Contrat Doctoral

il y a 1 mois


Montpellier, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : lundi 23 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Contrat doctoral (H/F) - Reconstruction de l'histoire démographique récente à partir des co-ascendances génomiques**
Référence : UMR5554-PIEGAG-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 2 décembre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 17 février 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : La rémunération est de 2135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

**Description du sujet de thèse**:

- Le projet de thèse s’insère dans le projet ANR DEMOMAR qui vise à améliorer les inférences démographiques récentes pour la conservation d’espèces marines à l'aide des segments génomiques d'ascendance partagée.

De nombreuses populations de poissons marins sont actuellement en danger, alors que des populations humaines en dépendent. Les mesures de conservation actuelles (évaluation des stocks, régulation des pêches et aires marines protégées) ne suffisent pas toujours à empêcher le déclin des stocks en raison du manque de données démographiques qui restent des quantités difficiles à estimer. Le projet DEMOMAR a pour objectif de développer des méthodes d’identification et de datation des segments génomiques identiques-par-descendance afin de mieux documenter les changements récents induits par l’homme sur la taille des populations, la structure d’apparentement et la dispersion.

Les questions posées dans ce projet de thèse en lien avec le projet DEMOMAR touchent à la dimension temporelle de l’histoire démographique récente des populations:
Comment la variance du succès reproductif entre individus affecte-t-elle la distribution des segments IBD au sein des populations naturelles ? Comment la mortalité sélective exercée par la pêche affecte-t-elle cette distribution ? Est-il possible d’utiliser ce signal pour évaluer rétrospectivement l'impact démographique de la pêche lorsque les données de capture ne sont pas disponibles ? Comment détecter et quantifier empiriquement le signal généalogique d’un rétablissement post-effondrement à partir de la distribution des segments IBD ? Dans quelle mesure le rétablissement démographique dépend-il de la contribution d'individus très féconds à la croissance de la population ? Comment le potentiel de rétablissement d'une espèce est-il affecté par la troncature des distributions de taille et d'âge causée par l'exploitation ?

Le doctorant aura pour mission de répondre à ces questions en développant des prédictions théoriques à partir de simulations basées sur des modèles démo-génétiques, puis il testera ces prédictions à l’aide de deux cas d’études empiriques de poissons d’Atlantique et de Méditerranée : le bar européen et le thon rouge, pour lesquels des données de séquençage génomique seront générées par haplotagging.

Activités
- Participation à l’échantillonnage
- Responsable de la base de données des deux espèces étudiées
- Modélisation à l’aide de simulations démo-génétiques (MSprime, SLiM)
- Analyses bioinformatiques des données génomiques générées par haplotagging
- Analyses de génomique des populations (pedigrée populationnel, ARG)
- Rédaction d’articles scientifiques

Compétences
- Modélisation de données génétiques par simulations
- Génomique des populations
- Connaissances de base en bioinformatique (bash, python, R)
- Permis de conduire apprécié
- Anglais

Niveau académique, parlé et écrit**Contexte de travail**:
Au sein de l'équipe BEM, le doctorant sera sous la responsabilité de P.A. Gagnaire (DR CNRS). Un co-encadrement sera assuré par Sylvie Lapègue (DR Ifremer) et Bruno Ernande (DR Ifremer) de l’unité MARBEC. Le doctorant pourra interagir avec les autres membres de l'équipe BEM et de l’équipe de MARBEC impliqués directement ou indirectement dans le projet.

**Contraintes et risques**:
Travail en présentiel et activités de terrain aquatique.



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    **DIRECTION DES RESSOURCES** **HUMAINES** **L’Université de Montpellier recrute un Gestionnaire administratif** **(F/H)** **Une université d’excellence** Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai....

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    il y a 3 semaines


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  • Post-doctoral Fellowship

    Il y a 4 mois


    Montpellier, France CNRS Temps plein

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    Il y a 3 mois


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 25 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur en chimie : Post-doctoral position (H/F)** Référence : UMR5247-FLOCAV-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de...

  • Chercheur Post-doctoral

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    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : samedi 28 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral (H/F) : Holographie numérique pour découvrir la physique de la formation de biofilms bactériens** Référence :...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 23 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep Pep** Référence : UMR5149-NATCOL-019 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 25 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC** Référence : UMR5149-NATCOL-020 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...

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  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental Description et attendus pédagogiques: Cette formation doit permettre aux doctorants de mieux savoir argumenter, débattre et défendre ses positions dans le contexte de la...


  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental à intermédiaire. Description et attendus pédagogiques: * Permettre aux doctorants d’identifier leurs forces afin de développer leur potentiel de management d’une...


  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental à intermédiaire. Description et attendus pédagogiques: * Permettre aux doctorants d’adapter le type de management à l’activité mais également de choisir une méthode...

  • Freelance Teacher

    il y a 1 semaine


    Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental **Description et attendus pédagogiques**: * Acquérir une aisance à l'oral dans les différentes situations professionnelles * Intéresser le public lors de vos prises de...


  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental **Description et attendus pédagogiques**: - Lire de façon efficace afin de traiter l'information tout en la mémorisant - Organiser et structurer l'information captée et...


  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. - Cours : Talking about science - the basics of scientific mediation* **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental à intermédiaire. Description et attendus pédagogiques: * Comment rendre un sujet scientifique complexe...


  • Montpellier, France Pythagore Education Temps plein

    Formations à destination du public du Collège Doctoral de l'Université de Montpellier. **Cette formation doit être dispensée en anglais.** **Niveau** : fondamental à intermédiaire. Description et attendus pédagogiques: - Donner les repères théoriques fondamentaux du management. - Comprendre les enjeux du management actuel : le sens du...