Ingénieur d'étude en analyse de données

il y a 2 semaines

Montpellier, France CNRS Temps plein

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur d'étude en analyse de données (H/F)
Référence : UMR5535-NADLAG-007
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 27 mai 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 13 mois
Date d'embauche prévue : 15 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2372.55€ brut selon expériences
Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Missions

L'équipe « Bases moléculaires de l'inflammation » s'intéresse à l'étude des réponses inflammatoires et à leur interconnexion avec l'homéostasie métabolique. L'inflammation est une réaction normale du système immunitaire en réponse à des infections ou à des lésions tissulaires et joue un rôle central dans le déclenchement de l'immunité adaptative. Cependant, l'inflammation chronique favorise plusieurs pathologies humaines. Ces pathologies incluent le cancer, les maladies auto-inflammatoires et auto-immunes, mais aussi les maladies métaboliques. Les missions de la personne recrutée seront d’analyser ou de métanalyser des données multimodales afin de déterminer :
1. Comment l'inflammation chronique est déclenchée dans les cellules métaboliques
2. Comment l'immunité au niveau des tissus est contrôlée dans les tissus métaboliques
3. Si les altérations métaboliques alimentent les pathologies inflammatoires chroniques
Le candidat ou la candidate soutiendra la réalisation des projets de l’équipe à travers ces analyses et participera à l'établissement de modèles ou de protocoles d'analyses.
Contrat initial de 13 mois, avec possibilité de prolongation.

Activités

Les activités spécifiques comprennent :
• Effectuer le traitement et la visualisation des données
• Organiser la mise en forme, le stockage des données
• Assurer la maintenance des bases de données créées
• Adapter les applications informatiques aux besoins du projet
• Gérer et maintenir des outils informatiques partagés
• Conseiller et former aux techniques et outils développés
• Définir les procédures d'assurance qualité et veiller à leur mise en œuvre
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Compétences

Le candidat ou la candidate, hautement motivé, sera titulaire au moins d'un Master dans le domaine des biostatistiques, biomathématiques, bio-informatique ou un domaine apparenté.
La personne sera en mesure de :
- Collecter, analyser, traiter et visualiser des données à l'aide de R et/ou Python
- Utiliser des bibliothèques communes d'analyse de données et de bio-informatique (Seurat, scanpy, monocle, pandas,
- Interagir avec des biologistes et des informaticiens
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Transmettre des connaissances
- Utiliser les techniques de présentation
La personne aura des connaissances générales sur les concepts de la biologie et de l'informatique, ainsi que des compétences en programmation. La personne aura également une bonne connaissance de l'anglais (lu, écrit et parlé). Un esprit critique et d’excellentes compétences organisationnelles sont attendus.

Contexte de travail

L'équipe « Bases Moléculaires de l'Inflammation » a rejoint en avril 2023 l'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (, un centre de recherche fondamentale CNRS/Université de Montpellier, situé dans le sud de la France. L'IGMM fait partie d'un campus majeur du CNRS à Montpellier et bénéficie de connexions étroites avec d'autres grands centres de recherche, dédiés notamment à la chimie (IBMM, ICCG), à la biologie cellulaire (CRBM) et aux maladies infectieuses (IRIM), ainsi que d'un accès à 18 plateformes (http://. L'IGMM abrite également d'excellentes installations internes qui faciliteront la mise en œuvre du projet. Le campus offre donc un environnement exceptionnel pour favoriser les échanges scientifiques. L'équipe « Bases moléculaires de l'inflammation » bénéficie d'un réseau étroit de collaborateurs interdisciplinaires, facilitant la mise en place de stratégies originales.

Contraintes et risques

Aucun

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