Ingénieur·e de recherche hospitalier

il y a 4 semaines


Besançon, France CHU de Besançon Temps plein

Expérimentation, interprétation des données et rédaction de rapports et publications pour le WP3 «Contamination de la nourriture – conséquences dans le microbiote digestif» du projet MEHTA «Gestion des zones environnementales sensibles et transmission de la résistance aux antimicrobiens»

Le projet MEHTA est financé par l’ANR “Programme Prioritaire de Recherche français (PPR) sur la résistance aux antibiotiques. Le WP3 durera 24 mois, de septembre 2024 à avril 2026.

Il y a un besoin urgent d’établir les conséquences de l’ingestion de légumes obtenus après irrigation avec des eaux usées. Ces légumes sont enrichis en antibiotiques et probablement avec des gènes de résistance aux antibiotiques (GRAs). Dans les pays industrialisés, les hommes acquièrent les GRAs principalement à partir d’autres hommes mais aussi par la nourriture. Nous faisons donc l’hypothèse que des traces d’antibiotiques apportés par la consommation de légumes irrigués avec des eaux usées (i) vont compenser le coût biologique de la résistance aux antibiotiques (ii) casse la résilience du microbiote intestinal et (3) favorise l’implantation des GRAs provenant des légumes et des hommes dans le microbiote digestif de l’hôte.

Pour tester cette hypothèse, le post-doctorant devra :

Réaliser des expérimentations ex-vivo en utilisant des bioréacteurs alimentés par les récoltes alimentaires seules (irriguées avec de l’eau “propre” et des eaux usées traitées ou non par un traitement tertiaire) ou en combinaison avec des bactéries résistantes aux antibiotiques (BRAs)(Escherichia coli productrices de bêta-lactamases, Klebsiella pneumoniae productrices de carbapénémases…)Évaluer l’abondance et le contexte génétique des BRAs par qPCR et séquençage long-read, respectivementExplorer l’effet des légumes irrigués avec les eaux usées sur la composition du microbiote digestif, sa diversité et sa richesse seront explorés par séquençage métagénomique 16S avec le support de la plateforme de bioinformatique 2B2SExplorer l’impact de l’exposition aux antibiotiques, en particulier à des niveaux maximum de résidus dans la nourriture, sur la dynamique des gènes des eaux irriguées dans l’intestinPrésenter les avancées du projet et les résultats durant des réunions d’équipe et des congrès

Profil recherché

Diplôme : Bac +8, doctorat en science, spécialité microbiologieExpérience : Thèse de science en microbiologieCDD d’un an renouvelable.Poste à 100% à pourvoir au mois de septembre.Recrutement sur le grade d’ingénieur d’études et de recherche clinique, catégorie A.Rémunération sur la base des grilles de la fonction publique. A partir de 2638 euros brut par mois selon expérience.

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    Expérimentation, interprétation des données et rédaction de rapports et publications pour le WP3 «Contamination de la nourriture – conséquences dans le microbiote digestif» du projet MEHTA «Gestion des zones environnementales sensibles et transmission de la résistance aux antimicrobiens»Le projet MEHTA est financé par l'ANR "Programme...


  • Besançon, France CHU de Besançon Temps plein

    L’attaché.e de recherche clinique a pour mission d’assurer la mise en place, le monitoring et la clôture des essais cliniques promus par le CHU de Besançon, dans le respect de la réglementation en vigueur. Il est mandaté par le CHU et agit en qualité d’auditeur. Il est ainsi chargé de vérifier la conduite de ces essais au sein du CHU de...


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    L’attaché.e de recherche clinique a pour mission d’assurer la mise en place, le monitoring et la clôture des essais cliniques promus par le CHU de Besançon, dans le respect de la réglementation en vigueur. Il est mandaté par le CHU et agit en qualité d’auditeur. Il est ainsi chargé de vérifier la conduite de ces essais au sein du CHU de...


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    Description du poste CORELAB Imagerie : Gestion d’une base de données d’image OCT (enregistrement, sauvegarde des images, tri des cas répertorié).Connaitre le fonctionnement des dispositifs médicaux utilisés (OCT, QFR, Echographie).Préparation études de cas pour les médecins.Analyse des images, réalisation des mesures sur les consoles en...


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    Description du poste CORELAB Imagerie : Gestion d’une base de données d’image OCT (enregistrement, sauvegarde des images, tri des cas répertorié).Connaitre le fonctionnement des dispositifs médicaux utilisés (OCT, QFR, Echographie).Préparation études de cas pour les médecins.Analyse des images, réalisation des mesures sur les consoles en...


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    Dans le cadre d’un poste à pourvoir, le CHU recrute un·e préparateur/préparatrice en pharmacie hospitalière.Contributions attenduesFabrication Calcul des dosages ou mesures conformément aux demandes et aux protocoles de préparation,Edition des fiches de fabrication (+ validation BPC)Préparation sous isolateur stérile selon les BPP...


