Emplois actuels liés à Post-Doctorant F/H Generation of connectivity models, application to population connectivity studies - Palaiseau - Inria
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Palaiseau, France Inria Temps pleinA propos du centre ou de la direction fonctionnelleLe centre de recherche Inria de Saclay a été créé en 2008. Sa dynamique s'inscrit dans le développement du plateau de Saclay, en partenariat étroit d'une part avec le pôle de l'Université Paris-Saclay et d'autre part avec le pôle de l'Institut Polytechnique de Paris . Afin de construire une...
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Postdoctoral Researcher F/H in Connectivity Model Generation
il y a 3 semaines
Palaiseau, Île-de-France Inria Temps pleinAbout the Research CenterThe Inria Saclay research center was established in 2008 and is a key player in the development of the Saclay plateau, closely collaborating with the University of Paris-Saclay and the Institut Polytechnique de Paris. In 2021, strategic agreements were signed with these two prominent partners to foster an ambitious site policy.The...
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Postdoctoral Researcher F/H in Connectivity Model Generation
il y a 3 semaines
Palaiseau, Île-de-France Inria Temps pleinAbout the Research CenterThe Inria Saclay research center was established in 2008 and plays a vital role in the development of the Saclay plateau, closely collaborating with the University of Paris-Saclay and the Institut Polytechnique de Paris. In 2021, strategic agreements were signed with these key partners to foster an ambitious site policy.The center...
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Doctorant F/H Foundation Models of human brain function
Il y a 3 mois
Palaiseau, France INRIA Temps pleinContexte et atouts du poste One of the major directions for future neuroscience is to build on the expertise accumulated in AI-powered cognitive systems, such as architectures that process language or visual content, but in the future will also include motor actions, planning and navigation. While both AI and neuroscience will benefit from comparing...
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Post-doctorant ou Post-doctorante en Génération
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Présentation de Télécom SudParis**: Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l’excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l’accent sur les projets d’équipes, l’innovation de...
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Post-doctorant ou Post-doctorante en Modèle
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Télécom SudParis Temps pleinPoursuivre nos travaux de recherche sur la définition d’un modèle d’attaque des CPS (Les systèmes cyber-physiques) qui soit indépendant du langage et basé sur les ontologies, combinant les graphes typés et attribués avec les graphes de connaissance pour l’explicabilité. - Implémenter un prototype de ce modèle utilisant le langage de...
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Palaiseau, France INRIA Temps pleinContexte et atouts du poste Inria is the French national institute for research in computer science, control, and applied mathematics promoting scientific excellence and technology transfer. The research topics of pour group are at the intersection of mathematical biology, statistics, control engineering, and statistical physics applied to problems in...
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Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps pleinPrésentation de Télécom SudParis :Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l'excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l'accent sur les projets d'équipes, l'innovation de rupture et...
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Palaiseau, Essonne, France Institut Mines-Télécom Temps pleinPrésentation de Télécom SudParis :Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l'excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l'accent sur les projets d'équipes,...
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Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps pleinPrésentation de Télécom SudParis :Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l'excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l'accent sur les projets d'équipes,...
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Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps pleinQui sommes-nous ?Télécom Paris, école de l’IMT (Institut Mines-Télécom) et membre fondateur de l’Institut Polytechnique de Paris, est une grande école du top 5 des écoles d’ingénieurs généralistes françaises.La Raison d’Être de Télécom Paris est de former, imaginer et entreprendre pour concevoir des modèles, des technologies et des...
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Post-doctorant ou Post-doctorante en Informatique
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Présentation de Télécom SudParis**: Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l’excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l’accent sur les projets d’équipes, l’innovation de...
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Post-doctorant en Physique des Plasmas
il y a 1 semaine
Palaiseau, Île-de-France CNRS Temps pleinInformations Générales Titre de l'Offre : Post-doctorant en Physique des Plasmas (H/F) Compétences Souhaitées Nous recherchons un post-doctorant pour rejoindre notre équipe de recherche et développement dans le domaine de la physique des plasmas. Le candidat idéal sera un physicien des plasmas expérimenté avec une solide formation en physique...
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Palaiseau, France INRIA Temps pleinContexte et atouts du poste The ANR FITNESS project, part of the PEPR Network of the Future, funds this Ph.D. program. Mission confiée Context Intelligent Transport System is open to new applications and services (e.g., infotainment, video streaming, etc.) leveraging vehicle and consumer interaction opportunities. Among such opportunities is...
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Post-doctorante ou Post-doctorant en Intelligence
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Qui sommes-nous ?** Télécom Paris, école de l’IMT (Institut Mines-Télécom) et membre fondateur de l’Institut Polytechnique de Paris, est une grande école du top 5 des écoles d’ingénieurs généralistes françaises. La Raison d’Être de Télécom Paris est de former, imaginer et entreprendre pour concevoir des modèles, des technologies et...
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Post-doctorant ou Post-doctorante en Commande
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Présentation de Télécom SudParis**: Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l’excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l’accent sur les projets d’équipes, l’innovation de...
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Post-doctorant ou Post-doctorante en Informatique
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Présentation de Télécom SudParis**: Télécom SudParis est une grande école publique d'ingénieurs reconnue au meilleur niveau des sciences et technologies du numérique. La qualité de ses formations est basée sur l’excellence scientifique de son corps professoral et une pédagogie mettant l’accent sur les projets d’équipes, l’innovation de...
