Ingénieur-e biologiste en analyse de données

il y a 3 semaines


Villeneuved'Ascq, France Université de Lille Temps plein
À propos de nous

Ambitieuse et innovante, l'Université de Lille réunit facultés, instituts et écoles de renom. Notre objectif : Construire une université internationale, rayonnante et attractive, ancrée dans son territoire et moteur du développement économique et socio-culturel. Faire le choix de l'Université de Lille, c'est rejoindre une communauté résolument tournée vers l'avenir et engagée pour l'excellence académique.

Mission

CDD d'un an

MISSIONS

Contribuer aux missions de la plateforme de bioinformatique Bilille, notamment pour le montage, la réalisation ou l'encadrement de projets d'analyse de données par des approches bioinformatiques au service des unité de recherche en Biologie et Santé de la métropole Lilloise.
Garantir le maintien et le développement des compétences en interne à la plateforme pour le traitement des nouvelles données massives générées dans le domaine Biologie et Santé.

ACTIVITÉS

- Assurer la réalisation, la conduite et l’encadrement de projets d'analyse de données en utilisant les outils de bioinformatique et bioanalyse les plus adaptés.
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.
- Participer au montage de projets collaboratifs.
- Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats.
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.
- Diffuser les bonnes pratiques bioinformatiques auprès des autres personnels de la plateforme.

Activités Associées
- Contribuer à l'activité de formation de la plateforme, par l'intervention dans les formations existantes et le montage de nouvelles formations.
- Contribuer à l’activité de développement de ressources originales (bases de données, packages, logiciels, workflows) au service de la communauté de recherche en biologie et santé, à l’échelle locale, nationale et internationale.
- Assurer le support aux utilisateurs pour l’utilisation des ressources mises à disposition par la plateforme (cloud, cluster...).
- Contribuer à la mise en place d'une démarche qualité.
- Animer des réseaux professionnels d'échange de compétences (séminaires scientifiques et techniques, ...).
- Participer et contribuer aux activités et groupes de travail des infrastructures nationales (IFB) et internationales (ELIXIR).

Particularités du poste

- Rotation des ingénieurs sur les 3 sites lillois: Cité scientifique, Campus santé et Campus pasteur.
- Travail prolongé sur écran, avec risques associés (vision, posture, isolement).
- Obligation de respecter le secret professionnel et les contraintes de calendrier (Charge de travail variable) liés aux projets.

Profil

- Connaissances des divers domaines -omiques (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, métagénomique).
- Connaissance des outils usuels de bioinformatique : analyse de séquences, annotation, phylogénie, bioinformatique structurale,...
- Connaissances générales en biologie.
- Connaissances générales sur les SGBD (oracle, postgresql).
- Maitrise des bonnes pratiques de développement et de gestion de projet.
- Maitrise des bonnes pratiques pour l'encadrement (ingénieurs, stagiaires).
- Environnement et réseaux professionnels.
- Culture du domaine.
- Langue anglaise : B2.

- Utiliser les outils d’analyse courants pour les données omiques (notamment séquençage à haut débit).
- Utiliser les outils de calcul intensif.
- Utiliser des gestionnaires de workflows scientifiques (Galaxy, snakemake, nextflow, ...).
- Maitrise de Python et d’au moins un autre langage de programmation (Java, C++, R, Bash, ...).
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats.
- Assurer une veille technique et scientifique.
- Appliquer et contribuer à une démarche qualité.
- Concevoir des ressources et outils pédagogiques.
- Aisance rédactionnelle.

- Capacité à travailler en équipe et à l’interface entre plusieurs disciplines.
- Capacité à encadrer d'autres ingénieurs, stagiaires sur des projets.
- Capacité à transmettre ses connaissances en s'adaptant à son interlocuteur.
- Capacité de conceptualisation / Créativité / Sens de l'innovation.
- Sens critique.
- Autonomie et sens de l’initiative.
- Faculté d’adaptation et sens de l’organisation.

Bac +5 exigé : Master, diplôme d'ingénieur ou doctorat dans le domaine de la bioinformatique.

Idéalement première expérience d'au moins 12 mois en milieu professionnel en l'absence de thèse.



  • Villeneuve-d'Ascq, France OpenClassrooms Temps plein

    Description du posteOpenClassrooms recherche un Data Analyst en contrat d’apprentissage pour un de nos partenaires du secteur de l'entreprise, pour préparer une de ses formations diplômantes reconnues par l’État. Attention : cette offre ne s’adresse qu’aux candidats à l’alternance qui effectuent leur formation avec OpenClassrooms ou souhaitent...


  • Villeneuve-d'Ascq, France OpenClassrooms Temps plein

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  • Villeneuve-d'Ascq, France Fives FCB Temps plein

    FIVES FCB STAGE - Ingénieur R&D mécanique et analyses vibratoires— Fives FCB recherche activement un Ingénieur R&D mécanique et analyses vibratoires F/H pour venir renforcer ses équipes à Villeneuve d'Ascq, en stage. Chez Fives, nous sommes toutes et tous portés par une vocation commune, celle de faire aimer l'industrie ! Ensemble, nous œuvrons au...


