Bioinformaticien -Recherche sur le cancer (H/F)

il y a 2 semaines


Paris, France Institut Curie Temps plein
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité ’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du patient.

Laboratoires d’accueil

Equipe Stress et Cancer - Directeur : Fatima Mechta-Grigoriou

Equipe Computational Biology – Directeur : Hervé Isambert

Description du poste

Projet financé par la Commission européenne , dans le cadre du programme Horizon Europe, Mission Cancer 2023.

Titre : Évaluation du rôle du microbiote intratumoral dans les réponses thérapeutiques à l'aide de tumeurs sur puce dérivées de patients

Acronyme : ARTURO

La résistance aux thérapies est un défi majeur en oncologie. Des recherches récentes suggèrent que le microbiote intratumoral peut contribuer à la résistance aux médicaments anticancéreux, en particulier aux immunothérapies. Cependant, il n'existe pas d'approches expérimentales pour étudier le rôle du microbiote dans les cancers humains. Le projet ARTURO s'attaquera à ce problème en utilisant un modèle innovant des tumeurs sur puce (tumor on chip, ToC) en 3D, dans le cadre du domaine émergent des systèmes microphysiologiques (MPS). Le rôle des bactéries dérivées des patients, de leurs postbiotiques et des vésicules extracellulaires libérées, dans les comportements de l'écosystème tumoral et les réponses aux médicaments, sera décrypté en intégrant les données cliniques, l'analyse omique et de nouvelles informations basées sur les ToC (par imagerie et transcriptomique). Le développement de méthodes informatiques avancées pour extraire les informations basées sur la ToC constitue une force et une innovation majeures dans le domaine, avec un fort potentiel pour accélérer les applications futures de la technologie ToC en clinique. L'accent sera mis sur deux sous-types fréquents de cancer mal compris : le cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) et le cancer du sein lobulaire invasif (ILC).

Ce projet interdisciplinaire et international (France, Italie, Portugal), coordonné par Maria Carla Parrini, sera développé en collaboration entre l'Institut Curie, l'Institut Pierre-Gilles de Gennes pour la microfluidique, l'hôpital Bichat à Paris, l'Universidade Catolica Portuguesa à Porto, l'Université de TorVergata à Rome et l'Université Humanitas à Milan. 

Nos récentes publications pertinentes

1. Assessing personalized responses to anti-PD-1 treatment using patient-derived lung tumor-on-chip

Veith et al, Cell Rep Med 2024, preprint. doi:

2. CausalXtract: a flexible pipeline to extract causal effects from live-cell time-lapse imaging data

Simon et al, eLife 2024, preprint.

3. Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer

Croizer et al, Nat Commun 2024 Apr 1;15(1):2806.

Formation et compétences 

Nous recherchons un-e bioinformaticien-ne au niveau pré-doctoral ou post-doctoral avec :

- un intérêt marqué pour l'analyse de données biologiques hétérogènes complexes

- une expérience préalable dans l'analyse de données de séquençage (RNA-Seq de bulk, single-cell et/ou spatial transcriptomic)

- une compétence dans le traitement de données -omiques à nombre de dimensions élevé

- maîtrise de langages de haut niveau tels que Python ou R et des bonnes pratiques de codage

- des compétences en analyse d'images (ce serait un plus).

- Le développement d'un projet de doctorat sur le sujet est une possibilité ouverte.

Aptitudes requises

Autonomie, capacité organisationnelle, esprit d’équipe, adaptabilité à la multidisciplinarité, anglais courant.

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat

Type de contrat  : contrat à durée déterminée

Date de démarrage : immédiat

Durée du contrat  : 3 ans

Temps de travail  : temps complet

Rémunération  : selon les grilles en vigueur

Avantages  : restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise

Localisation du poste  : Institut Curie, 23 rue d’Ulm, 75005 Paris

Pour postuler, merci d’envoyer CV, lettre de motivation et 2 références

Date limite des candidatures : 31/07/2024


  • Programme Paris Kids Cancer

    il y a 4 semaines


    Paris, France Siège de l'AP-HP Temps plein

    **Détails de l’offre**: **POSTE PROPOSÉ** Programme Paris Kids Cancer (H/F) **CONTRAT** CDD **DESCRIPTIF** Le label Centres de recherche intégrée dexcellence en cancérologie pédiatrique Structure daccueil Le poste sera localisé à Paris au niveau du centre de recherche de linstitut Curie. La personne recrutée sera rattachée...

  • Programme Paris Kids Cancer

    il y a 4 semaines


    Paris, France Assistance Publique Hôpitaux de Paris Temps plein

    **Date de début de diffusion **:15/11/2023 **Date de parution **:15/11/2023 **Description du poste**: **Intitulé du poste**: Programme Paris Kids Cancer (H/F) **Métier**: Z - Ne pas utiliser - Z - Ne pas utiliser **Type d'emploi**: CDD **Quotité de temps de travail**: Temps plein **Horaires de travail**: Temps complet - 39h/semaine **Poste à...


  • Paris 10e, France Aphp saint louis Temps plein

    L'Hôpital Saint-Louis est un hôpital universitaire public situé à Paris, en France. Il fait partie du Groupe Hospitalier Universitaire APHP Nord. Il propose près de 700 lits et places et compte environ 3 500 personnels paramédicaux. L'hôpital se trouve près du canal SaintMartin, dans un quartier dynamique, et est au cœur d'un patrimoine historique...

  • Coordinateur (H/F)

    il y a 1 mois


    Paris, France LIGUE CONTRE LE CANCER 94 Temps plein

    **EMPLOYEUR** Le Comité du Val-de-Marne de la Ligue contre le cancer est une association loi 1901 reposant sur la générosité du public et sur l’engagement de ses bénévoles. Les missions principales de la Ligue contre le cancer 94 sont le financement de la recherche, l’aide aux personnes malades et proches ainsi que la prévention et la promotion...