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Post-doctorante ou Post-doctorant en Imagerie
Il y a 3 mois
Palaiseau, France Institut Mines-Télécom Temps plein**Qui sommes-nous ?** Télécom Paris, école de l’IMT (Institut Mines-Télécom) et membre fondateur de l’Institut Polytechnique de Paris, est une grande école du top 5 des écoles d’ingénieurs généralistes françaises. La **Raison d’Être** de Télécom Paris est de former, imaginer et entreprendre pour concevoir des modèles, des...
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Palaiseau, France CEA Temps pleinPosition description Category Electronics components and equipments Contract Fixed-term contract Job title Post-doc application of formal methods for interferences management H/F Socio-professional category Executive Contract duration (months) 18 Job description Within a multidisciplinary technological research...
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Post-doc Application of Formal Methods for Interference Management
Il y a 29 minutes
Palaiseau, Île-de-France CEA Temps pleinJob DescriptionWe are seeking a highly skilled Post-doc researcher to join our multidisciplinary technological research team at CEA LIST. The successful candidate will be involved in a national research project focused on developing an environment to identify, analyze, and reduce interferences generated by concurrent applications on a heterogeneous...
Post-Doctorant F/H Generation of connectivity models, application to population connectivity studies
il y a 1 mois
Le centre de recherche Inria de Saclay a été créé en 2008. Sa dynamique s'inscrit dans le développement du plateau de Saclay, en partenariat étroit d'une part avec le pôle de l'Université Paris-Saclay et d'autre part avec le pôle de l'Institut Polytechnique de Paris . Afin de construire une politique de site ambitieuse, le centre Inria de Saclay a signé en 2021 des accords stratégiques avec ces deux partenaires territoriaux privilégiés.
Le centre compte 40 équipes-projets , dont 32 sont communes avec l'Université Paris-Saclay ou l'Institut Polytechnique de Paris. Son action mobilise plus de 600 personnes, scientifiques et personnels d'appui à la recherche et à l'innovation, issues de 54 nationalités.
Le centre Inria Saclay - Île-de-France est un acteur essentiel de la recherche en sciences du numérique sur le plateau de Saclay. Il porte les valeurs et les projets qui font l'originalité d'Inria dans le paysage de la recherche : l'excellence scientifique, le transfert technologique, les partenariats pluridisciplinaires avec des établissements aux compétences complémentaires aux nôtres, afin de maximiser l'impact scientifique, économique et sociétal d'Inria.
Contexte et atouts du poste
Dans le cadre d'un partenariat projet PEPR Brein Health Trajectories
The main goal of this project is thus to develop a generative approach for covariance models that is consistent with the Riemannian framework for connectivity modeling in fMRI [8]. We will learn to generate such samples from large populations and to fine-tune models for smaller populations. We will then assess the quality of the generated samples using a variety of metrics (authenticity, coverage, recall, GAN-train, GAN-test). Finally, we will evaluate the utility of the generative approach on longitudinal and cross-sectional connectivity-based diagnostic problems.
Des déplacements réguliers sont prévus pour ce poste ? Non
Mission confiée
Technical developments The candidate will implement different generative models for covariance matri-
ces that are used in functional connectivity analysis.
• The so-called R-CNN network embedded in the score-based generative modeling can learn real images
at the pixel level, resulting in highly realistic covariance matrices [9].• Graph neural networks can generate good representations of node relationships. Whether the generated
covariance matrices appear realistic is still an open question.
• A well-known approach called stable diffusion [10] maps data to latent space via an encoder and then
uses a diffusion model. For specific neuroimaging tasks, many details need to be explored. This can be
combined with Riemannian score-based generative modeling [11, 12] for further experimentation.
The generative model has to be a conditional one: it should be tuned to some input information: age, sex
and characteristics of the target population, such as a disease status.
In a second step, the candidate will then systematically evaluate the quality of the generated connectivity
models using qualitative evaluation and the metrics described in [13] to assess the coverage (i.e. do the
generated covariance matrices cover the entire distribution of the observed covariance matrices ?), recall (i.e.
are all the generated samples close enough to the input distribution ?), and fidelity (i.e. are the generated
samples distinct enough from the input samples ?).
Validation on brain imaging datasets We will train the generative model on the large-scale UKBiobank
time series [14] (40k samples). The validation will consist of i) assessing whether the effects of some covariates
or treatments (age, disease, education) can be captured and reproduced by the generated data, for example
when creating explicit counterfactuals ii) assessing the utility of the data generation in downstream prediction
tasks.
When the quality is good enough, we will apply it to augment datasets from other cohorts with similar
population profiles (CamCAN [15, 16], 1000 brains[17]).
In particular, we will study the adaptation of the generators to the specific settings of new cohorts. To
handle potential covariate shifts, we will consider Riemannian approaches [18, 8] as well as optimal transport
techniques [5].
Principales activités
The project will produce experimental code in Python, available as an open source project, for the sake of
scientific reproducibility. Care will be taken to have good compatibility with existing frameworks such as
Nilearn.
The best parts of the code could be incorporated into Nilearn or Geomstats.
The experiments will be carried out using data available on MIND servers, that are protected.
Compétences
Compétences techniques et niveau requis : Expertise in Python, expertise in deep learning, expertise in brain imaging.
Langues : English
Compétences relationnelles : Team work
Compétences additionnelles appréciées : -
Avantages
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale
Rémunération
According to profile
