Biologiste en Analyse de Données

Il y a 3 mois

Écully, France CNRS Temps plein

Date Limite Candidature : mardi 1 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Biologiste en analyse de données H/F**
Référence : UMR5005-FLODES-021
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : ECULLY
Date de publication : mardi 10 septembre 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 9 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : à partir de 2875 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

**Missions**:
Réaliser le traitement et l'analyse de données de séquençage

**Activités**:

- Réaliser le traitement et l’analyse des données de séquençage en 16S du

microbiote de la peau des souris
- Exploiter et mettre en forme les résultats des données traitées
- Diffuser les résultats lors des réunions de l’équipe projet et/ou auprès de l’ANSES
- Assurer une veille scientifique et technologique
- Valoriser les résultats par la participation à la rédaction d’articles dans des revues

du domaine scientifique
- **Compétences**:

- Connaissances approfondies en bioinformatique avec expérience préalable dans l’analyse de données de séquençage Illumina® -16S (Miseq). Connaissance de DADA2 package, vegan R package appréciée
- Maitrise des analyses statistiques (uni-multivariées) sous R ou logiciels équivalents (Python)
- Maîtrise de langage de programmation (Script Shell linux, bash )
- Connaissances théoriques en génomique microbienne environnementale (bases de données RefSeq, Greengenes )
- Aptitudes à la rédaction d’articles scientifiques
- Maitrise des logiciels du Pack Office
- Niveau avancé en anglais scientifique écrit et oral (Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues : B2-C1).
- Goût et volonté de s’impliquer et d’interagir avec l’équipe et dans le projet
- Rigueur scientifique et aptitudes organisationnelles seront appréciées
- Autonomie et dynamisme dans le travail.

**Contexte de travail**:

- INSA de Lyon, Université Lyon I), comprenant 212 membres dont la moitié de doctorant.es répartis dans 3
départements scientifiques : en Energie Electrique, Automatique des Systèmes et Bioingénierie. Le département Bioingénierie (40 personnes) s’articule suivant deux grands axes de recherche, l’un pour l’exploration des communautés bactériennes en relation avec leur environnement et l’autre utilisant les sciences de l’ingénieur comme l’électrochimie, les microsystèmes et l’électromagnétisme pour
développer de nouveaux outils au service de la santé et de l’environnement. L’équipe de Génomique Microbienne Environnementale (GME) du département Bioingénierie étudie les réponses des communautés microbiennes aux perturbations environnementales par une approche multi-échelles à
l’interface de la microbiologie, de la biochimie, de la génétique, de la biologie moléculaire et surtout de la métagénomique. L’équipe possède une plateforme expérimentale de 200 m2 notamment dédiée à l’activité de séquençage haut débit (Miseq, Illumina® et MinION, Oxford Nanopore).
Le projet « 5G-Sens-Skin », pour lequel le laboratoire recrute un.e IR, fait partie des 12 projets financés par l’Anses (2023-2026) sur le thème « Radiofréquences et Santé » et s’inscrit dans la combinaison de l’interdisciplinarité des expertises du laboratoire Ampère et de l’équipe SKIN (SKin functional INtegrity) du LBTI (UMR CNRS 5305-Université Lyon I) impliqués dans cette étude.
Dans le contexte du déploiement de la 5G, ce projet d’actualité avec un fort impact sociétal et de santé publique, évalue, in vivo et in vitro, les effets de ces radiofréquences sur la fonction barrière et sur les communautés bactériennes de la peau.
Titulaire d’un master, vous serez recruté.e en tant qu’Ingénieur.e de Recherche sur le projet pour vos compétences et votre expérience en bioinformatique. Vous effectuerez l’analyse génomique des communautés bactériennes présentes sur la peau des souris exposées ou non aux radiofréquences de la 5G, à partir des données brutes issues du séquençage, effectué au sein de la plateforme
Bioingénierie du laboratoire Ampère, sur le site de l’Ecole Centrale de Lyon, de ce microbiote encore peu étudié dans la littérature. Vous travaillerez en interaction directe avec l’Ingénieure de Recherche responsable de la coordination de cette tâche du projet « 5G-Sens-Skin », et avec les chercheurs du consortium. Vous bénéficierez du contexte d’excellence scientifique dans le domaine, de l’équipe de
GME du département Bioingénierie du laboratoire Ampère, et des infrastructures du campus de l’Ecole Centrale de Lyon.

Le post

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    Marcy-l'Étoile (69), France bioMérieux SA Temps plein

    **Stage BAC+5 - Analyse de données et bio-informatique - F/H/D**: Localisation: Marcy l'Etoile, France Type de Contrat: Stage Fonction: Bioscience R&D Acteur mondial dans le domaine du diagnostic _in vitro _depuis plus de 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour...

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    Description du poste Situé à Ecully (Institut Rhônalpin), notre centre d’AMP de la clinique du Val d’Ouest réalise annuellement 1100 ponctions, 600 IIU et 800 TEC. Le laboratoire est accrédité en biologie de la reproduction depuis 2018 et le centre est certifié ISO 9001 depuis 2008. Le laboratoire fait partie du groupe Eurofins Fertilité...

