Chercheur Ingénierie métabolique

il y a 6 jours


ÉvryCourcouronnes, France Cea Temps plein

L'ingénierie métabolique offre un potentiel considérable pour faire progresser une économie circulaire du carbone, notamment grâce à la manipulation de micro-organismes tels qu' Escherichia coli (E. coli) . Les E. coli modifiés peuvent convertir divers substrats en produits d’interet, mais l'optimisation des chassis bacteriens, reste un défi majeur. L'optimisation de chassis implique la réallocation des ressources au sein de l'organisme, l'ajustement de sa structure et l'évolution des gènes introduits. Les méthodes actuelles sont lentes, biaisées et ont tendance à optimiser ces aspects de manière indépendante, en ignorant souvent les interactions complexes entre eux.

Le projet vise à surmonter ces défis en développant un processus intégré pour l'ingénierie des souches de bioproduction adaptées à des contextes de production spécifiques. Nous utiliserons des techniques avancées de modification du génome pour accélérer le processus d'optimisation. Nos principaux objectifs sont les suivants :

1. Ingénierie de l'allocation des ressources : Nous visons à réallouer les ressources cellulaires afin de maximiser les rendements de bioproduction. En ciblant des éléments régulateurs clés, nous optimiserons l'allocation des ressources pour la croissance et la production dans diverses conditions. Nous mesurerons les changements dans l'allocation des ressources et comprendrons comment cela influence la physiologie de l'organisme

2. Ingénierie dirigée de la morphologie : La modification de la morphologie cellulaire devrait améliorer la fitness ou la valeur selective de E. coli dans des environnements diversifiés. Nous manipulerons les composants cellulaires qui contrôlent la forme pour améliorer la croissance et la résistance aux inhibiteurs. La microscopie sera utilisée pour étudier comment ces changements affectent la fitness.

En conséquence, nous développerons un processus consolidé d'ingénierie métabolique tenant compte de l’hôte, combinant les objectifs ci-dessus pour rationaliser l'ingénierie des souches pour diverses applications. Le projet s'appuiera sur les connaissances de la biologie des systèmes et utilisera des techniques de pointe d'édition du génome pour créer et étudier des variants génomiques. En analysant ces variants, nous espérons obtenir des connaissances mécanistiques sur la manière dont des modifications spécifiques améliorent la fitness dans plusieurs conditions.

Le projet est financé par la subvention Action Thématique Incitative Génopole (ATIGE) , 2024.

Le CEA est un acteur engagé dans l’accueil l’insertion et le maintien dans l’emploi des salariés en situation de handicap.

Le CV ainsi que les coordonnées de deux référents doivent être envoyés avant le 30 octobre 2024 à: Mr Alaksh CHOUDHURY (alaksh.choudhury@genoscope.cns.fr) .


Profil recherché


Nous recherchons un candidat hautement motivé, titulaire d'un doctorat, avec une solide expérience en laboratoire dans les domaines suivants : biologie moléculaire, édition du génome, microscopie et analyse d'images.

Des connaissances en bioinformatique, programmation Python et analyse de données (séquençage de nouvelle génération) sont un atout.


Présentation de Cea


Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.

Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.

Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.

Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :

• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité


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