Harry Hope accompagne un laboratoire de renom dans son recrutement d'un...
-
Chargé de Traitement de Données Documentaires
il y a 1 mois
Lyon 7e, France Ecole Normale Supérieure de Lyon Temps plein**Description entreprise**: L'Ecole Normale Supérieure de Lyon (ENS Lyon), implantée à Lyon Gerland, forme ses étudiants par et pour la recherche. Elle regroupe toutes les disciplines, en dehors du droit et de la médecine. L'École Normale Supérieure de Lyon dispense une formation d'excellence à des élèves et à des étudiants se destinant aux...
-
Biologiste médical IH
il y a 4 semaines
Lyon, France EFS Temps pleinDescription du poste Métier Activités de laboratoires / Biologie Médicale - Directeur Adjoint de laboratoire Intitulé du poste Biologiste médical IH Contrat CDD Temps de travail Temps complet Date de prise de poste envisagée 03/06/2024 Date de fin de contrat 31/12/2024 Durée du contrat 7 mois au...
-
Biologiste Médical
il y a 1 mois
Lyon, France ÉTABLISSEMENT FRANÇAIS DU SANG Temps plein**Métier**: Activités de laboratoires / Biologie Médicale - Directeur Adjoint de laboratoire **Intitulé du poste**: Biologiste médical / Directeur adjoint de laboratoire F/H **Contrat**: CDI **Temps de travail**: Temps complet **Date de prise de poste envisagée**: Dès que possible **Rémunération**: Selon profil **Description de la...
-
Expert(E) de La Donnée
il y a 4 semaines
Lyon, France Armée de l'air et de l'espace Temps plein**Vous êtes chargé(e)**: - D'administrer les bases de données de l'unité et de gérer les droits d'accès - D'administrer les outils collaboratifs d'Extract Transform Load visant au nettoyage de données et de leur mise en base (via DSS) - De développer les outils ou process permettant l'intégration de nouvelles données et de traiter ces dernières...
-
Pharmacien biologiste
il y a 2 semaines
Lyon, France HARRY HOPE Temps pleinHarry Hope, cabinet de recrutement accompagne candidats et entreprises dans leurs recherches des meilleures opportunités en France et à l'international. Afin de mieux répondre à vos enjeux, tous nos consultants sont spécialisés par secteur d'activité et zone géographique. Harry Hope accompagne un réseau de laboratoire de biologie médicale dans son...
-
Biologiste Médical Spécialisé en Biologie Des
il y a 4 semaines
Lyon, France Eurofins France Clinical Diagnostics - Biomnis Temps pleinDescription de l'entreprise Au sein du Groupe EUROFINS (6,7 milliards d’euros de chiffre d’affaires, plus de 940 laboratoires répartis dans 59 pays et environ 61000 personnes), l’un des leaders mondiaux sur le marché des services bio-analytiques, la division ‘‘Clinical Diagnostics’’ contribue au bien-être et à la santé de tous en...
-
Chargé-e Du Traitement Des Données Scientifiques
il y a 7 jours
Lyon, France UNIVERSITE CLERMONT AUVERGNE Temps pleinDescriptif du poste Le poste proposé est basé à l’Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF, équipe BIOMETA) sur le campus des Cézeaux, et entre dans le cadre de la mise en place d’un Observatoire de l’Eau. La personne recrutée aura pour mission l’identification de jeux de données d’analyses chimiques et biologiques de l’eau dans des...
-
Biologiste Médical
il y a 4 semaines
Lyon, France Unilabs France Temps pleinFondé en 2001, Unilabs France est aujourd’hui un acteur majeur de la biologie médicale en France. Depuis, le réseau n’a cessé de se développer à la fois en biologie médicale mais également en génétique et en pathologie. Unilabs France est la plus importante filiale du Groupe Unilabs, leader européen du diagnostic médical présent dans 17...
-
Biologiste Médical
il y a 4 jours
Lyon, France Eurofins France Clinical Diagnostics - Biomnis Temps plein**Description de l'entreprise** Eurofins Scientific** (6,7 milliards d’euros de chiffre d’affaires, 61000 personnes travaillant dans 940 laboratoires répartis dans 61 pays), est le leader mondial des services bio-analytiques. Les missions des laboratoires d’Eurofins : contribuer à la santé et la sécurité de tous ! **#TestingForLife** Eurofins...
-
Biologiste Medical
il y a 4 semaines
Lyon, France FED Sante Temps plein**FEDSANTE cabinet de recrutement dédié aux professionnels médicaux et paramédicaux, recherche pour son client, un Biologiste Médical H/F spécialisé en chimie analytique, en CDI à Lyon.** **Votre fonction**: Vos missions seront les suivantes: Validation des analyses médicales et de leurs résultats : mise en place des critères de validation...
-
Biologiste Médical
il y a 1 semaine
Lyon, France Hospices Civils de Lyon - HCL Temps plein**Détails de l’offre**: **POSTE PROPOSÉ** Biologiste Médical (AS ou PC) en Immunologie - Lyon Sud **DESCRIPTIF** L'ÉTABLISSEMENT: L'hôpital Lyon Sud est un hôpital généraliste proposant une offre de soins complète. Il dispose de services d'excellence, notamment en hématologie, cancérologie ou encore endocrinologie. C'est également un...
-
Biologiste Médical
il y a 1 mois
Lyon, France Eurofins Biologie Médicale Temps pleinDescription du poste En tant que Biologiste Médical, votre rôle principal consiste à encadrer toutes les activités du site sous votre responsabilité. Vous êtes en relation avec patients et confrères pour l’accueil et le conseil médical en amont et en aval des analyses. Véritable manager, vous soutenez votre équipe dans son activité et gérez la...
-
Chargé de traitement de données documentaires spécialisé
il y a 1 mois
Lyon, France Ecole Normale Supérieure de Lyon Temps pleinDescription entreprise : L'Ecole Normale Supérieure de Lyon (ENS Lyon), implantée à Lyon Gerland, forme ses étudiants par et pour la recherche. Elle regroupe toutes les disciplines, en dehors du droit et de la médecine.L'École Normale Supérieure de Lyon dispense une formation d'excellence à des élèves et à des étudiants se destinant aux métiers...
-
Biologiste Medical
il y a 1 mois
Lyon, France FED Medical Temps plein**Je suis Amandine, consultante chez Fed Santé et recrute un(e) Biologiste Médical pour l'un des leaders mondiaux des service bio-analytiques en plein essor. La vocation de notre client : Contribuer au bien-être et à la santé de tous en fournissant à leurs clients des services d'analyse, de recherche et de conseil de haute qualité, tout en offrant des...