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    Dans le cadre d’un poste à pourvoir, le CHU recrute un·e préparateur/préparatrice en pharmacie hospitalière.Contributions attenduesFabrication Calcul des dosages ou mesures conformément aux demandes et aux protocoles de préparation,Edition des fiches de fabrication (+ validation BPC)Préparation sous isolateur stérile selon les BPP...


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    Candidature à transmettre à M. Thierry Gamond-Rius, directeur général : Ne pas utiliser le formulaire en fin de page pour adresser votre candidature.Pour plus d’informations sur ce poste, vous pouvez contacter par mail Mme Marie Lapostolle, directrice des affaires médicales, de la recherche et des relations avec l’UniversitéPrésentation du CHU de...


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    Candidature à transmettre à M. Thierry Gamond-Rius, directeur général : Ne pas utiliser le formulaire en fin de page pour adresser votre candidature.Pour plus d’informations sur ce poste, vous pouvez contacter par mail Mme Marie Lapostolle, directrice des affaires médicales, de la recherche et des relations avec l’UniversitéPrésentation du CHU de...


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    Dès la mise en place de l’étude jusqu’à sa clôture : Respecter les procédures du protocole, les BPC et la réglementation, s’assurer que le classeur investigateur est à jour, s’assurer que les documents réglementaires sont à jour. Inclusion des patients : Vérifier l’éligibilité des patients à partir des dossiers sources, être un...


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    Dès la mise en place de l’étude jusqu’à sa clôture : Respecter les procédures du protocole, les BPC et la réglementation, s’assurer que le classeur investigateur est à jour, s’assurer que les documents réglementaires sont à jour. Inclusion des patients : Vérifier l’éligibilité des patients à partir des dossiers sources, être un...


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    Compétences attendues Connaissance des Bonnes Pratiques Cliniques et de la réglementation applicable aux essais cliniquesConnaissance des bases de la sécurité des données en recherche cliniqueMaîtrise des outils informatiques (Word/Excel/Access, Outlook, visio) et des outils informatiques spécifiques à la pharmacovigilanceRédaction de notes,...


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    Les missionsAvant le démarrage de l’étude : Faciliter pour le promoteur le recueil des documents nécessaires aux démarches réglementairesRépondre dans les délais aux questionnaires de pré-sélection et de faisabilité de l’étudeAssister aux réunions de mise en place des étudesProduire de tableaux récapitulatifs, des agendas d’étude (en...


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    Les missionsAvant le démarrage de l’étude : Faciliter pour le promoteur le recueil des documents nécessaires aux démarches réglementairesRépondre dans les délais aux questionnaires de pré-sélection et de faisabilité de l’étudeAssister aux réunions de mise en place des étudesProduire de tableaux récapitulatifs, des agendas d’étude (en...


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    Dans le cadre du projet de recherche THERAPhage, le technicien de laboratoire aura pour missions de participer à la production des phages dirigés contre Pseudomonas aeruginosa.MissionsMissions dans le cadre du projet THERAPhage Sélection et préparation de souches de Pseudomonas aeruginosaIsolement et purification de phages anti-Pseudomonas aeruginosa...


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    Dans le cadre du projet de recherche THERAPhage, le technicien de laboratoire aura pour missions de participer à la production des phages dirigés contre Pseudomonas aeruginosa.MissionsMissions dans le cadre du projet THERAPhage Sélection et préparation de souches de Pseudomonas aeruginosaIsolement et purification de phages anti-Pseudomonas aeruginosa...


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    Description du posteAvant le démarrage de l’étude : Faciliter pour le promoteur le recueil des documents nécessaires aux démarches réglementairesRépondre dans les délais aux questionnaires de pré-sélection et de faisabilité de l’étudeAssister aux réunions de mise en place des étudesProduire de tableaux récapitulatifs, des agendas...


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    Description du posteAvant le démarrage de l’étude : Faciliter pour le promoteur le recueil des documents nécessaires aux démarches réglementairesRépondre dans les délais aux questionnaires de pré-sélection et de faisabilité de l’étudeAssister aux réunions de mise en place des étudesProduire de tableaux récapitulatifs, des agendas...


  • Besançon, France CHU de Besançon Temps plein

    Le CHU de Besançon recrute un·e contrôleur /contrôleuse de gestion. Votre mission est de contribuer au contrôle de gestion des finances, des ressources humaines et des affaires médicales.La mission s’inscrit dans les objectifs du service public hospitalier ; elle est assurée dans le respect de la réglementation de la fonction publique hospitalière...


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    Le CHU de Besançon recrute un·e contrôleur /contrôleuse de gestion. Votre mission est de contribuer au contrôle de gestion des finances, des ressources humaines et des affaires médicales.La mission s’inscrit dans les objectifs du service public hospitalier ; elle est assurée dans le respect de la réglementation de la fonction publique hospitalière...