  • Paris, France Institut Curie Temps plein

    Institut Curie Research CenterInstitut Curie is a major player in the research and fight against cancer. It consists of a Hospital group and a Research Center of more than 1000 employees with a strong international objective of the Research Center is to develop basic research and to use the knowledge produced to improve the diagnosis, prognosis, and...


  • Paris, France Institut Curie Temps plein

    Date de clôture- 31/12/2023- Lieu(x) de travail- Paris- Secteur- Centre de Recherche- CDD Le Centre de recherche de l’Institut Curie L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité...

  • Ingénieur d'étude

    il y a 1 mois


    Paris, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur d'étude (H/F) pour accompagner un projet de recherche sur les rapports entre cancers de la prostate et chlordécone aux Antilles. Référence : UMR7170-MALFER-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PARIS 16 Date de publication : lundi 1 avril 2024 Type de contrat : CDD...


  • Paris 5e, France INSTITUT CURIE Temps plein

    **Contexte - Le Centre de recherche de l’Institut Curie** L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale. L’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de...


  • Paris, France Centre hospitalier Centre Hospitalier Paul Chapron Temps plein

    **Détails de l’offre**: **POSTE PROPOSÉ** RADIOLOGUE (Dépistage du cancer du sein) **CONTRAT** Praticien contractuel **DESCRIPTIF** Le Centre Hospitalier de la Ferté-Bernard, doté dun plateau technique performant et spécialisé (imagerie/scanner 64 barrettes urgences médecines chirurgie bloc pharmacie consultations externes), recherche 1...


  • Paris 13e, France Ligue Nationale Contre le Cancer Temps plein

    Descriptif du poste - Instruire, concevoir, mettre en oeuvre et évaluer des projets innovants qui visent à répondre à des objectifs de prévention de la population générale, aux besoins spécifiques d'accompagnement des personnes touchées par le cancer et de leurs aidants. ? Analyser les besoins d'accompagnement des personnes malades et de leurs...

  • Offre d'un postdoctorat

    il y a 1 mois


    Paris, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Offre d'un postdoctorat (H/F) en sciences sociales sur les rapports entre cancers de la prostate et chlordécone aux Antilles. Référence : UMR7170-MALFER-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PARIS 16 Date de publication : lundi 1 avril 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat :...


  • Paris 13e, France Ligue Nationale Contre le Cancer Temps plein

    Descriptif du poste - Au plan global: - Assurer la mise en oeuvre et le suivi du programme de lutte contre la pollution de l'air de la LIGUE, financé par la Fondation Européenne pour le climat (European Climate Foundation) et le pérenniser ; - Promouvoir les enjeux de santé relatifs à la qualité de l'air et les dispositifs de prévention auprès des...


  • Paris, France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Quelles sont les missions ?Le Responsable du service Prévention & Promotion des dépistages appuie le Directeur Général et le Directeur Général Adjoint de son Pôle dans l'exécution des décisions de la gouvernance en lien avec le Conseil d'Administration. Dans le cadre de votre mission, vous aurez pour responsabilités :- Élaborer, mettre en oeuvre...


  • Paris, France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Poste : Le Responsable du service Prévention & Promotion des dépistages appuie le Directeur Général et le Directeur Général Adjoint de son Pôle dans l'exécution des décisions de la gouvernance en lien avec le Conseil d'Administration. Dans le cadre de votre mission, vous aurez pour responsabilités :- Élaborer, mettre en...


  • Paris, France Société Française du Cancer Temps plein

    Le département Organisation et Parcours de soins recherche sonResponsable de Département – Organisation et Parcours de soins (H/F) Au sein du Pôle Santé Publique et Soins, et sous l’autorité du directeur du pôle santé publique et soins, le département OPS contribue à l’amélioration de la prise en charge centrée sur les malades atteints de...


  • Paris, France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Quelles sont les missions ?Placé(e) sous l'autorité de la Directrice générale adjointe Stratégie de lutte, vous aurez comme mission de définir et conduire la stratégie d'influence réglementaire et de positionnement institutionnel de la Ligue contre le cancer.- En s'appuyant sur une veille des sujets en pointe, proposer des sujets de plaidoyer...


  • Paris, Île-de-France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Quelles sont les missions ?Le Responsable du service Prévention & Promotion des dépistages appuie le Directeur Général et le Directeur Général Adjoint de son Pôle dans l'exécution des décisions de la gouvernance en lien avec le Conseil d'Administration. Dans le cadre de votre mission, vous aurez pour responsabilités :- Élaborer, mettre en oeuvre...


  • Paris, France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Poste : Placé(e) sous l'autorité de la Directrice générale adjointe Stratégie de lutte, vous aurez comme mission de définir et conduire la stratégie d'influence réglementaire et de positionnement institutionnel de la Ligue contre le cancer.- En s'appuyant sur une veille des sujets en pointe, proposer des sujets de...


  • Paris, Île-de-France LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER Temps plein

    Quelles sont les missions ?Placé(e) sous l'autorité de la Directrice générale adjointe Stratégie de lutte, vous aurez comme mission de définir et conduire la stratégie d'influence réglementaire et de positionnement institutionnel de la Ligue contre le cancer.- En s'appuyant sur une veille des sujets en pointe, proposer des sujets de plaidoyer...


  • Paris, France Adecco Medical France Temps plein

    Nous recherchons pour un centre de recherche un attaché de recherche clinique H/F pour une étude multicentrique en oncologie sur le cancer de la vessie. Vous travaillerez en support aux équipes en place sur des études en oncologie : tumeurs solides et liquides. Vous serez en charge de la saisie et de la modification des données dans l'eCRF, de la...