Chercheur en microbiologie/microscopie STORM

Informations générales

Intitulé de l'offre : Chercheur en microbiologie/microscopie STORM (H/F)
Référence : UMR5075-VALLAN-027
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GRENOBLE
Date de publication : jeudi 11 juillet 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 décembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2 991, 58 € et 3 417,33 € (selon expérience)
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie

Missions

La personne recrutée aura comme activité principale la réalisation des expériences liées au projet ANR "NANOWALL". Le projet post-doctoral vise à élucider la dynamique des processus de synthèse et de maturation pour les deux composants majeurs de la paroi cellulaire des bactéries à Gram positif, le peptidoglycane (PG) et les acides teichoïques (AT), et découvrir les interactions clefs qui connectent l'assemblage de ces deux composants. Il repose sur la combinaison de méthodes de chimie click, de microscopie à fluorescence super-résolue et de microscopie électronique, de biochimie et de RMN, appliquées à des souches sauvages et mutantes du pathogène humain Streptococcus pneumoniae.

Activités

1. Réaliser des travaux de recherche, de la mise en place de l’expérience à la rédaction des résultats:
- assurer la veille bibliographique du projet
- cultiver des cellules de S. pneumoniae dont le PG et les TA seront marqués par des composés cliquables
- collecter et analyser des données en microscopie à fluorescence conventionnelle (basse résolution)
- collecter, traiter et analyser des données dSTORM (direct STochastic Optical Reconstruction Microscopy)
- préparer des extraits de paroi bactérienne (PG et TA) marquée et les analyser par SDS-PAGE
- préparer des échantillons pour la microscopie électronique cellulaire (CEMOVIS, FIB/SEM/cryo-tomographie) et analyser les données générées
- mettre en forme les résultats pour des bilans mensuels et des présentations orales en anglais
- être force de proposition pour la mise au point et l’amélioration des expériences
- rédiger en anglais des protocoles et des articles de recherche pour la publication des travaux réalisés
2. Participer à la vie du laboratoire :
- participer à la vie en commun du groupe de recherche (contribution à la logistique, suivi des stocks de réactifs utilisés, rangement, …)
- aider à la supervision de stagiaires
- participer aux évènements scientifiques de l’Institut

Compétences

Savoirs fondamentaux :
- Doctorat en biologie structurale / biologie cellulaire avec de bonnes connaissances en microbiologie
- Connaissances des mécanismes moléculaires de la division bactérienne, composition de la paroi
- Connaissances générales des procédés de chimie click
- Connaissance générales des méthodes de microscopie à fluorescence
- Connaissance générales des méthodes de microscopie électronique
- Langue anglaise : B2 souhaité (selon le cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire techniques :
- Avoir une grande habilité technique
- Avoir pratiqué les techniques de microscopie à fluorescence (dSTORM serait un atout) ou de microscopie électronique cellulaire (FIB/SEM/cryo-tomographie serait un atout)
- Connaissances en traitement des données et informatique appliquée à l’analyse d’image
- Maîtrise des analyses statistiques
- Connaissances et respect de la réglementation d'hygiène et de sécurité en vigueur dans les laboratoires, notamment en laboratoire P2

Compétences comportementales et relationnelles :
- Grande capacité d’autonomie
- Pro-activité dans la recherche, curiosité scientifique
- Ouverture d’esprit et écoute
- Bon sens du relationnel et capacité d’intégration et d’adaptation à l’équipe
- Sens de l’organisation et rigueur
- Sens de la communication (écrite et orale) et capacité à rendre compte de vos travaux

Contexte de travail

Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 21 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 300 personnes y travaillent (chercheurs, doctorants, ingénieurs, techniciens et étudiants) dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée rejoindra le groupe Pneumocoque (dirigé par Cécile Morlot), qui étudie les mécanismes moléculaires liés à l'enveloppe cellulaire bactérienne en utilisant des approches intégrées de biologie structurale et cellulaire. Les thèmes de recherche incluent la paroi cellulaire chez Streptococcus pneumoniae, ses mécanismes de synthèse et les antibiotiques qui les ciblent, ainsi que les grands complexes protéiques associés à l'enveloppe de la spore chez Bacillus subtilis. (/research/research-groups/pneumococcus-group-c-morlot/).

Contraintes et risques

Sans.
La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.

Informations complémentaires

L'offre de poste a une durée initiale de 12 mois, avec possibilité de prolongation à l'issue de la première période.