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    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:21000**Maximum annual compensation **:23000**Contribuez à notre développement** Rejoignez notre équipe du Centre d’Excellence Propriété Industrielle du Groupe SEB, en stage pour 6 mois, à partir de janvier 2025 et sur notre campus à Ecully, près de Lyon. Dans le cadre de la réorganisation de la Division...

  • Seed Production Research Agronomist

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    Fournisseur majeur de solutions pour l'agriculture, la Division Agro de BASF France a pour ambition d'accompagner les agriculteurs dans la transition agroécologique au travers d'un portefeuille de solutions faites de produits modernes de protection des cultures, de biocontrôle, d'outils digitaux, d'aide décisionnaire, de semences et d'expertises...

  • Assistant(E) Achats

    Il y a 4 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation (individual bonuses included) **:30000**Maximum annual compensation (individual bonuses included) **:40000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb,...

  • Stage - ContrÔle de Gestion Dtc (F/H)

    il y a 1 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:21000**Maximum annual compensation **:23000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb, Rowenta, Moulinex, Calor, Lagostina, Krups, WMF. Présent dans...

  • Responsable Csp Fournisseurs

    il y a 4 semaines

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:76000**Maximum annual compensation **:95000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb, Rowenta, Moulinex, Calor, Lagostina, Krups, All Clad, WMF,...

  • Expert Fonctionnel Finance

    il y a 1 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:50000**Maximum annual compensation **:60000**Rejoignez nos équipes de la DSI**: - **Leur mission ?** Délivrer de la valeur ajoutée à leurs clients internes et externes en s'appuyant sur des méthodes agiles. - **Comment ?** Par la protection des données, la continuité du business, le développement d’une expérience...

  • Controleur de Gestion Cspa

    Il y a 3 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation (individual bonuses included) **:40000**Maximum annual compensation (individual bonuses included) **:50000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb,...

  • Research Engineer in Experimental Behavioral

    Il y a 2 mois

    Écully (69), France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 31 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Ingénieur-e de recherche en production, traitement et analyse de données (H/F)** Référence : UMR5824-TAIDAO-027 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail...

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  • Expert Fonctionnel Finance

    il y a 4 semaines

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:50000**Maximum annual compensation **:60000- Proche de vous partout dans le Monde- Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb, Rowenta, Moulinex, Calor, Lagostina, Krups, All Clad, WMF, Emsa...

  • Stage - Assistant(E) Coordinateur(Rice) Supply

    il y a 1 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:21000**Maximum annual compensation **:23000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb, Rowenta, Moulinex, Calor, Lagostina, Krups, WMF. Présent dans...

  • Gestionnaire Administratif Et Financier

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    Écully (69), France Centrale Innovation Temps plein

    **Département de rattachement**: Département Mathématiques et Informatique - Laboratoire LIRIS. Ecole Centrale de Lyon, campus d’Ecully, 36 avenue Guy de Collongue, 69130 Ecully. **Descriptif du poste****: Le poste à pourvoir est rattaché au département MI. L’activité s’exerce au sein du laboratoire LIRIS UMR 5205, à temps partiel. CDD d'un...

  • Cloud Engineer

    Il y a 2 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:45000**Maximum annual compensation **:55000**Rejoignez nos équipes de la DSI**: - **Leur mission ?** Délivrer de la valeur ajoutée à leurs clients internes et externes en s'appuyant sur des méthodes agiles. - **Comment ?** Par la protection des données, la continuité du business, le développement d’une expérience...

  • Stage 6 Mois

    Il y a 2 mois

    Écully (69), France seqens Temps plein

    **Famille / Sous-famille d'emploi**: Quality & Regulatory - Validation **Type de contrat**: Stagiaire - Rémunéré **Intitulé du poste**: Stage 6 mois - Expert Assurance Qualité Validation et optimisation (Lean) des procédés de nettoyage H/F **Contexte du poste**: - Adhérant à Engagement Jeunes et labellisé « Employeur de choix » depuis 2021,...

  • Stage - Charge de Projets RH (F/H)

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    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation (individual bonuses included) **:25000**Maximum annual compensation (individual bonuses included) **:25000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb,...

  • Incidents and Problems Manager

    Il y a 2 mois

    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:50000**Maximum annual compensation **:60000**Proche de vous partout dans le Monde** - Le Groupe SEB est la référence mondiale du petit équipement domestique et du café professionnel grâce à son portefeuille de 35 marques emblématiques telles que Tefal, Seb, Rowenta, Moulinex, Calor, Lagostina,Krups,All Clad, WMF, Emsa...

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    Écully (69), France Groupe Seb Temps plein

    **Minimum annual compensation **:50000**Maximum annual compensation **:60000**Rejoignez nos équipes de la DSI**: - Leur mission ? Délivrer de la valeur ajoutée à leurs clients internes et externes en s'appuyant sur des méthodes agiles - Comment ? Par la protection des données, la continuité du business, le développement d’une expérience digitale...