  • Villeneuve-d'Ascq, France Fives FCB Temps plein

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  • Villeneuve-d'Ascq, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Expert (H/F) en ingénierie logicielle pour le traitement de données spatiales. Référence : UMR8518-MARLIE-012 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : VILLENEUVE D ASCQ Date de publication : vendredi 24 mai 2024 Type de contrat : Contrat de projet Ingénieur Technicien Durée du contrat : 72 mois Date...


  • Villeneuve-d'Ascq, France CNRS Temps plein

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  • VILLENEUVE-D'ASCQ, France CNRS Temps plein

    Le Laboratoire d'Optique Atmosphérique recrute un(e) ingénieur(e) ayant des compétences relatives au traitement des données. La personne recrutée sera chargée de développements informatiques pour les traitements et l'analyse des données d'observation de la Terre à partir d'instruments spatiaux. En particulier le travail s'inscrit...


  • Villeneuve-d'Ascq, France Cyrillus Temps plein

    Poste En tant qu'assistant(e) ingénieur(e) qualité, tes missions s'articuleront autour de 2 grands axes : Pilotage qualité : Tu auras la gestion et le suivi de la totalité des secteurs du prêt-à-porter (Homme – Femme – Enfant – Bébé). Plus concrètement : Participer avec le responsable qualité à la validation des matières et...


  • Villeneuve-d'Ascq, France Alten Temps plein

    Description du poste Dans le cadre du développement de l’agence ALTEN Nord , nous recrutons en CDI  un(e) Ingénieur(e) Système Ferroviaire (H/F). Afin de piloter la conformité des exigences clients avec l’ensemble des fournisseurs jusqu’aux premières FAIs, vos missions seront de : Piloter et garantir le bon déroulement des projets...


  • Villeneuve-d'Ascq, France ALTEN Temps plein

    Description du posteDans le cadre du développement de l’agence ALTEN Nord, nous recrutons en CDI un(e) Ingénieur(e) Système Ferroviaire (H/F).Afin de piloter la conformité des exigences clients avec l’ensemble des fournisseurs jusqu’aux premières FAIs, vos missions seront de :Piloter et garantir le bon déroulement des projets (qualité, coûts,...

  • Ingénieur(e) Cloud

    il y a 2 semaines


    Villeneuve-d'Ascq, France Groupe SOPRA STERIA Temps plein

    Company Description Sopra Steria, acteur majeur de la Tech en Europe, reconnu pour ses activités de conseil, de services numériques et d'édition de logiciels, aide ses clients à mener leur transformation digitale et à obtenir des bénéfices concrets et durables. Il apporte une réponse globale aux enjeux de compétitivité des grandes entreprises et...


  • VILLENEUVE-D'ASCQ, 59493, Lille, France CNRS Temps plein

    Le Laboratoire d'Optique Atmosphérique recrute un(e) ingénieur(e) ayant des compétences relatives au traitement des données. La personne recrutée sera chargée de développements informatiques pour les traitements et l'analyse des données d'observation de la Terre à partir d'instruments spatiaux. En particulier le travail s'inscrit...

  • Ingénieur(e) Cloud

    il y a 2 semaines


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  • Ingénieur conseil F/H

    Il y a 2 mois


    Villeneuve-d'Ascq, France CARSAT HAUTS DE FRANCE Temps plein

    Description du poste Vous êtes obligatoirement titulaire d'un diplôme d'Ingénieur reconnu par la commission des titres d'ingénieur dans un domaine technique (généraliste, chimiste, physicien ...).Vous avez 10 ans minimum d'expérience opérationnelle en tant qu'ingénieur.Une expérience managériale d'équipe et/ou de projets serait...

  • Ingénieur conseil F/H

    il y a 2 semaines


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  • Ingénieur(e) DevOps

    il y a 2 semaines


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  • Ingénieur(e) DevOps

    il y a 2 semaines


    Villeneuve-d'Ascq, France Groupe SOPRA STERIA Temps plein

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  • [DGD FTLV ]

    il y a 1 semaine


    Villeneuve-d'Ascq, France Université de Lille Temps plein

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  • Ingénieur Système

    il y a 2 semaines


    Villeneuve-d'Ascq, Hauts-de-France SCC France SAS Temps plein

    Nous sommes actuellement à la recherche d'un Ingénieur Système Microsoft 365 pour notre client basé sur la métropole lilloise.En tant que responsable produit de Microsoft 365, votre rôle consiste à garantir une expérience fluide et efficace pour tous les utilisateurs.Le poste est à pourvoir au sein de la DSI.Vos missions :L'exploitation de la...

  • Ingénieur Système

    Il y a 2 mois


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