Thèse Sur La Régulation Génique Et

Il y a 4 mois


Paris e, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : lundi 30 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Thèse sur la régulation génique et l'organisation 3D des chromosomes (H/F)**
Référence : UMR3664-ANTCOU-006
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : lundi 9 septembre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 4 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes

**Description du sujet de thèse**:

- === Contexte ===

L'équipe de recherche “Dynamique Spatio-temporelle des fonctions génomiques”, à l'Institut Curie et dirigée par Antoine Coulon, étudie l'organisation physique, la dynamique et la mécanique des chromosomes dans le noyau mammifère, ainsi que leur relation avec les fonctions biologiques du génome. Nous prenons une approche quantitative à l'interface physique-biologie, en combinant des approches de microscopie, de micro-manipulation mécanique et de modélisation physique.

Nous avons récemment développé une nouvelle technologie permettant de micro-manipuler les chromosomes dans des cellules vivantes en exerçant une force sur un locus génomique [Keizer et al. (2022) Science, 377:6605].

En collaboration avec Kyra Borgman, à l'initiative Single Cell de l'Institut Curie, notre équipe co-développe des approches d'imagerie FISH séquentiels, permettant le profilage de cellules uniques par des approches de microscopie.

=== Objectif ===

Ces travaux de thèse, co-encadrés par Antoine Coulon et Kyra Borgman, consisteront à combiner cette technologies de manipulation 3D de chromosomes avec de approches de profilage "omiques" de cellules uniques (transcriptomique, épigénomique, imagerie 3D de chromosomes) afin d'élucider les relations structure-fonction dans l'organisation et l'expression du génome.

=== Activités ===
- Culture cellulaire
- Expérience de manipulation de chromosome et imagerie sur cellules vivantes
- Préparation d'échantillons pour des expériences d'imagerie FISH
- Imagerie FISH séquentiel avec outils commerciaux et/ou à-façon
- Profilage de cellules uniques par des approches basées sur le séquençage
- Analyse d'image, analyse quantitative de données 'omics'
- Travail avec les autres membres de l'équipe

=== Compétences attendues ===
- Master scientifique en Biologie ou Biotechnologie
- Fort intérêt pour l'organisation du génome, la régulation des gènes, la biologie des chromosomes et les approches quantitatives
- Expérience avec des approches de profilage de cellules uniques
- Anglais scientifique

**Contexte de travail**:
L'équipe d'Antoine Coulon est co-affiliée à une unité de recherche en biologie (Dynamique du Noyau, UMR3664) et une unité de recherche en physique (Physique des Cellules et Cancer, UMR168) à l'Institut Curie. Kyra Borgman fait partie de l'Initiative Single-Cell de l'Institut Curie.

**Contraintes et risques**:
Les travaux de thèse s'effectueront au sein de l'unité UMR3664 et l'Intiative Single-Cell, toutes deux sur le campus principal de l'Institut Curie (Paris, 5ème arrondissement).


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